MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017293	CTC	2	6	123212	123217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191162
1502	NC_017293	ACT	2	6	123275	123280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191162
1503	NC_017293	GCT	2	6	123354	123359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1504	NC_017293	GCC	2	6	123493	123498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191163
1505	NC_017293	AAC	2	6	123528	123533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191163
1506	NC_017293	CGTGCT	2	12	123549	123560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1507	NC_017293	GCA	2	6	123607	123612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1508	NC_017293	GGAG	2	8	123615	123622	25 %	0 %	75 %	0 %	409191163
1509	NC_017293	AGG	2	6	123702	123707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191163
1510	NC_017293	GCT	2	6	123715	123720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1511	NC_017293	ACG	2	6	123739	123744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1512	NC_017293	CG	3	6	123743	123748	0 %	0 %	50 %	50 %	409191163
1513	NC_017293	GC	4	8	123764	123771	0 %	0 %	50 %	50 %	409191163
1514	NC_017293	GGC	2	6	123772	123777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191163
1515	NC_017293	CGCTA	2	10	123780	123789	20 %	20 %	20 %	40 %	409191163
1516	NC_017293	CGA	2	6	123801	123806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191163
1517	NC_017293	GGC	2	6	123831	123836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191163
1518	NC_017293	ATG	2	6	123897	123902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191163
1519	NC_017293	GTGC	2	8	123941	123948	0 %	25 %	50 %	25 %	409191164
1520	NC_017293	GTG	2	6	123964	123969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191164
1521	NC_017293	GCG	2	6	124034	124039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191164
1522	NC_017293	TGC	2	6	124073	124078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191164
1523	NC_017293	TGC	2	6	124143	124148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191164
1524	NC_017293	GTGG	2	8	124176	124183	0 %	25 %	75 %	0 %	409191164
1525	NC_017293	TAG	2	6	124192	124197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191164
1526	NC_017293	GCA	2	6	124257	124262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191164
1527	NC_017293	GC	3	6	124264	124269	0 %	0 %	50 %	50 %	409191164
1528	NC_017293	GCAT	2	8	124287	124294	25 %	25 %	25 %	25 %	409191164
1529	NC_017293	TAC	2	6	124305	124310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191164
1530	NC_017293	GGCT	2	8	124354	124361	0 %	25 %	50 %	25 %	409191164
1531	NC_017293	GCG	2	6	124362	124367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191164
1532	NC_017293	CGC	2	6	124372	124377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191164
1533	NC_017293	GAG	2	6	124378	124383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191164
1534	NC_017293	GCA	2	6	124385	124390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191164
1535	NC_017293	GCT	2	6	124653	124658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191164
1536	NC_017293	ATA	2	6	124710	124715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191164
1537	NC_017293	TGCA	2	8	124730	124737	25 %	25 %	25 %	25 %	409191164
1538	NC_017293	CTA	2	6	124766	124771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191164
1539	NC_017293	ACGA	2	8	125013	125020	50 %	0 %	25 %	25 %	409191165
1540	NC_017293	AGT	2	6	125032	125037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191165
1541	NC_017293	TGC	2	6	125048	125053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191165
1542	NC_017293	AGGC	2	8	125185	125192	25 %	0 %	50 %	25 %	409191165
1543	NC_017293	TAG	2	6	125226	125231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191165
1544	NC_017293	TGA	2	6	125339	125344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191165
1545	NC_017293	CT	3	6	125370	125375	0 %	50 %	0 %	50 %	409191165
1546	NC_017293	CCG	2	6	125455	125460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191165
1547	NC_017293	AAT	2	6	125467	125472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191165
1548	NC_017293	GGT	2	6	125478	125483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191165
1549	NC_017293	CTG	2	6	125574	125579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191165
1550	NC_017293	AGCC	2	8	125744	125751	25 %	0 %	25 %	50 %	409191165
1551	NC_017293	GTG	2	6	125761	125766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191165
1552	NC_017293	TGG	2	6	125887	125892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191165
1553	NC_017293	TATCC	2	10	125952	125961	20 %	40 %	0 %	40 %	409191165
1554	NC_017293	CGG	2	6	126018	126023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191165
1555	NC_017293	CAG	2	6	126038	126043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191165
1556	NC_017293	GCCT	2	8	126060	126067	0 %	25 %	25 %	50 %	409191165
1557	NC_017293	TGC	2	6	126090	126095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191165
1558	NC_017293	AC	3	6	126174	126179	50 %	0 %	0 %	50 %	409191165
1559	NC_017293	AGT	2	6	126241	126246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191166
1560	NC_017293	GTG	2	6	126261	126266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191166
1561	NC_017293	TGCC	2	8	126362	126369	0 %	25 %	25 %	50 %	409191166
1562	NC_017293	GCC	2	6	126377	126382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191166
1563	NC_017293	CCT	2	6	126441	126446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191166
1564	NC_017293	GCC	2	6	126459	126464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191166
1565	NC_017293	GCA	2	6	126471	126476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191166
1566	NC_017293	AT	3	6	126527	126532	50 %	50 %	0 %	0 %	409191166
1567	NC_017293	CCG	2	6	126541	126546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191166
1568	NC_017293	TA	3	6	126569	126574	50 %	50 %	0 %	0 %	409191166
1569	NC_017293	TCG	2	6	126597	126602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191166
1570	NC_017293	CAA	2	6	126625	126630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191166
1571	NC_017293	TC	3	6	126677	126682	0 %	50 %	0 %	50 %	409191166
1572	NC_017293	AGG	2	6	126687	126692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191166
1573	NC_017293	ATC	2	6	126768	126773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191166
1574	NC_017293	CGG	2	6	127074	127079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191167
1575	NC_017293	AG	3	6	127212	127217	50 %	0 %	50 %	0 %	409191167
1576	NC_017293	GCG	2	6	127277	127282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191167
1577	NC_017293	TAC	2	6	127309	127314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191167
1578	NC_017293	ACACC	2	10	127319	127328	40 %	0 %	0 %	60 %	409191167
1579	NC_017293	CAT	2	6	127341	127346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191167
1580	NC_017293	TCG	2	6	127502	127507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191167
1581	NC_017293	TCG	2	6	127546	127551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191167
1582	NC_017293	CCT	2	6	127605	127610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191167
1583	NC_017293	ACGCTA	2	12	127720	127731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409191167
1584	NC_017293	AGCTG	2	10	127779	127788	20 %	20 %	40 %	20 %	409191167
1585	NC_017293	AGGAT	2	10	127847	127856	40 %	20 %	40 %	0 %	409191167
1586	NC_017293	GCT	2	6	127926	127931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191167
1587	NC_017293	GC	3	6	127937	127942	0 %	0 %	50 %	50 %	409191167
1588	NC_017293	ACG	2	6	127943	127948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191167
1589	NC_017293	CTA	2	6	127962	127967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191167
1590	NC_017293	CGGT	2	8	128007	128014	0 %	25 %	50 %	25 %	409191167
1591	NC_017293	ATG	2	6	128032	128037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191167
1592	NC_017293	CA	3	6	128114	128119	50 %	0 %	0 %	50 %	409191167
1593	NC_017293	CGG	2	6	128123	128128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191167
1594	NC_017293	CCA	2	6	128168	128173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191167
1595	NC_017293	CGC	2	6	128178	128183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191167
1596	NC_017293	ACT	2	6	129447	129452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191168
1597	NC_017293	TGC	2	6	129497	129502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191168
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1599	NC_017293	CA	3	6	130259	130264	50 %	0 %	0 %	50 %	409191169
1600	NC_017293	AGGG	2	8	130333	130340	25 %	0 %	75 %	0 %	409191169
1601	NC_017293	GC	3	6	130391	130396	0 %	0 %	50 %	50 %	409191169
1602	NC_017293	CAG	2	6	130406	130411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191169
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1604	NC_017293	GC	3	6	130426	130431	0 %	0 %	50 %	50 %	409191169
1605	NC_017293	AGG	2	6	130507	130512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191169
1606	NC_017293	TGC	2	6	130718	130723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191170
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1609	NC_017293	TGC	2	6	131064	131069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191170
1610	NC_017293	ACCTT	2	10	131197	131206	20 %	40 %	0 %	40 %	409191170
1611	NC_017293	GCA	2	6	131258	131263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191170
1612	NC_017293	CCT	2	6	131313	131318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191170
1613	NC_017293	CGGGT	2	10	131344	131353	0 %	20 %	60 %	20 %	409191170
1614	NC_017293	CTGC	2	8	131434	131441	0 %	25 %	25 %	50 %	409191170
1615	NC_017293	CTGG	2	8	131505	131512	0 %	25 %	50 %	25 %	409191170
1616	NC_017293	GCCG	2	8	131518	131525	0 %	0 %	50 %	50 %	409191170
1617	NC_017293	AT	3	6	131527	131532	50 %	50 %	0 %	0 %	409191170
1618	NC_017293	CGA	2	6	131533	131538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191170
1619	NC_017293	TGCGC	2	10	131595	131604	0 %	20 %	40 %	40 %	409191170
1620	NC_017293	AGCGC	2	10	131612	131621	20 %	0 %	40 %	40 %	409191170
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1622	NC_017293	CTTGC	2	10	131637	131646	0 %	40 %	20 %	40 %	409191170
1623	NC_017293	CTC	2	6	131690	131695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191170
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1742	NC_017293	CCG	2	6	138526	138531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191174
1743	NC_017293	T	6	6	138593	138598	0 %	100 %	0 %	0 %	409191174
1744	NC_017293	TGC	2	6	138632	138637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191174
1745	NC_017293	GCAT	2	8	138688	138695	25 %	25 %	25 %	25 %	409191174
1746	NC_017293	AG	4	8	138730	138737	50 %	0 %	50 %	0 %	409191174
1747	NC_017293	GC	3	6	138771	138776	0 %	0 %	50 %	50 %	409191174
1748	NC_017293	AGC	2	6	138822	138827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191174
1749	NC_017293	TCA	2	6	138840	138845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191174
1750	NC_017293	TG	3	6	138916	138921	0 %	50 %	50 %	0 %	409191174

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