MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017305	TCCT	2	8	328307	328314	0 %	50 %	0 %	50 %	384510189
5502	NC_017305	GGC	2	6	328338	328343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510189
5503	NC_017305	GTT	2	6	328377	328382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510189
5504	NC_017305	GT	3	6	328453	328458	0 %	50 %	50 %	0 %	384510189
5505	NC_017305	GAG	2	6	328473	328478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510189
5506	NC_017305	TC	3	6	328535	328540	0 %	50 %	0 %	50 %	384510189
5507	NC_017305	TCA	2	6	328574	328579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510189
5508	NC_017305	TGG	2	6	328595	328600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510189
5509	NC_017305	AAG	2	6	328738	328743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510189
5510	NC_017305	GGA	2	6	328785	328790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510189
5511	NC_017305	GAA	2	6	329171	329176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510190
5512	NC_017305	TCG	2	6	329181	329186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510190
5513	NC_017305	CGT	2	6	329277	329282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510190
5514	NC_017305	CTG	2	6	329325	329330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510190
5515	NC_017305	GCTG	2	8	329333	329340	0 %	25 %	50 %	25 %	384510190
5516	NC_017305	AAG	2	6	329344	329349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510190
5517	NC_017305	TGA	2	6	329366	329371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510190
5518	NC_017305	TCTCC	2	10	329372	329381	0 %	40 %	0 %	60 %	384510190
5519	NC_017305	TTA	2	6	329401	329406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510190
5520	NC_017305	GAA	2	6	329438	329443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510190
5521	NC_017305	AAC	2	6	329454	329459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510190
5522	NC_017305	ATGG	2	8	329487	329494	25 %	25 %	50 %	0 %	384510190
5523	NC_017305	GCGCT	2	10	329644	329653	0 %	20 %	40 %	40 %	384510190
5524	NC_017305	GAA	2	6	329660	329665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510190
5525	NC_017305	CT	3	6	329814	329819	0 %	50 %	0 %	50 %	384510191
5526	NC_017305	GCT	3	9	329859	329867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510191
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5528	NC_017305	GCT	2	6	329892	329897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510191
5529	NC_017305	GCT	3	9	329907	329915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510191
5530	NC_017305	GAAGA	2	10	329916	329925	60 %	0 %	40 %	0 %	384510191
5531	NC_017305	GTT	2	6	329937	329942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510191
5532	NC_017305	AAG	2	6	329961	329966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510191
5533	NC_017305	GGCCTG	2	12	330003	330014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384510191
5534	NC_017305	ATC	2	6	330054	330059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510191
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5537	NC_017305	GCT	2	6	330517	330522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510192
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5539	NC_017305	TTG	2	6	330536	330541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510192
5540	NC_017305	GGA	2	6	330576	330581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510192
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5542	NC_017305	TAT	2	6	330772	330777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510192
5543	NC_017305	GGT	2	6	330841	330846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510192
5544	NC_017305	GGC	2	6	330922	330927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510192
5545	NC_017305	TAA	2	6	330945	330950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510192
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5548	NC_017305	TG	3	6	331095	331100	0 %	50 %	50 %	0 %	384510192
5549	NC_017305	GAT	2	6	331186	331191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510192
5550	NC_017305	GAA	2	6	331194	331199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510192
5551	NC_017305	ATC	2	6	331203	331208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510192
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5553	NC_017305	CTT	2	6	331262	331267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510192
5554	NC_017305	CGG	2	6	331280	331285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510192
5555	NC_017305	TCCT	2	8	331323	331330	0 %	50 %	0 %	50 %	384510192
5556	NC_017305	CTG	2	6	331337	331342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510192
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5558	NC_017305	GGTG	2	8	331472	331479	0 %	25 %	75 %	0 %	384510193
5559	NC_017305	TCG	2	6	331507	331512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510193
5560	NC_017305	CGT	2	6	331568	331573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510193
5561	NC_017305	GC	3	6	331602	331607	0 %	0 %	50 %	50 %	384510193
5562	NC_017305	GA	3	6	331685	331690	50 %	0 %	50 %	0 %	384510193
5563	NC_017305	GCT	2	6	331733	331738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510193
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5574	NC_017305	A	7	7	332325	332331	100 %	0 %	0 %	0 %	384510193
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5587	NC_017305	TCG	2	6	333041	333046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510193
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5601	NC_017305	GC	3	6	334034	334039	0 %	0 %	50 %	50 %	384510194
5602	NC_017305	GAT	2	6	334086	334091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510194
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5605	NC_017305	ATG	2	6	334326	334331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510195
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5608	NC_017305	GGTT	2	8	334503	334510	0 %	50 %	50 %	0 %	384510195
5609	NC_017305	TGG	2	6	334561	334566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510195
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5613	NC_017305	GC	3	6	334639	334644	0 %	0 %	50 %	50 %	384510195
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5621	NC_017305	GCG	2	6	335248	335253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510196
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5744	NC_017305	GGA	2	6	341352	341357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510199
5745	NC_017305	TGG	2	6	341459	341464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510199
5746	NC_017305	CTG	2	6	341512	341517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510199
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5773	NC_017305	CTT	2	6	342711	342716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510200
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5775	NC_017305	CGA	2	6	342747	342752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510200
5776	NC_017305	TCG	2	6	342756	342761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510200
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5859	NC_017305	CCTGGG	2	12	347206	347217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384510201
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5984	NC_017305	CTG	2	6	354541	354546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510208
5985	NC_017305	GGC	2	6	354598	354603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510208
5986	NC_017305	TAA	2	6	354643	354648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510208
5987	NC_017305	CGA	2	6	354707	354712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510208
5988	NC_017305	GGC	2	6	354766	354771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510208
5989	NC_017305	AATG	2	8	354800	354807	50 %	25 %	25 %	0 %	384510208
5990	NC_017305	TGA	2	6	354814	354819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510208
5991	NC_017305	CTC	2	6	354863	354868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510208
5992	NC_017305	CTG	2	6	354992	354997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510208
5993	NC_017305	CGT	2	6	355003	355008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510208
5994	NC_017305	ATGT	2	8	355044	355051	25 %	50 %	25 %	0 %	384510208
5995	NC_017305	GGA	2	6	355130	355135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510208
5996	NC_017305	ACC	2	6	355210	355215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510208
5997	NC_017305	ATGG	2	8	355253	355260	25 %	25 %	50 %	0 %	384510208
5998	NC_017305	CCAG	2	8	355306	355313	25 %	0 %	25 %	50 %	384510208
5999	NC_017305	AAT	2	6	355363	355368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510208
6000	NC_017305	GTTGGC	2	12	355373	355384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384510208

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