MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 22139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017292	CTCA	2	8	585535	585542	25 %	25 %	0 %	50 %	384454540
11003	NC_017292	GCAA	2	8	585585	585592	50 %	0 %	25 %	25 %	384454540
11004	NC_017292	GTG	2	6	585620	585625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454540
11005	NC_017292	TGA	2	6	585649	585654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454540
11006	NC_017292	TAG	2	6	585660	585665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454540
11007	NC_017292	CTT	2	6	585684	585689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454540
11008	NC_017292	CT	3	6	585818	585823	0 %	50 %	0 %	50 %	384454540
11009	NC_017292	TGC	2	6	585902	585907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454540
11010	NC_017292	GA	3	6	585921	585926	50 %	0 %	50 %	0 %	384454540
11011	NC_017292	TCC	2	6	585967	585972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454540
11012	NC_017292	AAG	2	6	586039	586044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454540
11013	NC_017292	TTCTT	2	10	586196	586205	0 %	80 %	0 %	20 %	384454540
11014	NC_017292	TCC	2	6	586260	586265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454540
11015	NC_017292	TAG	2	6	586280	586285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454540
11016	NC_017292	GCT	2	6	586310	586315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454540
11017	NC_017292	GAA	2	6	586377	586382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454540
11018	NC_017292	AAG	2	6	586405	586410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454540
11019	NC_017292	ATT	2	6	586480	586485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454540
11020	NC_017292	CAA	2	6	586545	586550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454540
11021	NC_017292	TTAG	2	8	586738	586745	25 %	50 %	25 %	0 %	384454541
11022	NC_017292	ATG	2	6	586771	586776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454541
11023	NC_017292	A	6	6	586779	586784	100 %	0 %	0 %	0 %	384454541
11024	NC_017292	TGA	2	6	586804	586809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454541
11025	NC_017292	CTA	2	6	586812	586817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454541
11026	NC_017292	CTA	2	6	586869	586874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454541
11027	NC_017292	A	7	7	586948	586954	100 %	0 %	0 %	0 %	384454541
11028	NC_017292	TCC	2	6	586975	586980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454541
11029	NC_017292	GA	3	6	587031	587036	50 %	0 %	50 %	0 %	384454541
11030	NC_017292	C	7	7	587115	587121	0 %	0 %	0 %	100 %	384454541
11031	NC_017292	AGC	2	6	587143	587148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454541
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11033	NC_017292	GCCA	2	8	587257	587264	25 %	0 %	25 %	50 %	384454541
11034	NC_017292	TGA	2	6	587288	587293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454541
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11036	NC_017292	AAT	2	6	587384	587389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454541
11037	NC_017292	AAATAA	2	12	587393	587404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384454541
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11040	NC_017292	TGC	2	6	587684	587689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454542
11041	NC_017292	ATT	2	6	587817	587822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454542
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11043	NC_017292	A	6	6	587877	587882	100 %	0 %	0 %	0 %	384454542
11044	NC_017292	T	6	6	587928	587933	0 %	100 %	0 %	0 %	384454542
11045	NC_017292	TAAG	2	8	587953	587960	50 %	25 %	25 %	0 %	384454542
11046	NC_017292	ATT	2	6	588000	588005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454542
11047	NC_017292	TTAT	2	8	588055	588062	25 %	75 %	0 %	0 %	384454542
11048	NC_017292	CT	4	8	588106	588113	0 %	50 %	0 %	50 %	384454542
11049	NC_017292	GCT	2	6	588153	588158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454542
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11051	NC_017292	GCT	2	6	588168	588173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454542
11052	NC_017292	GA	3	6	588215	588220	50 %	0 %	50 %	0 %	384454542
11053	NC_017292	TA	3	6	588306	588311	50 %	50 %	0 %	0 %	384454542
11054	NC_017292	GA	3	6	588432	588437	50 %	0 %	50 %	0 %	384454542
11055	NC_017292	T	7	7	588440	588446	0 %	100 %	0 %	0 %	384454542
11056	NC_017292	T	6	6	588474	588479	0 %	100 %	0 %	0 %	384454542
11057	NC_017292	TTA	2	6	588495	588500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454542
11058	NC_017292	ATA	2	6	588506	588511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454542
11059	NC_017292	ATG	2	6	588608	588613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454543
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11061	NC_017292	CAG	2	6	588632	588637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454543
11062	NC_017292	TAT	2	6	588652	588657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454543
11063	NC_017292	CTT	2	6	588671	588676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454543
11064	NC_017292	GAA	2	6	588694	588699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454543
11065	NC_017292	ATA	2	6	588722	588727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454543
11066	NC_017292	GTA	2	6	588794	588799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454543
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11069	NC_017292	AG	4	8	588901	588908	50 %	0 %	50 %	0 %	384454543
11070	NC_017292	TCCA	2	8	588919	588926	25 %	25 %	0 %	50 %	384454543
11071	NC_017292	TTA	2	6	588937	588942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454543
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11073	NC_017292	TC	3	6	589044	589049	0 %	50 %	0 %	50 %	384454543
11074	NC_017292	AG	3	6	589062	589067	50 %	0 %	50 %	0 %	384454543
11075	NC_017292	TCT	2	6	589162	589167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454544
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11080	NC_017292	T	7	7	589508	589514	0 %	100 %	0 %	0 %	384454544
11081	NC_017292	ATG	2	6	589519	589524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454544
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11086	NC_017292	GAT	2	6	589701	589706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454544
11087	NC_017292	CAG	2	6	589709	589714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454544
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11089	NC_017292	CGA	2	6	589844	589849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454544
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11091	NC_017292	TCC	2	6	589911	589916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454544
11092	NC_017292	TCT	2	6	590597	590602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454545
11093	NC_017292	AAAGA	2	10	590744	590753	80 %	0 %	20 %	0 %	384454545
11094	NC_017292	CAT	2	6	590766	590771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454545
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11097	NC_017292	TGT	2	6	590969	590974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454545
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11099	NC_017292	CAG	2	6	591030	591035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454545
11100	NC_017292	TTC	2	6	591054	591059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454545
11101	NC_017292	TGAT	2	8	591074	591081	25 %	50 %	25 %	0 %	384454545
11102	NC_017292	GTA	2	6	591260	591265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454545
11103	NC_017292	TA	3	6	591274	591279	50 %	50 %	0 %	0 %	384454545
11104	NC_017292	TAA	2	6	591301	591306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454545
11105	NC_017292	TCA	2	6	591347	591352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454545
11106	NC_017292	T	7	7	591464	591470	0 %	100 %	0 %	0 %	384454546
11107	NC_017292	TGT	2	6	591488	591493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454546
11108	NC_017292	CTTG	2	8	591518	591525	0 %	50 %	25 %	25 %	384454546
11109	NC_017292	TCT	2	6	591536	591541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454546
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11111	NC_017292	TCA	2	6	591744	591749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454546
11112	NC_017292	TCA	2	6	591767	591772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454546
11113	NC_017292	GAT	2	6	591774	591779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454546
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11116	NC_017292	TGCT	2	8	591941	591948	0 %	50 %	25 %	25 %	384454546
11117	NC_017292	AAAG	2	8	592046	592053	75 %	0 %	25 %	0 %	384454546
11118	NC_017292	A	7	7	592327	592333	100 %	0 %	0 %	0 %	384454547
11119	NC_017292	CCATGC	2	12	592349	592360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384454547
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11234	NC_017292	TACC	2	8	598049	598056	25 %	25 %	0 %	50 %	384454553
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11237	NC_017292	G	7	7	598118	598124	0 %	0 %	100 %	0 %	384454553
11238	NC_017292	GCAT	2	8	598279	598286	25 %	25 %	25 %	25 %	384454553
11239	NC_017292	TCT	2	6	598300	598305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454553
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