MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017305	TGA	2	6	1098155	1098160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510885
18002	NC_017305	TCA	3	9	1098245	1098253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510885
18003	NC_017305	AG	3	6	1098550	1098555	50 %	0 %	50 %	0 %	384510886
18004	NC_017305	GTT	2	6	1098559	1098564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510886
18005	NC_017305	CCA	2	6	1098670	1098675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510886
18006	NC_017305	ATA	2	6	1098721	1098726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510886
18007	NC_017305	CT	3	6	1098875	1098880	0 %	50 %	0 %	50 %	384510887
18008	NC_017305	GTAA	2	8	1098895	1098902	50 %	25 %	25 %	0 %	384510887
18009	NC_017305	GAA	2	6	1098991	1098996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510887
18010	NC_017305	GTT	2	6	1099093	1099098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510887
18011	NC_017305	TCT	2	6	1099105	1099110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510887
18012	NC_017305	GAA	2	6	1099117	1099122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510887
18013	NC_017305	GC	3	6	1099186	1099191	0 %	0 %	50 %	50 %	384510887
18014	NC_017305	GTT	2	6	1099194	1099199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510887
18015	NC_017305	TCT	2	6	1099262	1099267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510887
18016	NC_017305	CTG	2	6	1099328	1099333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510887
18017	NC_017305	TGT	2	6	1099416	1099421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510887
18018	NC_017305	AGAC	2	8	1099508	1099515	50 %	0 %	25 %	25 %	384510887
18019	NC_017305	AAC	2	6	1099521	1099526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510887
18020	NC_017305	T	7	7	1099561	1099567	0 %	100 %	0 %	0 %	384510887
18021	NC_017305	GTT	2	6	1099641	1099646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510888
18022	NC_017305	TCT	2	6	1099691	1099696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510888
18023	NC_017305	GCAGC	2	10	1099697	1099706	20 %	0 %	40 %	40 %	384510888
18024	NC_017305	TAC	2	6	1099756	1099761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510888
18025	NC_017305	CTGC	2	8	1099816	1099823	0 %	25 %	25 %	50 %	384510888
18026	NC_017305	T	6	6	1099840	1099845	0 %	100 %	0 %	0 %	384510888
18027	NC_017305	GCGTCC	2	12	1099849	1099860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384510888
18028	NC_017305	CTC	2	6	1100175	1100180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510889
18029	NC_017305	CCA	2	6	1100330	1100335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510889
18030	NC_017305	CGCA	2	8	1100336	1100343	25 %	0 %	25 %	50 %	384510889
18031	NC_017305	CGT	2	6	1100363	1100368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510889
18032	NC_017305	AGA	2	6	1100395	1100400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510889
18033	NC_017305	GCC	2	6	1100424	1100429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510889
18034	NC_017305	TGC	2	6	1100434	1100439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510889
18035	NC_017305	CAG	2	6	1100456	1100461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510889
18036	NC_017305	GAA	2	6	1100462	1100467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510889
18037	NC_017305	GCA	2	6	1100471	1100476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510889
18038	NC_017305	GCG	2	6	1100599	1100604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510890
18039	NC_017305	GCT	2	6	1100651	1100656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510890
18040	NC_017305	GGT	2	6	1100663	1100668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510890
18041	NC_017305	GAG	2	6	1100691	1100696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510890
18042	NC_017305	GCCAT	2	10	1100798	1100807	20 %	20 %	20 %	40 %	384510890
18043	NC_017305	TCG	2	6	1100842	1100847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510890
18044	NC_017305	GA	3	6	1100905	1100910	50 %	0 %	50 %	0 %	384510890
18045	NC_017305	ACT	2	6	1100983	1100988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510890
18046	NC_017305	GCC	2	6	1100991	1100996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510890
18047	NC_017305	AGC	2	6	1101049	1101054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510890
18048	NC_017305	CA	3	6	1101098	1101103	50 %	0 %	0 %	50 %	384510890
18049	NC_017305	GCT	2	6	1101223	1101228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510890
18050	NC_017305	TGT	2	6	1101248	1101253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510890
18051	NC_017305	TGA	2	6	1101305	1101310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510890
18052	NC_017305	GTT	2	6	1101421	1101426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510891
18053	NC_017305	CTG	2	6	1101454	1101459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510891
18054	NC_017305	TGCTTT	2	12	1101461	1101472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384510891
18055	NC_017305	A	6	6	1101474	1101479	100 %	0 %	0 %	0 %	384510891
18056	NC_017305	GT	3	6	1101578	1101583	0 %	50 %	50 %	0 %	384510891
18057	NC_017305	TGA	2	6	1101641	1101646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510891
18058	NC_017305	TGC	2	6	1101666	1101671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510891
18059	NC_017305	ACT	2	6	1101676	1101681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510891
18060	NC_017305	GTT	2	6	1101759	1101764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510891
18061	NC_017305	GC	3	6	1101785	1101790	0 %	0 %	50 %	50 %	384510891
18062	NC_017305	GGC	2	6	1101876	1101881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510891
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18066	NC_017305	TC	3	6	1101964	1101969	0 %	50 %	0 %	50 %	384510891
18067	NC_017305	CTT	2	6	1102002	1102007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510891
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18072	NC_017305	TAGC	2	8	1102241	1102248	25 %	25 %	25 %	25 %	384510891
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18082	NC_017305	TAAA	2	8	1102762	1102769	75 %	25 %	0 %	0 %	384510891
18083	NC_017305	TTTG	2	8	1102788	1102795	0 %	75 %	25 %	0 %	384510891
18084	NC_017305	TTTC	2	8	1102805	1102812	0 %	75 %	0 %	25 %	384510891
18085	NC_017305	A	6	6	1102860	1102865	100 %	0 %	0 %	0 %	384510891
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18100	NC_017305	T	6	6	1104261	1104266	0 %	100 %	0 %	0 %	384510893
18101	NC_017305	AGC	2	6	1104290	1104295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18102	NC_017305	GC	3	6	1104294	1104299	0 %	0 %	50 %	50 %	384510893
18103	NC_017305	TCG	2	6	1104384	1104389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
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18114	NC_017305	TC	3	6	1105006	1105011	0 %	50 %	0 %	50 %	384510893
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18116	NC_017305	TTC	2	6	1105073	1105078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510893
18117	NC_017305	T	6	6	1105180	1105185	0 %	100 %	0 %	0 %	384510893
18118	NC_017305	TGC	2	6	1105367	1105372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18119	NC_017305	ATC	2	6	1105415	1105420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510893
18120	NC_017305	TCG	2	6	1105431	1105436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18121	NC_017305	CCAA	2	8	1105448	1105455	50 %	0 %	0 %	50 %	384510893
18122	NC_017305	TGC	2	6	1105472	1105477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18123	NC_017305	AGC	2	6	1105482	1105487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18124	NC_017305	TCG	2	6	1105551	1105556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
18125	NC_017305	G	6	6	1105607	1105612	0 %	0 %	100 %	0 %	384510893
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18132	NC_017305	CGT	2	6	1106176	1106181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510893
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18136	NC_017305	T	6	6	1106348	1106353	0 %	100 %	0 %	0 %	384510893
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18144	NC_017305	TATG	2	8	1106828	1106835	25 %	50 %	25 %	0 %	384510893
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18218	NC_017305	GCT	2	6	1111500	1111505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510897
18219	NC_017305	AGC	2	6	1111544	1111549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510897
18220	NC_017305	GGGT	2	8	1111638	1111645	0 %	25 %	75 %	0 %	384510897
18221	NC_017305	ACT	2	6	1111656	1111661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510897
18222	NC_017305	CCT	2	6	1111669	1111674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510897
18223	NC_017305	GCC	2	6	1111703	1111708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510897
18224	NC_017305	GCCA	2	8	1111783	1111790	25 %	0 %	25 %	50 %	384510897
18225	NC_017305	GC	3	6	1111848	1111853	0 %	0 %	50 %	50 %	384510898
18226	NC_017305	GT	3	6	1111870	1111875	0 %	50 %	50 %	0 %	384510898
18227	NC_017305	TCA	2	6	1111889	1111894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510898
18228	NC_017305	CGAC	2	8	1111937	1111944	25 %	0 %	25 %	50 %	384510898
18229	NC_017305	GA	3	6	1112000	1112005	50 %	0 %	50 %	0 %	384510898
18230	NC_017305	CAACGG	2	12	1112049	1112060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510898
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18233	NC_017305	TGC	2	6	1112260	1112265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510898
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18492	NC_017305	ATCA	2	8	1125888	1125895	50 %	25 %	0 %	25 %	384510910
18493	NC_017305	TTC	2	6	1125897	1125902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510910
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