MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_017300	AGA	2	6	2161254	2161259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505543
35002	NC_017300	CTCG	2	8	2161291	2161298	0 %	25 %	25 %	50 %	384505543
35003	NC_017300	GCAACA	2	12	2161347	2161358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384505543
35004	NC_017300	CCG	2	6	2161379	2161384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505543
35005	NC_017300	CAG	2	6	2161423	2161428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505543
35006	NC_017300	CAC	2	6	2161429	2161434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505543
35007	NC_017300	CGG	2	6	2161470	2161475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505543
35008	NC_017300	A	6	6	2161541	2161546	100 %	0 %	0 %	0 %	384505543
35009	NC_017300	GAT	2	6	2161597	2161602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505543
35010	NC_017300	CGG	2	6	2161680	2161685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505543
35011	NC_017300	GTA	2	6	2161705	2161710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505543
35012	NC_017300	CCA	2	6	2161752	2161757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505543
35013	NC_017300	TAA	2	6	2161794	2161799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505543
35014	NC_017300	CCA	2	6	2161820	2161825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505543
35015	NC_017300	CGCT	2	8	2161909	2161916	0 %	25 %	25 %	50 %	384505543
35016	NC_017300	GAC	2	6	2161925	2161930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505543
35017	NC_017300	GCC	2	6	2161931	2161936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505543
35018	NC_017300	CTG	2	6	2161938	2161943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505543
35019	NC_017300	ACC	2	6	2161974	2161979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505543
35020	NC_017300	GCCA	2	8	2161988	2161995	25 %	0 %	25 %	50 %	384505543
35021	NC_017300	TA	3	6	2162056	2162061	50 %	50 %	0 %	0 %	384505543
35022	NC_017300	AGGA	2	8	2162077	2162084	50 %	0 %	50 %	0 %	384505543
35023	NC_017300	CCCG	2	8	2162191	2162198	0 %	0 %	25 %	75 %	384505543
35024	NC_017300	CAA	2	6	2162208	2162213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505543
35025	NC_017300	CTCG	2	8	2162256	2162263	0 %	25 %	25 %	50 %	384505543
35026	NC_017300	CAT	2	6	2162328	2162333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505543
35027	NC_017300	GGT	2	6	2162404	2162409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505543
35028	NC_017300	GCC	2	6	2162721	2162726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505544
35029	NC_017300	CAC	2	6	2162729	2162734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505544
35030	NC_017300	CGAAG	2	10	2162888	2162897	40 %	0 %	40 %	20 %	384505544
35031	NC_017300	GCA	2	6	2163007	2163012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505544
35032	NC_017300	CCG	2	6	2163055	2163060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505544
35033	NC_017300	GCA	2	6	2163071	2163076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505544
35034	NC_017300	GGA	2	6	2163084	2163089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505544
35035	NC_017300	CTGG	2	8	2163110	2163117	0 %	25 %	50 %	25 %	384505544
35036	NC_017300	CCAA	2	8	2163123	2163130	50 %	0 %	0 %	50 %	384505544
35037	NC_017300	GCC	2	6	2163217	2163222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505544
35038	NC_017300	GCCAT	2	10	2163238	2163247	20 %	20 %	20 %	40 %	384505544
35039	NC_017300	CAT	2	6	2163332	2163337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505544
35040	NC_017300	AGAT	2	8	2163343	2163350	50 %	25 %	25 %	0 %	384505544
35041	NC_017300	TTC	2	6	2163463	2163468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505544
35042	NC_017300	ATC	2	6	2163496	2163501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505544
35043	NC_017300	TTC	2	6	2163514	2163519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505544
35044	NC_017300	GAC	2	6	2163524	2163529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505544
35045	NC_017300	CTT	2	6	2163531	2163536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505544
35046	NC_017300	TCC	2	6	2163541	2163546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505544
35047	NC_017300	GT	3	6	2163554	2163559	0 %	50 %	50 %	0 %	384505544
35048	NC_017300	ACTT	2	8	2163598	2163605	25 %	50 %	0 %	25 %	384505544
35049	NC_017300	CTT	2	6	2163609	2163614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505545
35050	NC_017300	TCA	3	9	2163710	2163718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505545
35051	NC_017300	AGC	2	6	2163730	2163735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505545
35052	NC_017300	AGC	2	6	2163774	2163779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505545
35053	NC_017300	TCA	2	6	2163850	2163855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505545
35054	NC_017300	AGC	2	6	2163897	2163902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505545
35055	NC_017300	CGT	2	6	2163943	2163948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505545
35056	NC_017300	GGC	2	6	2163975	2163980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505545
35057	NC_017300	GCGG	2	8	2164026	2164033	0 %	0 %	75 %	25 %	384505545
35058	NC_017300	GCA	2	6	2164163	2164168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505546
35059	NC_017300	CGC	2	6	2164176	2164181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505546
35060	NC_017300	GAC	2	6	2164218	2164223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505546
35061	NC_017300	CAG	2	6	2164290	2164295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505546
35062	NC_017300	GCCA	2	8	2164421	2164428	25 %	0 %	25 %	50 %	384505546
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35067	NC_017300	AGC	2	6	2164735	2164740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505546
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35072	NC_017300	CCA	2	6	2164957	2164962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505546
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35081	NC_017300	GCCG	2	8	2165290	2165297	0 %	0 %	50 %	50 %	384505546
35082	NC_017300	CCG	2	6	2165315	2165320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505546
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35088	NC_017300	CTG	2	6	2165532	2165537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505546
35089	NC_017300	CG	3	6	2165568	2165573	0 %	0 %	50 %	50 %	384505546
35090	NC_017300	ACCT	2	8	2165584	2165591	25 %	25 %	0 %	50 %	384505546
35091	NC_017300	GCCT	2	8	2165641	2165648	0 %	25 %	25 %	50 %	384505546
35092	NC_017300	GGT	2	6	2165656	2165661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505546
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35095	NC_017300	GC	3	6	2165773	2165778	0 %	0 %	50 %	50 %	384505546
35096	NC_017300	GCA	2	6	2165924	2165929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505546
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35098	NC_017300	GTGTT	2	10	2165969	2165978	0 %	60 %	40 %	0 %	384505546
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35100	NC_017300	TAG	2	6	2166063	2166068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505546
35101	NC_017300	AGT	2	6	2166394	2166399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505547
35102	NC_017300	CTTC	2	8	2166416	2166423	0 %	50 %	0 %	50 %	384505547
35103	NC_017300	CG	3	6	2166439	2166444	0 %	0 %	50 %	50 %	384505547
35104	NC_017300	AGA	2	6	2166522	2166527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505547
35105	NC_017300	AAG	2	6	2166654	2166659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505547
35106	NC_017300	TGTTT	2	10	2166682	2166691	0 %	80 %	20 %	0 %	384505547
35107	NC_017300	TGGG	2	8	2166818	2166825	0 %	25 %	75 %	0 %	384505547
35108	NC_017300	ACA	2	6	2166879	2166884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505547
35109	NC_017300	CGG	2	6	2166898	2166903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505547
35110	NC_017300	GGC	2	6	2166917	2166922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505547
35111	NC_017300	AGC	2	6	2166969	2166974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505547
35112	NC_017300	CCA	2	6	2167011	2167016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505547
35113	NC_017300	AAT	2	6	2167034	2167039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505547
35114	NC_017300	T	6	6	2167129	2167134	0 %	100 %	0 %	0 %	384505547
35115	NC_017300	ATG	2	6	2167151	2167156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505547
35116	NC_017300	GCG	2	6	2167195	2167200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505547
35117	NC_017300	CGG	2	6	2167215	2167220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505547
35118	NC_017300	AAC	2	6	2167253	2167258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505547
35119	NC_017300	CT	3	6	2167266	2167271	0 %	50 %	0 %	50 %	384505547
35120	NC_017300	TGA	2	6	2167357	2167362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505547
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35142	NC_017300	ACC	3	9	2168570	2168578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505549
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35144	NC_017300	ACA	2	6	2168677	2168682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505549
35145	NC_017300	GGA	2	6	2168697	2168702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505549
35146	NC_017300	ATT	2	6	2168736	2168741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505549
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35211	NC_017300	AATA	3	12	2173255	2173266	75 %	25 %	0 %	0 %	384505551
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35215	NC_017300	CAAAG	2	10	2173649	2173658	60 %	0 %	20 %	20 %	384505551
35216	NC_017300	AGC	2	6	2173674	2173679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505551
35217	NC_017300	TACC	2	8	2173741	2173748	25 %	25 %	0 %	50 %	384505551
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35219	NC_017300	CGG	2	6	2173853	2173858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505551
35220	NC_017300	AG	3	6	2173922	2173927	50 %	0 %	50 %	0 %	384505551
35221	NC_017300	ACT	2	6	2173956	2173961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505551
35222	NC_017300	ATC	2	6	2174016	2174021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505551
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35224	NC_017300	TCG	2	6	2174103	2174108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505551
35225	NC_017300	CAG	2	6	2174111	2174116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505551
35226	NC_017300	ATT	2	6	2174135	2174140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505551
35227	NC_017300	GCAGGC	2	12	2174191	2174202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384505551
35228	NC_017300	CCT	3	9	2174221	2174229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505551
35229	NC_017300	CGA	2	6	2174235	2174240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505551
35230	NC_017300	AGG	2	6	2174249	2174254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505551
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35232	NC_017300	CCA	2	6	2174739	2174744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505552
35233	NC_017300	TAA	2	6	2174832	2174837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505552
35234	NC_017300	GA	3	6	2174863	2174868	50 %	0 %	50 %	0 %	384505552
35235	NC_017300	CG	3	6	2174909	2174914	0 %	0 %	50 %	50 %	384505552
35236	NC_017300	TCA	2	6	2174977	2174982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505552
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35335	NC_017300	AGA	2	6	2181699	2181704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505558
35336	NC_017300	CA	4	8	2181969	2181976	50 %	0 %	0 %	50 %	384505558
35337	NC_017300	GGCC	2	8	2182026	2182033	0 %	0 %	50 %	50 %	384505558
35338	NC_017300	A	6	6	2182046	2182051	100 %	0 %	0 %	0 %	384505558
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35343	NC_017300	CGC	2	6	2182375	2182380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505559
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35459	NC_017300	TGC	2	6	2188028	2188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505565
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35461	NC_017300	ATG	2	6	2188118	2188123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505565
35462	NC_017300	CGT	2	6	2188164	2188169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505565
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35493	NC_017300	CGC	2	6	2189380	2189385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505566
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