MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017300	TCC	2	6	1182550	1182555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504689
19503	NC_017300	CT	3	6	1182604	1182609	0 %	50 %	0 %	50 %	384504689
19504	NC_017300	CTT	2	6	1182665	1182670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504689
19505	NC_017300	CAG	2	6	1182685	1182690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504690
19506	NC_017300	GC	3	6	1182721	1182726	0 %	0 %	50 %	50 %	384504690
19507	NC_017300	ATC	2	6	1182819	1182824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504690
19508	NC_017300	TTC	2	6	1182833	1182838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504690
19509	NC_017300	CAA	2	6	1182871	1182876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504690
19510	NC_017300	TTC	2	6	1182878	1182883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504690
19511	NC_017300	AGC	2	6	1182916	1182921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504690
19512	NC_017300	CAT	2	6	1182928	1182933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504690
19513	NC_017300	TCT	2	6	1182960	1182965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504690
19514	NC_017300	CGC	2	6	1182994	1182999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504690
19515	NC_017300	ATG	2	6	1183013	1183018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504690
19516	NC_017300	TGCA	2	8	1183049	1183056	25 %	25 %	25 %	25 %	384504690
19517	NC_017300	CTT	2	6	1183084	1183089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504690
19518	NC_017300	CCT	2	6	1183118	1183123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384504691
19519	NC_017300	GCT	2	6	1183154	1183159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504691
19520	NC_017300	TGC	2	6	1183165	1183170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504691
19521	NC_017300	GTCG	2	8	1183176	1183183	0 %	25 %	50 %	25 %	384504691
19522	NC_017300	CTT	2	6	1183185	1183190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504691
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19524	NC_017300	AC	4	8	1183285	1183292	50 %	0 %	0 %	50 %	384504691
19525	NC_017300	ATC	2	6	1183297	1183302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504691
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19529	NC_017300	CGC	2	6	1183665	1183670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504691
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19531	NC_017300	GCAT	2	8	1183756	1183763	25 %	25 %	25 %	25 %	384504691
19532	NC_017300	GC	3	6	1183776	1183781	0 %	0 %	50 %	50 %	384504691
19533	NC_017300	ACG	2	6	1183795	1183800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504691
19534	NC_017300	TGG	2	6	1183844	1183849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384504691
19535	NC_017300	ACT	2	6	1183859	1183864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504691
19536	NC_017300	GC	3	6	1183948	1183953	0 %	0 %	50 %	50 %	384504691
19537	NC_017300	GTG	2	6	1183984	1183989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384504691
19538	NC_017300	TAC	3	9	1184002	1184010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504691
19539	NC_017300	CTT	2	6	1184019	1184024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504691
19540	NC_017300	GC	3	6	1184243	1184248	0 %	0 %	50 %	50 %	384504691
19541	NC_017300	ATA	2	6	1184325	1184330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504691
19542	NC_017300	TCAG	2	8	1184375	1184382	25 %	25 %	25 %	25 %	384504691
19543	NC_017300	GA	3	6	1184398	1184403	50 %	0 %	50 %	0 %	384504692
19544	NC_017300	ATC	2	6	1184430	1184435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504692
19545	NC_017300	TAA	2	6	1184459	1184464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504692
19546	NC_017300	ATC	2	6	1184533	1184538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504692
19547	NC_017300	TCT	2	6	1184684	1184689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504692
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19550	NC_017300	GC	3	6	1184899	1184904	0 %	0 %	50 %	50 %	384504692
19551	NC_017300	AAG	2	6	1184940	1184945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504692
19552	NC_017300	TCA	2	6	1185100	1185105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504692
19553	NC_017300	GTA	2	6	1185110	1185115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504692
19554	NC_017300	GCT	2	6	1185269	1185274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504693
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19556	NC_017300	TTC	2	6	1185303	1185308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504693
19557	NC_017300	TTC	2	6	1185338	1185343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504693
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19559	NC_017300	TCT	2	6	1185391	1185396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504693
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19561	NC_017300	TAAA	2	8	1185414	1185421	75 %	25 %	0 %	0 %	384504693
19562	NC_017300	TCG	2	6	1185430	1185435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504693
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19565	NC_017300	GCT	2	6	1185710	1185715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504693
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19569	NC_017300	TGCG	2	8	1185963	1185970	0 %	25 %	50 %	25 %	384504693
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19575	NC_017300	CGT	2	6	1186292	1186297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504693
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19585	NC_017300	AG	3	6	1186904	1186909	50 %	0 %	50 %	0 %	384504694
19586	NC_017300	ACCA	2	8	1186931	1186938	50 %	0 %	0 %	50 %	384504694
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19595	NC_017300	AAAGG	2	10	1187636	1187645	60 %	0 %	40 %	0 %	384504694
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19598	NC_017300	GAT	2	6	1187837	1187842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504694
19599	NC_017300	GCG	2	6	1188077	1188082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504695
19600	NC_017300	ATG	2	6	1188100	1188105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504695
19601	NC_017300	GCG	2	6	1188146	1188151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384504695
19602	NC_017300	T	6	6	1188192	1188197	0 %	100 %	0 %	0 %	384504695
19603	NC_017300	CCA	2	6	1188290	1188295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504695
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19606	NC_017300	TGGT	2	8	1188657	1188664	0 %	50 %	50 %	0 %	384504695
19607	NC_017300	TGA	2	6	1189050	1189055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504696
19608	NC_017300	ATG	2	6	1189112	1189117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504696
19609	NC_017300	CAT	2	6	1189174	1189179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504696
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19611	NC_017300	GCT	2	6	1189297	1189302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504696
19612	NC_017300	TTA	2	6	1189372	1189377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384504696
19613	NC_017300	CAA	2	6	1189416	1189421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504696
19614	NC_017300	ATCA	2	8	1189446	1189453	50 %	25 %	0 %	25 %	384504696
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19733	NC_017300	TCA	2	6	1197450	1197455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504702
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19845	NC_017300	CG	3	6	1203742	1203747	0 %	0 %	50 %	50 %	384504707
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19963	NC_017300	AGC	2	6	1210459	1210464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504712
19964	NC_017300	CGA	2	6	1210511	1210516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504712
19965	NC_017300	ATA	2	6	1210565	1210570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504712
19966	NC_017300	CTG	2	6	1210599	1210604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504712
19967	NC_017300	GGA	2	6	1210632	1210637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504712
19968	NC_017300	CGA	2	6	1210665	1210670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504712
19969	NC_017300	A	6	6	1210704	1210709	100 %	0 %	0 %	0 %	384504712
19970	NC_017300	CCA	2	6	1210760	1210765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384504712
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19972	NC_017300	GCA	2	6	1210823	1210828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504712
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19974	NC_017300	CGT	2	6	1210896	1210901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504712
19975	NC_017300	AGA	2	6	1210927	1210932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504712
19976	NC_017300	CGC	2	6	1210980	1210985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504712
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19978	NC_017300	TTC	2	6	1211117	1211122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504713
19979	NC_017300	TTC	2	6	1211141	1211146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504713
19980	NC_017300	TGA	2	6	1211251	1211256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384504713
19981	NC_017300	T	6	6	1211271	1211276	0 %	100 %	0 %	0 %	384504713
19982	NC_017300	TCA	2	6	1211283	1211288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504713
19983	NC_017300	GGA	2	6	1211362	1211367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384504713
19984	NC_017300	CAA	2	6	1211377	1211382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384504713
19985	NC_017300	TCAT	2	8	1211547	1211554	25 %	50 %	0 %	25 %	384504713
19986	NC_017300	TTCACG	2	12	1211558	1211569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384504713
19987	NC_017300	GT	3	6	1211609	1211614	0 %	50 %	50 %	0 %	384504713
19988	NC_017300	TAA	2	6	1211638	1211643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384504713
19989	NC_017300	TCG	2	6	1211649	1211654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504713
19990	NC_017300	CG	3	6	1211653	1211658	0 %	0 %	50 %	50 %	384504713
19991	NC_017300	ACT	2	6	1211814	1211819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384504713
19992	NC_017300	AGC	2	6	1211873	1211878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384504713
19993	NC_017300	TCT	2	6	1212115	1212120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384504714
19994	NC_017300	T	7	7	1212138	1212144	0 %	100 %	0 %	0 %	384504714
19995	NC_017300	CAGTT	2	10	1212166	1212175	20 %	40 %	20 %	20 %	384504714
19996	NC_017300	TGC	2	6	1212239	1212244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504714
19997	NC_017300	TTG	2	6	1212286	1212291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384504714
19998	NC_017300	GAA	2	6	1212321	1212326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384504714
19999	NC_017300	CGT	2	6	1212393	1212398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384504714
20000	NC_017300	GCC	2	6	1212431	1212436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384504714

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