MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017287	CGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
2	NC_017287	AGA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450096
3	NC_017287	CTT	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
4	NC_017287	T	7	7	164	170	0 %	100 %	0 %	0 %	384450096
5	NC_017287	AAGG	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	384450096
6	NC_017287	A	6	6	182	187	100 %	0 %	0 %	0 %	384450096
7	NC_017287	GT	3	6	217	222	0 %	50 %	50 %	0 %	384450096
8	NC_017287	TCT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
9	NC_017287	A	7	7	386	392	100 %	0 %	0 %	0 %	384450096
10	NC_017287	TG	3	6	406	411	0 %	50 %	50 %	0 %	384450096
11	NC_017287	TAT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450096
12	NC_017287	ATG	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450096
13	NC_017287	GCGT	2	8	496	503	0 %	25 %	50 %	25 %	384450096
14	NC_017287	TGT	2	6	548	553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450096
15	NC_017287	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450096
16	NC_017287	TC	3	6	635	640	0 %	50 %	0 %	50 %	384450096
17	NC_017287	ACA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450096
18	NC_017287	AGC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
19	NC_017287	GTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450096
20	NC_017287	AGC	3	9	908	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
21	NC_017287	CTA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450096
22	NC_017287	GGT	2	6	928	933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450096
23	NC_017287	CTT	2	6	1036	1041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
24	NC_017287	CTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
25	NC_017287	AC	3	6	1203	1208	50 %	0 %	0 %	50 %	384450097
26	NC_017287	TTAA	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	384450097
27	NC_017287	ACA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450097
28	NC_017287	ATG	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
29	NC_017287	GT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	50 %	0 %	384450097
30	NC_017287	TTA	2	6	1420	1425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450097
31	NC_017287	TAG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
32	NC_017287	TC	3	6	1492	1497	0 %	50 %	0 %	50 %	384450097
33	NC_017287	TAG	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
34	NC_017287	CTA	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450097
35	NC_017287	TTC	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
36	NC_017287	TG	3	6	1796	1801	0 %	50 %	50 %	0 %	384450097
37	NC_017287	ATA	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450097
38	NC_017287	CTT	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
39	NC_017287	GAA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450097
40	NC_017287	TGA	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
41	NC_017287	GAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
42	NC_017287	GTT	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450097
43	NC_017287	CTT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
44	NC_017287	T	6	6	2118	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	384450097
45	NC_017287	T	8	8	2197	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	384450097
46	NC_017287	TAA	2	6	2276	2281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450097
47	NC_017287	GAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450097
48	NC_017287	AGAT	2	8	2451	2458	50 %	25 %	25 %	0 %	384450097
49	NC_017287	T	8	8	2525	2532	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
50	NC_017287	T	8	8	2537	2544	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
51	NC_017287	AGT	2	6	2551	2556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450098
52	NC_017287	TTA	2	6	2564	2569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
53	NC_017287	TCC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450098
54	NC_017287	T	6	6	2638	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
55	NC_017287	TTC	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450098
56	NC_017287	GA	3	6	2694	2699	50 %	0 %	50 %	0 %	384450098
57	NC_017287	TTA	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
58	NC_017287	TGTT	2	8	2749	2756	0 %	75 %	25 %	0 %	384450098
59	NC_017287	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
60	NC_017287	T	6	6	2805	2810	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
61	NC_017287	AGA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450098
62	NC_017287	GAAG	2	8	2860	2867	50 %	0 %	50 %	0 %	384450098
63	NC_017287	TAT	2	6	2880	2885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
64	NC_017287	AGTA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	384450098
65	NC_017287	TAT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
66	NC_017287	T	6	6	2919	2924	0 %	100 %	0 %	0 %	384450098
67	NC_017287	GAA	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
68	NC_017287	TTTG	2	8	3208	3215	0 %	75 %	25 %	0 %	384450099
69	NC_017287	TCCT	2	8	3234	3241	0 %	50 %	0 %	50 %	384450099
70	NC_017287	GA	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	384450099
71	NC_017287	GAAAA	2	10	3264	3273	80 %	0 %	20 %	0 %	384450099
72	NC_017287	ATG	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
73	NC_017287	AGT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
74	NC_017287	CTT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450099
75	NC_017287	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450099
76	NC_017287	ATG	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
77	NC_017287	ATC	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450099
78	NC_017287	TGG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450099
79	NC_017287	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
80	NC_017287	T	6	6	4099	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	384450099
81	NC_017287	TAA	2	6	4117	4122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450099
82	NC_017287	AT	3	6	4135	4140	50 %	50 %	0 %	0 %	384450099
83	NC_017287	GAA	2	6	4154	4159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
84	NC_017287	AGC	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450099
85	NC_017287	TAA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450099
86	NC_017287	AGGAG	2	10	4321	4330	40 %	0 %	60 %	0 %	384450099
87	NC_017287	AGA	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
88	NC_017287	CTT	2	6	4358	4363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450099
89	NC_017287	ATG	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
90	NC_017287	GAT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
91	NC_017287	GCT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450099
92	NC_017287	CT	3	6	4637	4642	0 %	50 %	0 %	50 %	384450099
93	NC_017287	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
94	NC_017287	CTGTGG	2	12	4728	4739	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384450099
95	NC_017287	AAG	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
96	NC_017287	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450099
97	NC_017287	AAG	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
98	NC_017287	AGA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
99	NC_017287	TTA	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450099
100	NC_017287	CAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450099
101	NC_017287	GAAA	2	8	5163	5170	75 %	0 %	25 %	0 %	384450099
102	NC_017287	T	7	7	5365	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	384450100
103	NC_017287	AGA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450100
104	NC_017287	CGAG	2	8	5434	5441	25 %	0 %	50 %	25 %	384450100
105	NC_017287	TGG	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450100
106	NC_017287	TAT	2	6	5529	5534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450100
107	NC_017287	GTT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
108	NC_017287	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
109	NC_017287	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
110	NC_017287	TGT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
111	NC_017287	GGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450100
112	NC_017287	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	384450100
113	NC_017287	CAA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
114	NC_017287	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
115	NC_017287	GAT	2	6	5839	5844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
116	NC_017287	TGT	3	9	5891	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
117	NC_017287	TGA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
118	NC_017287	GCT	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450100
119	NC_017287	T	7	7	5980	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	384450100
120	NC_017287	TGC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450100
121	NC_017287	TGA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
122	NC_017287	GAA	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450100
123	NC_017287	A	6	6	6186	6191	100 %	0 %	0 %	0 %	384450100
124	NC_017287	GAG	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450100
125	NC_017287	TTC	2	6	6205	6210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450100
126	NC_017287	CCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450100
127	NC_017287	CTT	2	6	6258	6263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450100
128	NC_017287	GTT	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
129	NC_017287	CT	3	6	6377	6382	0 %	50 %	0 %	50 %	384450100
130	NC_017287	T	6	6	6392	6397	0 %	100 %	0 %	0 %	384450100
131	NC_017287	ACA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
132	NC_017287	ATA	2	6	6498	6503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450100
133	NC_017287	CAA	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
134	NC_017287	GA	3	6	6801	6806	50 %	0 %	50 %	0 %	384450101
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136	NC_017287	CAT	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450101
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399	NC_017287	GCCTA	2	10	19812	19821	20 %	20 %	20 %	40 %	384450108
400	NC_017287	A	7	7	19876	19882	100 %	0 %	0 %	0 %	384450108
401	NC_017287	GTT	2	6	19934	19939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450108
402	NC_017287	TAC	2	6	19993	19998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450108
403	NC_017287	AC	3	6	20022	20027	50 %	0 %	0 %	50 %	384450108
404	NC_017287	ATC	2	6	20044	20049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450108
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422	NC_017287	GTT	2	6	20980	20985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450109
423	NC_017287	TAAA	2	8	20996	21003	75 %	25 %	0 %	0 %	384450109
424	NC_017287	AGTGT	2	10	21026	21035	20 %	40 %	40 %	0 %	384450109
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