MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 21898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017290	A	6	6	240414	240419	100 %	0 %	0 %	0 %	384452304
4503	NC_017290	A	6	6	240439	240444	100 %	0 %	0 %	0 %	384452304
4504	NC_017290	TAG	2	6	240545	240550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452304
4505	NC_017290	T	6	6	240649	240654	0 %	100 %	0 %	0 %	384452304
4506	NC_017290	AAAT	2	8	240668	240675	75 %	25 %	0 %	0 %	384452304
4507	NC_017290	TCT	2	6	240718	240723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452304
4508	NC_017290	GAG	2	6	240749	240754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452304
4509	NC_017290	CTT	2	6	240757	240762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452304
4510	NC_017290	CGT	2	6	241167	241172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452305
4511	NC_017290	GAA	2	6	241204	241209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452305
4512	NC_017290	ATC	2	6	241251	241256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452305
4513	NC_017290	TAT	2	6	241288	241293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
4514	NC_017290	GAG	2	6	241303	241308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452305
4515	NC_017290	GAT	2	6	241327	241332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
4516	NC_017290	TTCAG	2	10	241357	241366	20 %	40 %	20 %	20 %	384452305
4517	NC_017290	TTG	2	6	241432	241437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452305
4518	NC_017290	CAT	2	6	241549	241554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452305
4519	NC_017290	ATT	2	6	241559	241564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
4520	NC_017290	GTTT	2	8	241670	241677	0 %	75 %	25 %	0 %	384452305
4521	NC_017290	AGG	2	6	241696	241701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452305
4522	NC_017290	TG	3	6	241754	241759	0 %	50 %	50 %	0 %	384452305
4523	NC_017290	ATT	2	6	241794	241799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
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4526	NC_017290	TGA	2	6	241903	241908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
4527	NC_017290	TTG	2	6	241953	241958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452305
4528	NC_017290	CGG	2	6	241960	241965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384452305
4529	NC_017290	TTG	2	6	241971	241976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452305
4530	NC_017290	ATT	2	6	242006	242011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
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4532	NC_017290	ATG	2	6	242108	242113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
4533	NC_017290	GCA	2	6	242138	242143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452305
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4535	NC_017290	A	6	6	242183	242188	100 %	0 %	0 %	0 %	384452305
4536	NC_017290	TCA	2	6	242194	242199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452305
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4538	NC_017290	AT	3	6	242334	242339	50 %	50 %	0 %	0 %	384452305
4539	NC_017290	TGA	2	6	242458	242463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
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4541	NC_017290	ATT	2	6	242483	242488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
4542	NC_017290	TGA	2	6	242527	242532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
4543	NC_017290	GAA	2	6	242576	242581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452305
4544	NC_017290	TTA	2	6	242603	242608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
4545	NC_017290	TTTAG	2	10	242647	242656	20 %	60 %	20 %	0 %	384452305
4546	NC_017290	AG	3	6	242717	242722	50 %	0 %	50 %	0 %	384452306
4547	NC_017290	T	7	7	242748	242754	0 %	100 %	0 %	0 %	384452306
4548	NC_017290	GCA	2	6	242778	242783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452306
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4550	NC_017290	ATG	2	6	242904	242909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452306
4551	NC_017290	ACT	2	6	242922	242927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452306
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4553	NC_017290	CGT	2	6	242988	242993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452306
4554	NC_017290	G	6	6	243039	243044	0 %	0 %	100 %	0 %	384452306
4555	NC_017290	TTTA	2	8	243121	243128	25 %	75 %	0 %	0 %	384452306
4556	NC_017290	ATCG	2	8	243168	243175	25 %	25 %	25 %	25 %	384452306
4557	NC_017290	AAT	2	6	243318	243323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452307
4558	NC_017290	TTC	2	6	243368	243373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452307
4559	NC_017290	CTT	2	6	243374	243379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452307
4560	NC_017290	CTG	2	6	243383	243388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452307
4561	NC_017290	TTA	2	6	243398	243403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452307
4562	NC_017290	ATG	2	6	243410	243415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452307
4563	NC_017290	TG	3	6	243434	243439	0 %	50 %	50 %	0 %	384452307
4564	NC_017290	GTTGT	2	10	243452	243461	0 %	60 %	40 %	0 %	384452307
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4588	NC_017290	TTC	2	6	245040	245045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452308
4589	NC_017290	GAC	3	9	245052	245060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452308
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4593	NC_017290	GTT	2	6	245223	245228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452309
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4601	NC_017290	TTATC	2	10	245757	245766	20 %	60 %	0 %	20 %	384452309
4602	NC_017290	TTG	2	6	245810	245815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452310
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4604	NC_017290	TCT	3	9	245862	245870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452310
4605	NC_017290	AGT	2	6	245893	245898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452310
4606	NC_017290	GCT	2	6	245952	245957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452310
4607	NC_017290	AG	3	6	245982	245987	50 %	0 %	50 %	0 %	384452310
4608	NC_017290	CTT	2	6	245998	246003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452310
4609	NC_017290	GAT	2	6	246025	246030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452310
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4611	NC_017290	CAT	2	6	246184	246189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452310
4612	NC_017290	ATT	2	6	246258	246263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452310
4613	NC_017290	CTTT	2	8	246273	246280	0 %	75 %	0 %	25 %	384452310
4614	NC_017290	AGC	2	6	246284	246289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452310
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4618	NC_017290	T	7	7	246601	246607	0 %	100 %	0 %	0 %	384452311
4619	NC_017290	AGA	2	6	246652	246657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452311
4620	NC_017290	TG	3	6	246686	246691	0 %	50 %	50 %	0 %	384452311
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4622	NC_017290	TGA	2	6	246827	246832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452311
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