MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_017300	TAC	2	6	1529785	1529790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504989
25004	NC_017300	TTTG	2	8	1529799	1529806	0 %	75 %	25 %	0 %	384504989
25005	NC_017300	ATG	2	6	1529912	1529917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504989
25006	NC_017300	TAG	2	6	1529918	1529923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504989
25007	NC_017300	GC	3	6	1529946	1529951	0 %	0 %	50 %	50 %	384504989
25008	NC_017300	ATC	2	6	1529966	1529971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504989
25009	NC_017300	GCC	2	6	1530150	1530155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504990
25010	NC_017300	GCA	2	6	1530186	1530191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504990
25011	NC_017300	CATC	2	8	1530217	1530224	25 %	25 %	0 %	50 %	384504990
25012	NC_017300	ATA	2	6	1530255	1530260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504990
25013	NC_017300	GAG	2	6	1530340	1530345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504990
25014	NC_017300	TGGC	2	8	1530417	1530424	0 %	25 %	50 %	25 %	384504990
25015	NC_017300	GCA	2	6	1530438	1530443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504990
25016	NC_017300	GCC	3	9	1530585	1530593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504990
25017	NC_017300	CAT	2	6	1530601	1530606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504990
25018	NC_017300	CTG	2	6	1530613	1530618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504990
25019	NC_017300	ATC	2	6	1530684	1530689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504990
25020	NC_017300	CG	3	6	1530713	1530718	0 %	0 %	50 %	50 %	384504990
25021	NC_017300	CAG	3	9	1530724	1530732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504990
25022	NC_017300	GGC	2	6	1530836	1530841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504990
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25024	NC_017300	GCT	2	6	1530919	1530924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504990
25025	NC_017300	CG	3	6	1531043	1531048	0 %	0 %	50 %	50 %	384504990
25026	NC_017300	GTA	2	6	1531077	1531082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504990
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25034	NC_017300	TGA	2	6	1531584	1531589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504991
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25051	NC_017300	CAC	2	6	1532699	1532704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504992
25052	NC_017300	GCA	2	6	1532716	1532721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504992
25053	NC_017300	AGT	2	6	1532768	1532773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504992
25054	NC_017300	TGC	2	6	1532876	1532881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504992
25055	NC_017300	GCT	2	6	1532939	1532944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504992
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25057	NC_017300	GTT	2	6	1532999	1533004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384504992
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25063	NC_017300	CGG	2	6	1533277	1533282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504992
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25106	NC_017300	GCA	2	6	1535101	1535106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504993
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25115	NC_017300	AAT	2	6	1536007	1536012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504994
25116	NC_017300	TGC	2	6	1536048	1536053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504994
25117	NC_017300	TAC	2	6	1536188	1536193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504994
25118	NC_017300	TCCGC	2	10	1536225	1536234	0 %	20 %	20 %	60 %	384504994
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25120	NC_017300	TTTG	2	8	1536281	1536288	0 %	75 %	25 %	0 %	384504994
25121	NC_017300	GCA	2	6	1536316	1536321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504994
25122	NC_017300	CAG	2	6	1536400	1536405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504994
25123	NC_017300	GAAG	2	8	1536411	1536418	50 %	0 %	50 %	0 %	384504994
25124	NC_017300	GGA	2	6	1536454	1536459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504994
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25126	NC_017300	GAT	2	6	1536516	1536521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504994
25127	NC_017300	TGG	2	6	1536538	1536543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384504994
25128	NC_017300	TGC	2	6	1536601	1536606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504994
25129	NC_017300	GGA	2	6	1536616	1536621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504994
25130	NC_017300	CTG	2	6	1536658	1536663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504994
25131	NC_017300	TAT	2	6	1536715	1536720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384504994
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25134	NC_017300	TTG	2	6	1536872	1536877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384504994
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25140	NC_017300	TGA	2	6	1537282	1537287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504994
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25143	NC_017300	CTAT	2	8	1537521	1537528	25 %	50 %	0 %	25 %	384504994
25144	NC_017300	GCGCT	2	10	1537541	1537550	0 %	20 %	40 %	40 %	384504994
25145	NC_017300	CA	3	6	1537578	1537583	50 %	0 %	0 %	50 %	384504994
25146	NC_017300	GC	3	6	1537601	1537606	0 %	0 %	50 %	50 %	384504994
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25152	NC_017300	TGC	2	6	1537877	1537882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504995
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25165	NC_017300	TCC	2	6	1538796	1538801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504996
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25183	NC_017300	TCA	2	6	1540009	1540014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504997
25184	NC_017300	TCA	2	6	1540168	1540173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504997
25185	NC_017300	TCA	2	6	1540207	1540212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504997
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25199	NC_017300	TCC	2	6	1541025	1541030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504999
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25206	NC_017300	TCCATT	2	12	1541895	1541906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384505001
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25215	NC_017300	TTC	2	6	1542451	1542456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505001
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25217	NC_017300	CTT	2	6	1542688	1542693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505002
25218	NC_017300	GGC	2	6	1542704	1542709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505002
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25220	NC_017300	TTA	2	6	1542819	1542824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505002
25221	NC_017300	GC	3	6	1542918	1542923	0 %	0 %	50 %	50 %	384505002
25222	NC_017300	GGA	2	6	1543110	1543115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505002
25223	NC_017300	AAG	2	6	1543130	1543135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505002
25224	NC_017300	GCA	2	6	1543152	1543157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505002
25225	NC_017300	TG	3	6	1543190	1543195	0 %	50 %	50 %	0 %	384505002
25226	NC_017300	CCA	2	6	1543198	1543203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505002
25227	NC_017300	GCT	2	6	1543338	1543343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505002
25228	NC_017300	GCA	2	6	1543365	1543370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505002
25229	NC_017300	GGC	2	6	1543377	1543382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505002
25230	NC_017300	CATC	2	8	1543531	1543538	25 %	25 %	0 %	50 %	384505002
25231	NC_017300	CA	3	6	1543674	1543679	50 %	0 %	0 %	50 %	384505003
25232	NC_017300	GC	3	6	1543798	1543803	0 %	0 %	50 %	50 %	384505003
25233	NC_017300	T	6	6	1543804	1543809	0 %	100 %	0 %	0 %	384505003
25234	NC_017300	T	6	6	1543930	1543935	0 %	100 %	0 %	0 %	384505003
25235	NC_017300	AGA	2	6	1543960	1543965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505003
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25345	NC_017300	CAT	2	6	1550739	1550744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505008
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25347	NC_017300	GAAA	2	8	1550927	1550934	75 %	0 %	25 %	0 %	384505008
25348	NC_017300	TCA	2	6	1550945	1550950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505008
25349	NC_017300	TC	3	6	1551012	1551017	0 %	50 %	0 %	50 %	384505008
25350	NC_017300	GTA	2	6	1551064	1551069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505008
25351	NC_017300	TAC	2	6	1551114	1551119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505008
25352	NC_017300	AAG	2	6	1551448	1551453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505009
25353	NC_017300	CTT	2	6	1551487	1551492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505009
25354	NC_017300	GAAA	2	8	1551502	1551509	75 %	0 %	25 %	0 %	384505009
25355	NC_017300	AGC	2	6	1551519	1551524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505009
25356	NC_017300	AG	3	6	1551608	1551613	50 %	0 %	50 %	0 %	384505009
25357	NC_017300	GCA	2	6	1551633	1551638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505009
25358	NC_017300	GCGTAA	2	12	1551655	1551666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384505009
25359	NC_017300	GA	3	6	1551672	1551677	50 %	0 %	50 %	0 %	384505009
25360	NC_017300	AGC	2	6	1551723	1551728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505009
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25366	NC_017300	A	6	6	1552187	1552192	100 %	0 %	0 %	0 %	384505009
25367	NC_017300	GTG	2	6	1552207	1552212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505009
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25372	NC_017300	GGC	2	6	1552401	1552406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505009
25373	NC_017300	TTC	2	6	1552427	1552432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505009
25374	NC_017300	GCA	2	6	1552440	1552445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505009
25375	NC_017300	GCTCTT	2	12	1552502	1552513	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384505009
25376	NC_017300	TCT	2	6	1552525	1552530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505009
25377	NC_017300	T	6	6	1552530	1552535	0 %	100 %	0 %	0 %	384505009
25378	NC_017300	T	6	6	1552847	1552852	0 %	100 %	0 %	0 %	384505010
25379	NC_017300	CATA	2	8	1552864	1552871	50 %	25 %	0 %	25 %	384505010
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25382	NC_017300	CAC	2	6	1553084	1553089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505010
25383	NC_017300	TGG	2	6	1553098	1553103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505010
25384	NC_017300	GCA	3	9	1553232	1553240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505010
25385	NC_017300	A	6	6	1553282	1553287	100 %	0 %	0 %	0 %	384505010
25386	NC_017300	ACCG	2	8	1553299	1553306	25 %	0 %	25 %	50 %	384505010
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25389	NC_017300	CGA	2	6	1553429	1553434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505010
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25411	NC_017300	CTCCC	2	10	1554739	1554748	0 %	20 %	0 %	80 %	384505012
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25424	NC_017300	CCCAC	2	10	1555413	1555422	20 %	0 %	0 %	80 %	384505012
25425	NC_017300	T	6	6	1555474	1555479	0 %	100 %	0 %	0 %	384505012
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25440	NC_017300	GCTT	2	8	1556351	1556358	0 %	50 %	25 %	25 %	384505013
25441	NC_017300	CG	3	6	1556377	1556382	0 %	0 %	50 %	50 %	384505013
25442	NC_017300	CT	3	6	1556394	1556399	0 %	50 %	0 %	50 %	384505013
25443	NC_017300	AGC	2	6	1556440	1556445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505013
25444	NC_017300	GATT	2	8	1556571	1556578	25 %	50 %	25 %	0 %	384505013
25445	NC_017300	TCT	2	6	1556594	1556599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505013
25446	NC_017300	CTT	2	6	1556619	1556624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505013
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25448	NC_017300	CAT	2	6	1556766	1556771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505013
25449	NC_017300	T	7	7	1556850	1556856	0 %	100 %	0 %	0 %	384505013
25450	NC_017300	TAAT	2	8	1557010	1557017	50 %	50 %	0 %	0 %	384505014
25451	NC_017300	TAA	2	6	1557032	1557037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505014
25452	NC_017300	AGTG	2	8	1557079	1557086	25 %	25 %	50 %	0 %	384505014
25453	NC_017300	CA	3	6	1557299	1557304	50 %	0 %	0 %	50 %	384505014
25454	NC_017300	CAA	2	6	1557336	1557341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505014
25455	NC_017300	AGA	2	6	1557352	1557357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505014
25456	NC_017300	GAA	2	6	1557368	1557373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505014
25457	NC_017300	CCCTGC	2	12	1557419	1557430	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384505014
25458	NC_017300	CACC	2	8	1557570	1557577	25 %	0 %	0 %	75 %	384505014
25459	NC_017300	GCT	3	9	1557590	1557598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505014
25460	NC_017300	TGC	2	6	1557621	1557626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505014
25461	NC_017300	TAA	3	9	1558218	1558226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505016
25462	NC_017300	CATG	2	8	1558253	1558260	25 %	25 %	25 %	25 %	384505016
25463	NC_017300	TA	4	8	1558322	1558329	50 %	50 %	0 %	0 %	384505016
25464	NC_017300	TTCTGC	2	12	1558443	1558454	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384505017
25465	NC_017300	CTT	2	6	1558474	1558479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505017
25466	NC_017300	GAT	2	6	1558483	1558488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505017
25467	NC_017300	TCC	2	6	1558524	1558529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505017
25468	NC_017300	GAA	2	6	1558541	1558546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
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25470	NC_017300	GCT	2	6	1558588	1558593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505017
25471	NC_017300	CAG	2	6	1558600	1558605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505017
25472	NC_017300	GTAA	2	8	1558769	1558776	50 %	25 %	25 %	0 %	384505017
25473	NC_017300	ACC	2	6	1558874	1558879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505017
25474	NC_017300	AG	4	8	1558880	1558887	50 %	0 %	50 %	0 %	384505017
25475	NC_017300	AAG	2	6	1558893	1558898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
25476	NC_017300	AGA	2	6	1558900	1558905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
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25479	NC_017300	TCT	3	9	1558990	1558998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505017
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25482	NC_017300	AAG	2	6	1559042	1559047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
25483	NC_017300	GCA	2	6	1559115	1559120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505017
25484	NC_017300	CCAG	2	8	1559220	1559227	25 %	0 %	25 %	50 %	384505017
25485	NC_017300	AAG	2	6	1559235	1559240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
25486	NC_017300	CAGG	2	8	1559284	1559291	25 %	0 %	50 %	25 %	384505017
25487	NC_017300	CAA	2	6	1559302	1559307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505017
25488	NC_017300	GAT	2	6	1559393	1559398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505017
25489	NC_017300	GAT	2	6	1559405	1559410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505017
25490	NC_017300	ATCAG	2	10	1559442	1559451	40 %	20 %	20 %	20 %	384505017
25491	NC_017300	CCA	2	6	1559463	1559468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505017
25492	NC_017300	GAT	2	6	1559495	1559500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505017
25493	NC_017300	AAT	2	6	1559513	1559518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505017
25494	NC_017300	ATG	2	6	1559526	1559531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505017
25495	NC_017300	ATC	2	6	1559555	1559560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505017
25496	NC_017300	GGGA	2	8	1559562	1559569	25 %	0 %	75 %	0 %	384505017
25497	NC_017300	CA	3	6	1559609	1559614	50 %	0 %	0 %	50 %	384505017
25498	NC_017300	GCG	2	6	1559642	1559647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505017
25499	NC_017300	GAA	2	6	1559660	1559665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505017
25500	NC_017300	GTG	2	6	1559717	1559722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505017

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