MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	CACGC	2	10	1782	1791	20 %	0 %	20 %	60 %	409191059
2	NC_017293	GC	3	6	1790	1795	0 %	0 %	50 %	50 %	409191059
3	NC_017293	GCA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
4	NC_017293	GTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191059
5	NC_017293	AT	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	409191059
6	NC_017293	GCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
7	NC_017293	TAGT	2	8	1918	1925	25 %	50 %	25 %	0 %	409191059
8	NC_017293	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
9	NC_017293	GTA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
10	NC_017293	ATG	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
11	NC_017293	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191059
12	NC_017293	CAAG	2	8	2210	2217	50 %	0 %	25 %	25 %	409191059
13	NC_017293	TCA	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
14	NC_017293	GTCT	2	8	2300	2307	0 %	50 %	25 %	25 %	409191059
15	NC_017293	GGCTA	2	10	2312	2321	20 %	20 %	40 %	20 %	409191059
16	NC_017293	GTC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191059
17	NC_017293	ATG	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
18	NC_017293	AGG	3	9	3128	3136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191060
19	NC_017293	TGTGC	2	10	3149	3158	0 %	40 %	40 %	20 %	409191060
20	NC_017293	GCGG	2	8	3159	3166	0 %	0 %	75 %	25 %	409191060
21	NC_017293	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191060
22	NC_017293	TTGC	2	8	3224	3231	0 %	50 %	25 %	25 %	409191060
23	NC_017293	GCC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
24	NC_017293	CCT	3	9	3275	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191060
25	NC_017293	CAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191060
26	NC_017293	TGC	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191060
27	NC_017293	CGC	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
28	NC_017293	CG	4	8	5244	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	409191061
29	NC_017293	GCA	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
30	NC_017293	GGAT	2	8	5532	5539	25 %	25 %	50 %	0 %	409191061
31	NC_017293	GCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
32	NC_017293	GAT	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191061
33	NC_017293	GCA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191062
34	NC_017293	GGT	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
35	NC_017293	CGG	3	9	5783	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191062
36	NC_017293	TGG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
37	NC_017293	AAG	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191062
38	NC_017293	AGG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191062
39	NC_017293	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191063
40	NC_017293	CTGTG	2	10	5995	6004	0 %	40 %	40 %	20 %	409191063
41	NC_017293	GCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
42	NC_017293	GCG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
43	NC_017293	TCTG	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	409191063
44	NC_017293	TGT	2	6	6202	6207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191063
45	NC_017293	CG	3	6	6232	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	409191063
46	NC_017293	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191063
47	NC_017293	GCG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
48	NC_017293	CAT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
49	NC_017293	CCA	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191064
50	NC_017293	CGT	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
51	NC_017293	CTCG	2	8	6673	6680	0 %	25 %	25 %	50 %	409191064
52	NC_017293	GTC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
53	NC_017293	CCTG	2	8	6772	6779	0 %	25 %	25 %	50 %	409191064
54	NC_017293	TAC	2	6	6840	6845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
55	NC_017293	GCG	2	6	6978	6983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
56	NC_017293	CGG	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
57	NC_017293	TGC	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
58	NC_017293	CT	3	6	7257	7262	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
59	NC_017293	ACG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
60	NC_017293	TAA	2	6	7281	7286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191064
61	NC_017293	GGA	2	6	7287	7292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
62	NC_017293	CAG	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
63	NC_017293	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
64	NC_017293	GAA	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191064
65	NC_017293	GCG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
66	NC_017293	CTAC	2	8	7493	7500	25 %	25 %	0 %	50 %	409191064
67	NC_017293	TTG	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191064
68	NC_017293	TGC	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
69	NC_017293	GAG	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
70	NC_017293	AGGG	2	8	7710	7717	25 %	0 %	75 %	0 %	409191064
71	NC_017293	GGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
72	NC_017293	TGG	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191064
73	NC_017293	GCA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
74	NC_017293	AGG	2	6	7861	7866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
75	NC_017293	TCA	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
76	NC_017293	CAA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191064
77	NC_017293	CT	3	6	7921	7926	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
78	NC_017293	GCA	2	6	7967	7972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
79	NC_017293	GGC	2	6	7974	7979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
80	NC_017293	ACG	2	6	8022	8027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
81	NC_017293	ATG	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191065
82	NC_017293	CTGC	2	8	9634	9641	0 %	25 %	25 %	50 %	409191065
83	NC_017293	GGC	2	6	9692	9697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191065
84	NC_017293	TGC	2	6	9705	9710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
85	NC_017293	ACG	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
86	NC_017293	GC	3	6	9720	9725	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
87	NC_017293	GC	3	6	9728	9733	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
88	NC_017293	AGC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
89	NC_017293	ATG	2	6	9819	9824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191065
90	NC_017293	TGCAC	2	10	9854	9863	20 %	20 %	20 %	40 %	409191065
91	NC_017293	CA	4	8	9878	9885	50 %	0 %	0 %	50 %	409191065
92	NC_017293	TGC	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
93	NC_017293	GCTG	2	8	9972	9979	0 %	25 %	50 %	25 %	409191065
94	NC_017293	GCT	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
95	NC_017293	TGC	2	6	10061	10066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
96	NC_017293	ATGC	2	8	10086	10093	25 %	25 %	25 %	25 %	409191065
97	NC_017293	AGC	2	6	10182	10187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
98	NC_017293	CCAT	2	8	10224	10231	25 %	25 %	0 %	50 %	409191065
99	NC_017293	CAG	2	6	10237	10242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
100	NC_017293	GCGCA	2	10	10300	10309	20 %	0 %	40 %	40 %	409191065
101	NC_017293	CCT	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191065
102	NC_017293	GC	3	6	10353	10358	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
103	NC_017293	CG	3	6	10387	10392	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
104	NC_017293	TGC	2	6	10419	10424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
105	NC_017293	CTC	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191065
106	NC_017293	CAG	2	6	10469	10474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
107	NC_017293	GC	3	6	10486	10491	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
108	NC_017293	AGC	2	6	10502	10507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
109	NC_017293	GAG	2	6	10510	10515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191065
110	NC_017293	TGC	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
111	NC_017293	CGC	2	6	10526	10531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191065
112	NC_017293	GC	3	6	10537	10542	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
113	NC_017293	AGG	2	6	10604	10609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191066
114	NC_017293	CGA	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191066
115	NC_017293	CAG	2	6	10731	10736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191066
116	NC_017293	AGAT	2	8	10807	10814	50 %	25 %	25 %	0 %	409191066
117	NC_017293	GCGCTC	2	12	10949	10960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409191066
118	NC_017293	TGC	2	6	11070	11075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
119	NC_017293	CCAG	2	8	11088	11095	25 %	0 %	25 %	50 %	409191066
120	NC_017293	TCA	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191066
121	NC_017293	GCT	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
122	NC_017293	TG	3	6	11223	11228	0 %	50 %	50 %	0 %	409191066
123	NC_017293	CTG	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
124	NC_017293	GACAT	2	10	11306	11315	40 %	20 %	20 %	20 %	409191066
125	NC_017293	CAT	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191066
126	NC_017293	GCATGG	2	12	11343	11354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409191066
127	NC_017293	TCT	2	6	11367	11372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191066
128	NC_017293	GCGAC	2	10	11397	11406	20 %	0 %	40 %	40 %	409191066
129	NC_017293	GCT	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
130	NC_017293	TGC	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
131	NC_017293	CTAGCC	2	12	11555	11566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409191066
132	NC_017293	GAG	2	6	11644	11649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191066
133	NC_017293	GCATG	2	10	11682	11691	20 %	20 %	40 %	20 %	409191066
134	NC_017293	TGC	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
135	NC_017293	GCTG	2	8	11783	11790	0 %	25 %	50 %	25 %	409191066
136	NC_017293	CTAC	2	8	11839	11846	25 %	25 %	0 %	50 %	409191066
137	NC_017293	GCT	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
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139	NC_017293	TAG	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191067
140	NC_017293	GTG	2	6	12085	12090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
141	NC_017293	GGGCT	2	10	12095	12104	0 %	20 %	60 %	20 %	409191067
142	NC_017293	CG	3	6	12116	12121	0 %	0 %	50 %	50 %	409191067
143	NC_017293	GAT	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191067
144	NC_017293	AAGGC	2	10	12244	12253	40 %	0 %	40 %	20 %	409191067
145	NC_017293	GGC	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191067
146	NC_017293	GTG	2	6	12349	12354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
147	NC_017293	TTC	2	6	12371	12376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191067
148	NC_017293	CCG	2	6	12489	12494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191067
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150	NC_017293	GCT	2	6	12534	12539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
151	NC_017293	GTG	2	6	12562	12567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
152	NC_017293	GGC	2	6	12616	12621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191067
153	NC_017293	AGA	2	6	12734	12739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191067
154	NC_017293	TAT	2	6	12789	12794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191067
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156	NC_017293	TCG	2	6	12860	12865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
157	NC_017293	AGA	2	6	12914	12919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191067
158	NC_017293	AAT	2	6	13089	13094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191067
159	NC_017293	CGT	2	6	13149	13154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
160	NC_017293	GTT	2	6	13225	13230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191067
161	NC_017293	TGC	2	6	13363	13368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
162	NC_017293	CTG	2	6	13394	13399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
163	NC_017293	GCT	2	6	13443	13448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
164	NC_017293	GCG	2	6	13552	13557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191068
165	NC_017293	AGGC	2	8	13562	13569	25 %	0 %	50 %	25 %	409191068
166	NC_017293	CA	3	6	13663	13668	50 %	0 %	0 %	50 %	409191068
167	NC_017293	GGC	2	6	13755	13760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191068
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259	NC_017293	GAG	2	6	19512	19517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191074
260	NC_017293	TCG	2	6	19525	19530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
261	NC_017293	GCT	2	6	19688	19693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
262	NC_017293	AGG	2	6	19756	19761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191074
263	NC_017293	TGC	2	6	19844	19849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
264	NC_017293	AGG	2	6	19960	19965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191074
265	NC_017293	GGAG	2	8	19994	20001	25 %	0 %	75 %	0 %	409191074
266	NC_017293	ATA	2	6	20079	20084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191074
267	NC_017293	CAG	2	6	20089	20094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
268	NC_017293	CAG	2	6	20121	20126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
269	NC_017293	ACG	2	6	20211	20216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
270	NC_017293	GCA	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
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272	NC_017293	CCT	2	6	20318	20323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191074
273	NC_017293	GCT	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
274	NC_017293	AGG	2	6	20374	20379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191074
275	NC_017293	ACC	2	6	20388	20393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191074
276	NC_017293	ATA	2	6	20415	20420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191074
277	NC_017293	ACGC	2	8	20512	20519	25 %	0 %	25 %	50 %	409191074
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280	NC_017293	TGC	2	6	20693	20698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
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283	NC_017293	CCA	2	6	20797	20802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191074
284	NC_017293	CGA	2	6	20882	20887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
285	NC_017293	GC	3	6	20914	20919	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
286	NC_017293	GCG	2	6	21040	21045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191074
287	NC_017293	GGA	2	6	21080	21085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191074
288	NC_017293	TGG	2	6	21194	21199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191074
289	NC_017293	CTGC	2	8	21225	21232	0 %	25 %	25 %	50 %	409191074
290	NC_017293	GCT	2	6	21263	21268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
291	NC_017293	CCA	2	6	21286	21291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191074
292	NC_017293	TGC	2	6	21308	21313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
293	NC_017293	GCA	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
294	NC_017293	TAC	2	6	21360	21365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191074
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297	NC_017293	CACTAT	2	12	21461	21472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191074
298	NC_017293	GAC	2	6	21543	21548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191074
299	NC_017293	G	6	6	21683	21688	0 %	0 %	100 %	0 %	409191074
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303	NC_017293	CG	4	8	22285	22292	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
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308	NC_017293	TCC	2	6	22561	22566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191075
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373	NC_017293	ACG	2	6	25623	25628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191077
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375	NC_017293	ATGCC	2	10	25659	25668	20 %	20 %	20 %	40 %	409191077
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378	NC_017293	GGCT	2	8	25856	25863	0 %	25 %	50 %	25 %	409191077
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382	NC_017293	GCA	2	6	26019	26024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191078
383	NC_017293	TGG	2	6	26027	26032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191078
384	NC_017293	AGCA	2	8	26103	26110	50 %	0 %	25 %	25 %	409191078
385	NC_017293	TC	3	6	26183	26188	0 %	50 %	0 %	50 %	409191078
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390	NC_017293	CGT	2	6	33214	33219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191080
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497	NC_017293	CA	3	6	42805	42810	50 %	0 %	0 %	50 %	409191085
498	NC_017293	GCG	2	6	42897	42902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191086
499	NC_017293	CG	3	6	42933	42938	0 %	0 %	50 %	50 %	409191086
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