MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_017300	ACC	2	6	1559741	1559746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505017
25502	NC_017300	ATAA	2	8	1559828	1559835	75 %	25 %	0 %	0 %	384505017
25503	NC_017300	CAA	2	6	1559885	1559890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505017
25504	NC_017300	AG	3	6	1559905	1559910	50 %	0 %	50 %	0 %	384505017
25505	NC_017300	TTA	2	6	1559952	1559957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505017
25506	NC_017300	CAG	3	9	1559974	1559982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505017
25507	NC_017300	ATT	2	6	1560002	1560007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505017
25508	NC_017300	TTG	2	6	1560024	1560029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505017
25509	NC_017300	ACG	2	6	1560037	1560042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25510	NC_017300	CAA	2	6	1560069	1560074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505018
25511	NC_017300	TCA	2	6	1560104	1560109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505018
25512	NC_017300	AATGC	2	10	1560168	1560177	40 %	20 %	20 %	20 %	384505018
25513	NC_017300	TGG	2	6	1560191	1560196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505018
25514	NC_017300	AG	3	6	1560231	1560236	50 %	0 %	50 %	0 %	384505018
25515	NC_017300	GTA	2	6	1560277	1560282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505018
25516	NC_017300	CAA	2	6	1560318	1560323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505018
25517	NC_017300	CGT	2	6	1560435	1560440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25518	NC_017300	GCA	3	9	1560479	1560487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25519	NC_017300	GGC	2	6	1560516	1560521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505018
25520	NC_017300	GTGCT	2	10	1560557	1560566	0 %	40 %	40 %	20 %	384505018
25521	NC_017300	CTT	2	6	1560676	1560681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505018
25522	NC_017300	TTC	2	6	1560689	1560694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505018
25523	NC_017300	ACC	2	6	1560700	1560705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505018
25524	NC_017300	AAT	2	6	1560715	1560720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505018
25525	NC_017300	ACC	2	6	1560739	1560744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505018
25526	NC_017300	ACG	2	6	1560772	1560777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25527	NC_017300	ACG	2	6	1560826	1560831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25528	NC_017300	TTC	2	6	1560838	1560843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505018
25529	NC_017300	CTG	2	6	1560879	1560884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505018
25530	NC_017300	ATG	2	6	1560887	1560892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505018
25531	NC_017300	ACCAA	2	10	1561069	1561078	60 %	0 %	0 %	40 %	384505018
25532	NC_017300	TTTC	2	8	1561228	1561235	0 %	75 %	0 %	25 %	384505018
25533	NC_017300	ATTGCT	2	12	1561237	1561248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384505018
25534	NC_017300	ATCCA	2	10	1561259	1561268	40 %	20 %	0 %	40 %	384505019
25535	NC_017300	AGC	2	6	1561272	1561277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505019
25536	NC_017300	CCA	2	6	1561280	1561285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505019
25537	NC_017300	GCC	2	6	1561353	1561358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505019
25538	NC_017300	AAT	2	6	1561395	1561400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505019
25539	NC_017300	TCTT	2	8	1561402	1561409	0 %	75 %	0 %	25 %	384505019
25540	NC_017300	TCA	2	6	1561411	1561416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505019
25541	NC_017300	CAC	2	6	1561535	1561540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505019
25542	NC_017300	AAG	2	6	1561562	1561567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505019
25543	NC_017300	GATC	2	8	1561613	1561620	25 %	25 %	25 %	25 %	384505019
25544	NC_017300	CAC	2	6	1561637	1561642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505019
25545	NC_017300	TA	3	6	1561676	1561681	50 %	50 %	0 %	0 %	384505019
25546	NC_017300	GCC	2	6	1561692	1561697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505019
25547	NC_017300	GCA	2	6	1561784	1561789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505019
25548	NC_017300	TTGC	2	8	1561937	1561944	0 %	50 %	25 %	25 %	384505019
25549	NC_017300	GC	3	6	1561953	1561958	0 %	0 %	50 %	50 %	384505019
25550	NC_017300	CCGGTA	2	12	1562002	1562013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384505019
25551	NC_017300	GCG	2	6	1562061	1562066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505019
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25553	NC_017300	CAT	2	6	1562142	1562147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505019
25554	NC_017300	TGAA	2	8	1562237	1562244	50 %	25 %	25 %	0 %	384505020
25555	NC_017300	TGA	2	6	1562253	1562258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505020
25556	NC_017300	ACC	2	6	1562303	1562308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505020
25557	NC_017300	GCA	2	6	1562312	1562317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505020
25558	NC_017300	GTG	2	6	1562414	1562419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505020
25559	NC_017300	GTA	2	6	1562479	1562484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505020
25560	NC_017300	CAA	2	6	1562518	1562523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505020
25561	NC_017300	ACG	2	6	1562542	1562547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505020
25562	NC_017300	CTG	2	6	1562571	1562576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505020
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25564	NC_017300	CTT	2	6	1562664	1562669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505020
25565	NC_017300	CAAA	2	8	1562718	1562725	75 %	0 %	0 %	25 %	384505020
25566	NC_017300	TGC	2	6	1562815	1562820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505020
25567	NC_017300	CTTTT	2	10	1563410	1563419	0 %	80 %	0 %	20 %	384505021
25568	NC_017300	AGGA	2	8	1563623	1563630	50 %	0 %	50 %	0 %	384505021
25569	NC_017300	AGC	2	6	1563681	1563686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505021
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25571	NC_017300	GC	3	6	1563903	1563908	0 %	0 %	50 %	50 %	384505022
25572	NC_017300	GTG	2	6	1563927	1563932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505022
25573	NC_017300	CTC	2	6	1563944	1563949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505022
25574	NC_017300	TAC	2	6	1564034	1564039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505022
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25576	NC_017300	GGTA	2	8	1564066	1564073	25 %	25 %	50 %	0 %	384505022
25577	NC_017300	GCT	3	9	1564141	1564149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505022
25578	NC_017300	TGTTC	2	10	1564150	1564159	0 %	60 %	20 %	20 %	384505022
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25582	NC_017300	CTTG	2	8	1564379	1564386	0 %	50 %	25 %	25 %	384505022
25583	NC_017300	CAG	3	9	1564390	1564398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505022
25584	NC_017300	CAT	2	6	1564408	1564413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505022
25585	NC_017300	GAA	3	9	1564562	1564570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505022
25586	NC_017300	GAT	2	6	1564595	1564600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505022
25587	NC_017300	TGT	2	6	1564624	1564629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505022
25588	NC_017300	CTTT	2	8	1564663	1564670	0 %	75 %	0 %	25 %	384505022
25589	NC_017300	GC	3	6	1564671	1564676	0 %	0 %	50 %	50 %	384505022
25590	NC_017300	ATA	2	6	1564719	1564724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505022
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25592	NC_017300	CCAA	2	8	1564805	1564812	50 %	0 %	0 %	50 %	384505022
25593	NC_017300	CCA	2	6	1564875	1564880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505022
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25596	NC_017300	CG	3	6	1564942	1564947	0 %	0 %	50 %	50 %	384505022
25597	NC_017300	CTT	2	6	1565465	1565470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505023
25598	NC_017300	ATC	2	6	1565612	1565617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505023
25599	NC_017300	GTT	2	6	1565780	1565785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505023
25600	NC_017300	CAC	2	6	1565792	1565797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505023
25601	NC_017300	AGG	2	6	1565859	1565864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505023
25602	NC_017300	T	6	6	1565937	1565942	0 %	100 %	0 %	0 %	384505023
25603	NC_017300	GAA	2	6	1565950	1565955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505023
25604	NC_017300	CGG	2	6	1566112	1566117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505023
25605	NC_017300	CG	3	6	1566209	1566214	0 %	0 %	50 %	50 %	384505023
25606	NC_017300	TCCT	2	8	1566263	1566270	0 %	50 %	0 %	50 %	384505023
25607	NC_017300	TTG	2	6	1566329	1566334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505023
25608	NC_017300	CAC	2	6	1566340	1566345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505023
25609	NC_017300	GA	4	8	1566353	1566360	50 %	0 %	50 %	0 %	384505023
25610	NC_017300	CTG	2	6	1566393	1566398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505023
25611	NC_017300	ACGCCA	2	12	1566447	1566458	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384505023
25612	NC_017300	CTT	2	6	1566517	1566522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505023
25613	NC_017300	AAG	2	6	1566531	1566536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505023
25614	NC_017300	CGG	2	6	1566589	1566594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505023
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25616	NC_017300	A	6	6	1566636	1566641	100 %	0 %	0 %	0 %	384505023
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25850	NC_017300	GAA	2	6	1584205	1584210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505037
25851	NC_017300	CTG	2	6	1584239	1584244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505037
25852	NC_017300	CAT	2	6	1584252	1584257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505037
25853	NC_017300	CCATC	2	10	1584294	1584303	20 %	20 %	0 %	60 %	384505037
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25855	NC_017300	TCC	2	6	1584397	1584402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505037
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25929	NC_017300	TCG	3	9	1589135	1589143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505044
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25932	NC_017300	TCG	2	6	1589211	1589216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505044
25933	NC_017300	CG	3	6	1589224	1589229	0 %	0 %	50 %	50 %	384505044
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25940	NC_017300	TGCT	2	8	1589546	1589553	0 %	50 %	25 %	25 %	384505045
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25944	NC_017300	CGA	2	6	1589674	1589679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505045
25945	NC_017300	CCAGG	2	10	1589688	1589697	20 %	0 %	40 %	40 %	384505045
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25950	NC_017300	GAT	2	6	1590071	1590076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505045
25951	NC_017300	AGG	2	6	1590081	1590086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505045
25952	NC_017300	GAT	2	6	1590095	1590100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505045
25953	NC_017300	ACCC	2	8	1590121	1590128	25 %	0 %	0 %	75 %	384505045
25954	NC_017300	CAC	2	6	1590131	1590136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505045
25955	NC_017300	GCT	2	6	1590154	1590159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505045
25956	NC_017300	CA	3	6	1590181	1590186	50 %	0 %	0 %	50 %	384505045
25957	NC_017300	CAT	2	6	1590292	1590297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505045
25958	NC_017300	GCG	2	6	1590305	1590310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505045
25959	NC_017300	AGC	2	6	1590335	1590340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505045
25960	NC_017300	GAG	2	6	1590363	1590368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505045
25961	NC_017300	CAGCC	2	10	1590377	1590386	20 %	0 %	20 %	60 %	384505045
25962	NC_017300	ACC	2	6	1590415	1590420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505045
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25964	NC_017300	CAG	2	6	1590440	1590445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505045
25965	NC_017300	CAG	2	6	1590486	1590491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505046
25966	NC_017300	GCCT	2	8	1590573	1590580	0 %	25 %	25 %	50 %	384505046
25967	NC_017300	GC	3	6	1590588	1590593	0 %	0 %	50 %	50 %	384505046
25968	NC_017300	GGC	2	6	1590667	1590672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505046
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