MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_017300	GATCAC	2	12	1498736	1498747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384504962
24502	NC_017300	TGC	2	6	1498756	1498761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24503	NC_017300	ACA	2	6	1498881	1498886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504962
24504	NC_017300	AAC	2	6	1498918	1498923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504962
24505	NC_017300	CCG	2	6	1498945	1498950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504962
24506	NC_017300	TGC	2	6	1499000	1499005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24507	NC_017300	ATG	2	6	1499026	1499031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504962
24508	NC_017300	CAAT	2	8	1499122	1499129	50 %	25 %	0 %	25 %	384504962
24509	NC_017300	CAGCC	2	10	1499185	1499194	20 %	0 %	20 %	60 %	384504962
24510	NC_017300	TCG	2	6	1499227	1499232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24511	NC_017300	AGC	2	6	1499246	1499251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24512	NC_017300	TGACA	2	10	1499267	1499276	40 %	20 %	20 %	20 %	384504962
24513	NC_017300	TGC	2	6	1499288	1499293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24514	NC_017300	GCA	2	6	1499355	1499360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24515	NC_017300	ACCA	2	8	1499421	1499428	50 %	0 %	0 %	50 %	384504962
24516	NC_017300	GCT	2	6	1499451	1499456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24517	NC_017300	GCT	2	6	1499490	1499495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24518	NC_017300	GAA	2	6	1499579	1499584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504962
24519	NC_017300	TC	3	6	1499598	1499603	0 %	50 %	0 %	50 %	384504962
24520	NC_017300	TCC	2	6	1499610	1499615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504962
24521	NC_017300	CCG	2	6	1499668	1499673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504962
24522	NC_017300	CAA	2	6	1499778	1499783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504962
24523	NC_017300	GAC	2	6	1499885	1499890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504962
24524	NC_017300	CAAA	2	8	1499927	1499934	75 %	0 %	0 %	25 %	384504962
24525	NC_017300	GC	3	6	1499936	1499941	0 %	0 %	50 %	50 %	384504962
24526	NC_017300	AAC	2	6	1500028	1500033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504962
24527	NC_017300	CTTCT	2	10	1500230	1500239	0 %	60 %	0 %	40 %	384504963
24528	NC_017300	TCGA	2	8	1500341	1500348	25 %	25 %	25 %	25 %	384504963
24529	NC_017300	GCAC	2	8	1500493	1500500	25 %	0 %	25 %	50 %	384504963
24530	NC_017300	CT	3	6	1500532	1500537	0 %	50 %	0 %	50 %	384504963
24531	NC_017300	CAG	2	6	1500547	1500552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504963
24532	NC_017300	CAC	2	6	1500637	1500642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504963
24533	NC_017300	AGA	2	6	1500660	1500665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504963
24534	NC_017300	TTC	2	6	1500673	1500678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504963
24535	NC_017300	GTA	2	6	1500713	1500718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504963
24536	NC_017300	TTC	2	6	1500789	1500794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504963
24537	NC_017300	CAC	2	6	1501231	1501236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504964
24538	NC_017300	TTCA	2	8	1501239	1501246	25 %	50 %	0 %	25 %	384504964
24539	NC_017300	ATT	2	6	1501262	1501267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384504964
24540	NC_017300	CCA	2	6	1501354	1501359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504964
24541	NC_017300	GCA	2	6	1501444	1501449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504964
24542	NC_017300	TGC	2	6	1501531	1501536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504964
24543	NC_017300	TGG	2	6	1501665	1501670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384504964
24544	NC_017300	GCTG	2	8	1501707	1501714	0 %	25 %	50 %	25 %	384504964
24545	NC_017300	GAA	2	6	1501715	1501720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504964
24546	NC_017300	TAC	2	6	1501741	1501746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504964
24547	NC_017300	TCT	2	6	1501765	1501770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504964
24548	NC_017300	CAACGA	2	12	1501771	1501782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384504964
24549	NC_017300	CG	3	6	1501799	1501804	0 %	0 %	50 %	50 %	384504964
24550	NC_017300	ATC	2	6	1501838	1501843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504964
24551	NC_017300	ATG	2	6	1501869	1501874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504964
24552	NC_017300	GCA	2	6	1501958	1501963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504964
24553	NC_017300	ATCG	2	8	1502169	1502176	25 %	25 %	25 %	25 %	384504965
24554	NC_017300	TTC	2	6	1502182	1502187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504965
24555	NC_017300	CGC	2	6	1502324	1502329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504966
24556	NC_017300	TCTT	2	8	1502330	1502337	0 %	75 %	0 %	25 %	384504966
24557	NC_017300	CTC	2	6	1502352	1502357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504966
24558	NC_017300	TCG	2	6	1502362	1502367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504966
24559	NC_017300	GGC	2	6	1502399	1502404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504966
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24565	NC_017300	CGA	2	6	1502774	1502779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504967
24566	NC_017300	A	6	6	1502820	1502825	100 %	0 %	0 %	0 %	384504967
24567	NC_017300	ACC	2	6	1502844	1502849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504967
24568	NC_017300	CTG	2	6	1502861	1502866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504967
24569	NC_017300	TACG	2	8	1502882	1502889	25 %	25 %	25 %	25 %	384504967
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24572	NC_017300	AAC	2	6	1503313	1503318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504968
24573	NC_017300	GCA	2	6	1503351	1503356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504968
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24585	NC_017300	ATT	2	6	1503821	1503826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384504969
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24587	NC_017300	TCC	2	6	1503998	1504003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504969
24588	NC_017300	TAC	3	9	1504016	1504024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504969
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24601	NC_017300	CG	3	6	1504730	1504735	0 %	0 %	50 %	50 %	384504969
24602	NC_017300	GAAC	2	8	1504788	1504795	50 %	0 %	25 %	25 %	384504969
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24604	NC_017300	TGCGG	2	10	1505132	1505141	0 %	20 %	60 %	20 %	384504970
24605	NC_017300	ATC	2	6	1505166	1505171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504970
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24608	NC_017300	AGA	2	6	1505353	1505358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504970
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24612	NC_017300	TGG	2	6	1505481	1505486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384504970
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24614	NC_017300	ACG	2	6	1505534	1505539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504970
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24849	NC_017300	TGGT	2	8	1519555	1519562	0 %	50 %	50 %	0 %	384504979
24850	NC_017300	T	6	6	1520023	1520028	0 %	100 %	0 %	0 %	384504980
24851	NC_017300	ACA	2	6	1520043	1520048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504980
24852	NC_017300	CAT	2	6	1520050	1520055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504980
24853	NC_017300	ACAA	2	8	1520072	1520079	75 %	0 %	0 %	25 %	384504980
24854	NC_017300	TAC	2	6	1520103	1520108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504980
24855	NC_017300	TCC	2	6	1520311	1520316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504981
24856	NC_017300	AGG	2	6	1520329	1520334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504981
24857	NC_017300	CTG	2	6	1520403	1520408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24858	NC_017300	TTG	2	6	1520409	1520414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384504981
24859	NC_017300	TG	3	6	1520433	1520438	0 %	50 %	50 %	0 %	384504981
24860	NC_017300	CTT	2	6	1520538	1520543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504981
24861	NC_017300	ACGGGA	2	12	1520565	1520576	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384504981
24862	NC_017300	GCT	2	6	1520591	1520596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24863	NC_017300	GCC	2	6	1520764	1520769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504981
24864	NC_017300	TG	3	6	1520774	1520779	0 %	50 %	50 %	0 %	384504981
24865	NC_017300	GCA	2	6	1520815	1520820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24866	NC_017300	CATC	2	8	1520837	1520844	25 %	25 %	0 %	50 %	384504981
24867	NC_017300	GCA	2	6	1520857	1520862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24868	NC_017300	GGC	2	6	1520874	1520879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504981
24869	NC_017300	TTC	2	6	1520880	1520885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504981
24870	NC_017300	CTT	2	6	1520892	1520897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504981
24871	NC_017300	GGC	2	6	1520910	1520915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504981
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24873	NC_017300	CG	3	6	1520971	1520976	0 %	0 %	50 %	50 %	384504981
24874	NC_017300	AGCT	2	8	1520979	1520986	25 %	25 %	25 %	25 %	384504981
24875	NC_017300	CGA	2	6	1521025	1521030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24876	NC_017300	TCA	2	6	1521040	1521045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504981
24877	NC_017300	AGAGGC	2	12	1521063	1521074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384504981
24878	NC_017300	CTG	2	6	1521129	1521134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504981
24879	NC_017300	TTC	2	6	1521150	1521155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504981
24880	NC_017300	TCT	2	6	1521175	1521180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504981
24881	NC_017300	CCTCGT	2	12	1521203	1521214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384504981
24882	NC_017300	A	7	7	1521645	1521651	100 %	0 %	0 %	0 %	384504982
24883	NC_017300	ACG	2	6	1521707	1521712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504982
24884	NC_017300	AGTT	2	8	1521734	1521741	25 %	50 %	25 %	0 %	384504982
24885	NC_017300	GA	3	6	1521793	1521798	50 %	0 %	50 %	0 %	384504982
24886	NC_017300	CCA	2	6	1521814	1521819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504982
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24888	NC_017300	GCTC	2	8	1522160	1522167	0 %	25 %	25 %	50 %	384504983
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24905	NC_017300	GTA	2	6	1523222	1523227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504984
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24913	NC_017300	CTCG	2	8	1523583	1523590	0 %	25 %	25 %	50 %	384504985
24914	NC_017300	CAG	2	6	1523612	1523617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504985
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24916	NC_017300	CAGGGG	2	12	1523705	1523716	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384504985
24917	NC_017300	GCA	2	6	1523725	1523730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504985
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24920	NC_017300	GTC	2	6	1523835	1523840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504985
24921	NC_017300	CTT	2	6	1523912	1523917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504985
24922	NC_017300	AG	3	6	1523946	1523951	50 %	0 %	50 %	0 %	384504985
24923	NC_017300	TCG	2	6	1523975	1523980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504985
24924	NC_017300	CTT	2	6	1524005	1524010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504985
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24929	NC_017300	ACC	3	9	1524666	1524674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504985
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24931	NC_017300	TTCA	3	12	1524759	1524770	25 %	50 %	0 %	25 %	384504985
24932	NC_017300	GCG	2	6	1525059	1525064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504986
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24934	NC_017300	GT	3	6	1525327	1525332	0 %	50 %	50 %	0 %	384504986
24935	NC_017300	GAT	2	6	1525368	1525373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504986
24936	NC_017300	CCAC	2	8	1525467	1525474	25 %	0 %	0 %	75 %	384504986
24937	NC_017300	GCA	2	6	1525550	1525555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504986
24938	NC_017300	TCT	2	6	1525562	1525567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504986
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24940	NC_017300	CAA	2	6	1525656	1525661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504986
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24942	NC_017300	TGC	2	6	1525804	1525809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504987
24943	NC_017300	TGA	2	6	1525881	1525886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504987
24944	NC_017300	GCA	2	6	1525970	1525975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504987
24945	NC_017300	GAG	2	6	1526029	1526034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504987
24946	NC_017300	GAT	2	6	1526100	1526105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504987
24947	NC_017300	TCG	2	6	1526114	1526119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504987
24948	NC_017300	CAG	2	6	1526205	1526210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504987
24949	NC_017300	GCC	2	6	1526255	1526260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504987
24950	NC_017300	GCG	2	6	1526261	1526266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504987
24951	NC_017300	GGC	2	6	1526280	1526285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504987
24952	NC_017300	CAA	2	6	1526322	1526327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504987
24953	NC_017300	CCA	2	6	1526370	1526375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504987
24954	NC_017300	CGA	2	6	1526427	1526432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504987
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24957	NC_017300	A	6	6	1526575	1526580	100 %	0 %	0 %	0 %	384504987
24958	NC_017300	CAA	2	6	1526635	1526640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504987
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24991	NC_017300	ATC	2	6	1528910	1528915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504989
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