MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_017304	GCCT	2	8	3221661	3221668	0 %	25 %	25 %	50 %	385780012
55002	NC_017304	TCCT	2	8	3221713	3221720	0 %	50 %	0 %	50 %	385780012
55003	NC_017304	AT	3	6	3221768	3221773	50 %	50 %	0 %	0 %	385780012
55004	NC_017304	GTT	2	6	3221792	3221797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385780012
55005	NC_017304	T	6	6	3222000	3222005	0 %	100 %	0 %	0 %	385780012
55006	NC_017304	AGA	2	6	3222024	3222029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385780012
55007	NC_017304	T	6	6	3222052	3222057	0 %	100 %	0 %	0 %	385780012
55008	NC_017304	TAA	2	6	3222076	3222081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780012
55009	NC_017304	TAT	2	6	3222133	3222138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385780012
55010	NC_017304	TTCT	2	8	3222181	3222188	0 %	75 %	0 %	25 %	385780012
55011	NC_017304	TCCAA	2	10	3222261	3222270	40 %	20 %	0 %	40 %	385780012
55012	NC_017304	T	6	6	3222378	3222383	0 %	100 %	0 %	0 %	385780012
55013	NC_017304	T	7	7	3222419	3222425	0 %	100 %	0 %	0 %	385780012
55014	NC_017304	TGTC	2	8	3222456	3222463	0 %	50 %	25 %	25 %	385780012
55015	NC_017304	CA	3	6	3222475	3222480	50 %	0 %	0 %	50 %	385780012
55016	NC_017304	GAT	2	6	3222508	3222513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780012
55017	NC_017304	ATT	2	6	3222539	3222544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385780012
55018	NC_017304	GAA	2	6	3222556	3222561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385780012
55019	NC_017304	CT	3	6	3222565	3222570	0 %	50 %	0 %	50 %	385780012
55020	NC_017304	CCA	2	6	3223439	3223444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385780013
55021	NC_017304	ATTC	2	8	3223550	3223557	25 %	50 %	0 %	25 %	385780013
55022	NC_017304	GAA	2	6	3223564	3223569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385780013
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55025	NC_017304	GT	3	6	3223673	3223678	0 %	50 %	50 %	0 %	385780013
55026	NC_017304	GGAC	2	8	3223699	3223706	25 %	0 %	50 %	25 %	385780013
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55028	NC_017304	ATCA	2	8	3224050	3224057	50 %	25 %	0 %	25 %	385780014
55029	NC_017304	CTT	2	6	3224130	3224135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385780014
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55031	NC_017304	TCTTTG	2	12	3224306	3224317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385780014
55032	NC_017304	TGC	2	6	3224325	3224330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385780014
55033	NC_017304	TTC	2	6	3224400	3224405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385780014
55034	NC_017304	CTT	2	6	3224418	3224423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385780014
55035	NC_017304	ATA	2	6	3224561	3224566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780014
55036	NC_017304	ATC	2	6	3224647	3224652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385780014
55037	NC_017304	AATA	2	8	3224701	3224708	75 %	25 %	0 %	0 %	385780014
55038	NC_017304	CTTT	2	8	3224744	3224751	0 %	75 %	0 %	25 %	385780014
55039	NC_017304	AAGG	2	8	3224775	3224782	50 %	0 %	50 %	0 %	385780014
55040	NC_017304	T	7	7	3224858	3224864	0 %	100 %	0 %	0 %	385780014
55041	NC_017304	TCC	2	6	3224903	3224908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385780014
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55043	NC_017304	GCC	2	6	3225083	3225088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385780014
55044	NC_017304	GACTT	2	10	3225149	3225158	20 %	40 %	20 %	20 %	385780014
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55046	NC_017304	TCCT	2	8	3225222	3225229	0 %	50 %	0 %	50 %	385780014
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55051	NC_017304	TTCC	2	8	3225591	3225598	0 %	50 %	0 %	50 %	385780014
55052	NC_017304	C	7	7	3225617	3225623	0 %	0 %	0 %	100 %	385780014
55053	NC_017304	CAC	2	6	3225727	3225732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385780014
55054	NC_017304	CTTC	2	8	3225881	3225888	0 %	50 %	0 %	50 %	385780014
55055	NC_017304	CTT	2	6	3225950	3225955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385780014
55056	NC_017304	AAT	2	6	3225961	3225966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385780014
55057	NC_017304	AC	3	6	3225998	3226003	50 %	0 %	0 %	50 %	385780014
55058	NC_017304	AACA	2	8	3226015	3226022	75 %	0 %	0 %	25 %	385780014
55059	NC_017304	AT	3	6	3226052	3226057	50 %	50 %	0 %	0 %	385780014
55060	NC_017304	TCC	2	6	3226064	3226069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385780014
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55063	NC_017304	CT	3	6	3226276	3226281	0 %	50 %	0 %	50 %	385780014
55064	NC_017304	T	6	6	3226365	3226370	0 %	100 %	0 %	0 %	385780014
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55068	NC_017304	GCAA	2	8	3226484	3226491	50 %	0 %	25 %	25 %	385780014
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55233	NC_017304	TCC	2	6	3237834	3237839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385780024
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55236	NC_017304	GTC	3	9	3238232	3238240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385780024
55237	NC_017304	CTG	2	6	3238308	3238313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385780024
55238	NC_017304	TCCG	2	8	3238382	3238389	0 %	25 %	25 %	50 %	385780024
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55243	NC_017304	AGCC	2	8	3238512	3238519	25 %	0 %	25 %	50 %	385780024
55244	NC_017304	ATG	2	6	3238578	3238583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385780024
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