MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017304	TCC	2	6	2485810	2485815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385779441
43003	NC_017304	TGT	2	6	2485824	2485829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385779441
43004	NC_017304	TCT	2	6	2485867	2485872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779441
43005	NC_017304	TGC	2	6	2486013	2486018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779441
43006	NC_017304	AGG	2	6	2486159	2486164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385779442
43007	NC_017304	TA	3	6	2486273	2486278	50 %	50 %	0 %	0 %	385779442
43008	NC_017304	GTT	2	6	2486360	2486365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385779442
43009	NC_017304	CTT	2	6	2486455	2486460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779442
43010	NC_017304	CTTTT	2	10	2486482	2486491	0 %	80 %	0 %	20 %	385779442
43011	NC_017304	GAT	2	6	2486575	2486580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779442
43012	NC_017304	T	6	6	2486584	2486589	0 %	100 %	0 %	0 %	385779442
43013	NC_017304	CTT	2	6	2486651	2486656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779442
43014	NC_017304	GTAT	2	8	2486677	2486684	25 %	50 %	25 %	0 %	385779442
43015	NC_017304	TAATAT	2	12	2486704	2486715	50 %	50 %	0 %	0 %	385779442
43016	NC_017304	TCA	2	6	2486728	2486733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779442
43017	NC_017304	T	8	8	2486772	2486779	0 %	100 %	0 %	0 %	385779442
43018	NC_017304	CTT	3	9	2486790	2486798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779442
43019	NC_017304	TGC	2	6	2486861	2486866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779442
43020	NC_017304	AAC	2	6	2486906	2486911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385779442
43021	NC_017304	GCA	2	6	2486934	2486939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385779442
43022	NC_017304	CAAA	2	8	2486950	2486957	75 %	0 %	0 %	25 %	385779442
43023	NC_017304	CTG	3	9	2486958	2486966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779442
43024	NC_017304	AAT	2	6	2487309	2487314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385779443
43025	NC_017304	ATC	2	6	2487571	2487576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779443
43026	NC_017304	T	6	6	2487610	2487615	0 %	100 %	0 %	0 %	385779443
43027	NC_017304	CTT	2	6	2487646	2487651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779443
43028	NC_017304	TCT	2	6	2487686	2487691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779443
43029	NC_017304	ACC	2	6	2487779	2487784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385779443
43030	NC_017304	CATC	2	8	2487801	2487808	25 %	25 %	0 %	50 %	385779443
43031	NC_017304	TCA	2	6	2487854	2487859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779443
43032	NC_017304	AGT	2	6	2487888	2487893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779443
43033	NC_017304	TA	3	6	2487920	2487925	50 %	50 %	0 %	0 %	385779443
43034	NC_017304	CGG	2	6	2488015	2488020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385779443
43035	NC_017304	GCC	2	6	2488238	2488243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385779443
43036	NC_017304	T	7	7	2488252	2488258	0 %	100 %	0 %	0 %	385779443
43037	NC_017304	T	6	6	2488294	2488299	0 %	100 %	0 %	0 %	385779443
43038	NC_017304	T	7	7	2488307	2488313	0 %	100 %	0 %	0 %	385779443
43039	NC_017304	TAT	2	6	2488321	2488326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385779443
43040	NC_017304	T	7	7	2488352	2488358	0 %	100 %	0 %	0 %	385779443
43041	NC_017304	TCC	2	6	2488388	2488393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385779443
43042	NC_017304	ATA	2	6	2488414	2488419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385779443
43043	NC_017304	TA	3	6	2488426	2488431	50 %	50 %	0 %	0 %	385779443
43044	NC_017304	CTTTCC	2	12	2488457	2488468	0 %	50 %	0 %	50 %	385779443
43045	NC_017304	TGT	2	6	2488482	2488487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385779443
43046	NC_017304	AATGTC	2	12	2488540	2488551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385779443
43047	NC_017304	TTTC	2	8	2488592	2488599	0 %	75 %	0 %	25 %	385779443
43048	NC_017304	AT	3	6	2488607	2488612	50 %	50 %	0 %	0 %	385779443
43049	NC_017304	TTC	2	6	2488674	2488679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779443
43050	NC_017304	CAA	2	6	2488707	2488712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385779443
43051	NC_017304	TA	5	10	2488770	2488779	50 %	50 %	0 %	0 %	385779443
43052	NC_017304	CATAT	2	10	2488789	2488798	40 %	40 %	0 %	20 %	385779443
43053	NC_017304	GAT	3	9	2488812	2488820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779443
43054	NC_017304	TCA	2	6	2488892	2488897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779443
43055	NC_017304	AGG	2	6	2488927	2488932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385779443
43056	NC_017304	GCC	2	6	2488940	2488945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385779443
43057	NC_017304	GAT	2	6	2488991	2488996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779443
43058	NC_017304	TCC	2	6	2489002	2489007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385779443
43059	NC_017304	T	6	6	2489105	2489110	0 %	100 %	0 %	0 %	385779444
43060	NC_017304	GAT	2	6	2489155	2489160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779444
43061	NC_017304	GTC	2	6	2489166	2489171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779444
43062	NC_017304	ATG	2	6	2489203	2489208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385779444
43063	NC_017304	TA	3	6	2489238	2489243	50 %	50 %	0 %	0 %	385779444
43064	NC_017304	GTTA	2	8	2489247	2489254	25 %	50 %	25 %	0 %	385779444
43065	NC_017304	TCA	2	6	2489302	2489307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779444
43066	NC_017304	CTT	2	6	2489346	2489351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779444
43067	NC_017304	CAG	2	6	2489372	2489377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385779444
43068	NC_017304	CAA	2	6	2489396	2489401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385779444
43069	NC_017304	CA	3	6	2489488	2489493	50 %	0 %	0 %	50 %	385779444
43070	NC_017304	T	7	7	2489514	2489520	0 %	100 %	0 %	0 %	385779444
43071	NC_017304	CA	4	8	2489528	2489535	50 %	0 %	0 %	50 %	385779444
43072	NC_017304	CA	3	6	2489747	2489752	50 %	0 %	0 %	50 %	385779444
43073	NC_017304	GAA	2	6	2489777	2489782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385779444
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43076	NC_017304	TGC	2	6	2489856	2489861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779444
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43082	NC_017304	TAC	2	6	2490189	2490194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779444
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43088	NC_017304	TA	3	6	2490590	2490595	50 %	50 %	0 %	0 %	385779445
43089	NC_017304	A	6	6	2490606	2490611	100 %	0 %	0 %	0 %	385779445
43090	NC_017304	CCA	2	6	2490613	2490618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385779445
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43101	NC_017304	AGA	2	6	2491219	2491224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385779445
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43104	NC_017304	TA	3	6	2491408	2491413	50 %	50 %	0 %	0 %	385779446
43105	NC_017304	AT	3	6	2491428	2491433	50 %	50 %	0 %	0 %	385779446
43106	NC_017304	TGC	2	6	2491572	2491577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385779446
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43234	NC_017304	TTTA	2	8	2500624	2500631	25 %	75 %	0 %	0 %	385779455
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43474	NC_017304	T	6	6	2514398	2514403	0 %	100 %	0 %	0 %	385779470
43475	NC_017304	TTC	2	6	2514492	2514497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385779470
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43477	NC_017304	TAC	2	6	2514577	2514582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385779470
43478	NC_017304	CCTTTA	2	12	2514587	2514598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385779470
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