MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 86025

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
2	NC_017295	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
3	NC_017295	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
4	NC_017295	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
5	NC_017295	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456719
6	NC_017295	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
7	NC_017295	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
8	NC_017295	ACAA	2	8	755	762	75 %	0 %	0 %	25 %	384456719
9	NC_017295	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
10	NC_017295	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456719
11	NC_017295	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456719
12	NC_017295	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384456719
13	NC_017295	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456719
14	NC_017295	TA	3	6	904	909	50 %	50 %	0 %	0 %	384456719
15	NC_017295	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
16	NC_017295	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
17	NC_017295	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
18	NC_017295	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456719
19	NC_017295	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
20	NC_017295	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	384456719
21	NC_017295	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
22	NC_017295	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	384456719
23	NC_017295	AACA	2	8	1178	1185	75 %	0 %	0 %	25 %	384456719
24	NC_017295	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384456719
25	NC_017295	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
26	NC_017295	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
27	NC_017295	AG	3	6	1397	1402	50 %	0 %	50 %	0 %	384456719
28	NC_017295	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	384456719
29	NC_017295	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
30	NC_017295	AACT	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	384456719
31	NC_017295	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
32	NC_017295	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
33	NC_017295	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
34	NC_017295	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
35	NC_017295	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
36	NC_017295	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	384456719
37	NC_017295	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
38	NC_017295	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	384456720
39	NC_017295	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
40	NC_017295	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
41	NC_017295	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456720
42	NC_017295	AAAT	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	384456720
43	NC_017295	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
44	NC_017295	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456720
45	NC_017295	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
46	NC_017295	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
47	NC_017295	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
48	NC_017295	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	384456720
49	NC_017295	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	384456720
50	NC_017295	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
51	NC_017295	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
52	NC_017295	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
53	NC_017295	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	384456720
54	NC_017295	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
55	NC_017295	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456720
56	NC_017295	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
57	NC_017295	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
58	NC_017295	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
59	NC_017295	AG	4	8	2855	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	384456720
60	NC_017295	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
61	NC_017295	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
62	NC_017295	AATA	2	8	2969	2976	75 %	25 %	0 %	0 %	384456720
63	NC_017295	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
64	NC_017295	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
65	NC_017295	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
66	NC_017295	AAGT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	25 %	0 %	384456721
67	NC_017295	TA	3	6	3288	3293	50 %	50 %	0 %	0 %	384456721
68	NC_017295	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456721
69	NC_017295	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	384456721
70	NC_017295	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
71	NC_017295	TA	3	6	3450	3455	50 %	50 %	0 %	0 %	384456722
72	NC_017295	A	6	6	3455	3460	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
73	NC_017295	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
74	NC_017295	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
75	NC_017295	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
76	NC_017295	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
77	NC_017295	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456722
78	NC_017295	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
79	NC_017295	A	7	7	3687	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
80	NC_017295	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
81	NC_017295	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
82	NC_017295	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
83	NC_017295	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456722
84	NC_017295	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
85	NC_017295	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
86	NC_017295	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
87	NC_017295	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
88	NC_017295	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	384456722
89	NC_017295	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
90	NC_017295	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456722
91	NC_017295	ATTC	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	384456722
92	NC_017295	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
93	NC_017295	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
94	NC_017295	TTTA	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	384456722
95	NC_017295	AAAT	2	8	4243	4250	75 %	25 %	0 %	0 %	384456722
96	NC_017295	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
97	NC_017295	AT	4	8	4409	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	384456722
98	NC_017295	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
99	NC_017295	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
100	NC_017295	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456723
101	NC_017295	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
102	NC_017295	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456723
103	NC_017295	GGAT	2	8	4677	4684	25 %	25 %	50 %	0 %	384456723
104	NC_017295	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
105	NC_017295	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
106	NC_017295	A	7	7	4851	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	384456724
107	NC_017295	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
108	NC_017295	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
109	NC_017295	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
110	NC_017295	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
111	NC_017295	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456724
112	NC_017295	TGT	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456724
113	NC_017295	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456724
114	NC_017295	AT	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	384456724
115	NC_017295	AAAC	2	8	5273	5280	75 %	0 %	0 %	25 %	384456724
116	NC_017295	A	6	6	5313	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384456724
117	NC_017295	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
118	NC_017295	AT	3	6	5348	5353	50 %	50 %	0 %	0 %	384456724
119	NC_017295	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456724
120	NC_017295	GA	3	6	5419	5424	50 %	0 %	50 %	0 %	384456724
121	NC_017295	TGA	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
122	NC_017295	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456724
123	NC_017295	ATG	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
124	NC_017295	AT	3	6	5643	5648	50 %	50 %	0 %	0 %	384456724
125	NC_017295	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
126	NC_017295	AC	3	6	5668	5673	50 %	0 %	0 %	50 %	384456724
127	NC_017295	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456724
128	NC_017295	ACAA	2	8	5851	5858	75 %	0 %	0 %	25 %	384456724
129	NC_017295	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456724
130	NC_017295	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
131	NC_017295	GAA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
132	NC_017295	TAG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
133	NC_017295	GCT	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456724
134	NC_017295	AGA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
135	NC_017295	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456724
136	NC_017295	AT	4	8	6107	6114	50 %	50 %	0 %	0 %	384456724
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