MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017287	TTCT	2	8	24835	24842	0 %	75 %	0 %	25 %	384450112
502	NC_017287	ATC	2	6	24850	24855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450112
503	NC_017287	ACC	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450112
504	NC_017287	TAGT	2	8	24893	24900	25 %	50 %	25 %	0 %	384450112
505	NC_017287	TTG	2	6	24918	24923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
506	NC_017287	TTG	2	6	24928	24933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
507	NC_017287	ATT	2	6	25021	25026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
508	NC_017287	TTC	2	6	25147	25152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
509	NC_017287	TTG	2	6	25297	25302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
510	NC_017287	GAAC	2	8	25352	25359	50 %	0 %	25 %	25 %	384450112
511	NC_017287	CAG	2	6	25377	25382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450112
512	NC_017287	TA	3	6	25412	25417	50 %	50 %	0 %	0 %	384450112
513	NC_017287	GCA	2	6	25418	25423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450112
514	NC_017287	GTT	2	6	25451	25456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
515	NC_017287	AG	3	6	25519	25524	50 %	0 %	50 %	0 %	384450112
516	NC_017287	TAA	2	6	25551	25556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450112
517	NC_017287	CTT	3	9	25557	25565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
518	NC_017287	TTA	2	6	25586	25591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
519	NC_017287	TTA	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
520	NC_017287	TAT	2	6	25698	25703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
521	NC_017287	TCA	2	6	25704	25709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450112
522	NC_017287	CCA	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450112
523	NC_017287	TGG	2	6	25731	25736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450112
524	NC_017287	A	6	6	25774	25779	100 %	0 %	0 %	0 %	384450112
525	NC_017287	ATTC	2	8	25791	25798	25 %	50 %	0 %	25 %	384450112
526	NC_017287	TTC	2	6	25804	25809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
527	NC_017287	TCT	2	6	25826	25831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
528	NC_017287	T	6	6	25903	25908	0 %	100 %	0 %	0 %	384450112
529	NC_017287	TTTC	2	8	25923	25930	0 %	75 %	0 %	25 %	384450112
530	NC_017287	ATT	2	6	25948	25953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
531	NC_017287	ATAG	2	8	26018	26025	50 %	25 %	25 %	0 %	384450112
532	NC_017287	AAT	2	6	26026	26031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450112
533	NC_017287	TGT	2	6	26119	26124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
534	NC_017287	AGG	2	6	26203	26208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450112
535	NC_017287	AAC	2	6	26237	26242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450112
536	NC_017287	TAAA	2	8	26382	26389	75 %	25 %	0 %	0 %	384450112
537	NC_017287	TA	3	6	26422	26427	50 %	50 %	0 %	0 %	384450112
538	NC_017287	AGA	2	6	26431	26436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450112
539	NC_017287	TTA	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
540	NC_017287	A	6	6	26681	26686	100 %	0 %	0 %	0 %	384450113
541	NC_017287	CCA	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450113
542	NC_017287	TTA	2	6	26732	26737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
543	NC_017287	CAA	2	6	26810	26815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
544	NC_017287	TGA	2	6	26818	26823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
545	NC_017287	AGA	2	6	26866	26871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
546	NC_017287	TAA	2	6	26881	26886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450113
547	NC_017287	CTG	2	6	26964	26969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
548	NC_017287	GTA	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
549	NC_017287	ACA	2	6	27022	27027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
550	NC_017287	TTA	2	6	27041	27046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
551	NC_017287	A	6	6	27056	27061	100 %	0 %	0 %	0 %	384450113
552	NC_017287	CTGG	2	8	27095	27102	0 %	25 %	50 %	25 %	384450113
553	NC_017287	AAG	2	6	27183	27188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
554	NC_017287	AGC	2	6	27199	27204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
555	NC_017287	TA	3	6	27282	27287	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
556	NC_017287	TCT	2	6	27323	27328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450113
557	NC_017287	GGT	2	6	27338	27343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450113
558	NC_017287	TC	3	6	27367	27372	0 %	50 %	0 %	50 %	384450113
559	NC_017287	AGA	3	9	27472	27480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
560	NC_017287	ACA	2	6	27502	27507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
561	NC_017287	GCT	2	6	27677	27682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
562	NC_017287	GTT	2	6	27701	27706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450113
563	NC_017287	CAG	2	6	27826	27831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
564	NC_017287	CGC	2	6	27832	27837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384450113
565	NC_017287	AATT	2	8	27868	27875	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
566	NC_017287	TGA	2	6	27883	27888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
567	NC_017287	AAC	2	6	27900	27905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
568	NC_017287	TAA	2	6	27916	27921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450113
569	NC_017287	TA	3	6	27959	27964	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
570	NC_017287	TTG	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450113
571	NC_017287	CTA	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450113
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573	NC_017287	AAG	2	6	28050	28055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
574	NC_017287	GAC	2	6	28105	28110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
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576	NC_017287	CAA	2	6	28196	28201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
577	NC_017287	GCA	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
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579	NC_017287	TGC	2	6	28618	28623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
580	NC_017287	CAG	2	6	28655	28660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
581	NC_017287	CTG	2	6	28662	28667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
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593	NC_017287	GAA	2	6	29329	29334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450114
594	NC_017287	AGGG	2	8	29340	29347	25 %	0 %	75 %	0 %	384450114
595	NC_017287	GCCAC	2	10	29355	29364	20 %	0 %	20 %	60 %	384450114
596	NC_017287	CAA	2	6	29370	29375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450114
597	NC_017287	TGT	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450114
598	NC_017287	ACT	2	6	29472	29477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450114
599	NC_017287	AAG	2	6	29494	29499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450114
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607	NC_017287	TAA	2	6	29674	29679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450115
608	NC_017287	AGAA	2	8	29699	29706	75 %	0 %	25 %	0 %	384450115
609	NC_017287	CGT	2	6	29820	29825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450115
610	NC_017287	AG	3	6	29834	29839	50 %	0 %	50 %	0 %	384450115
611	NC_017287	T	6	6	29849	29854	0 %	100 %	0 %	0 %	384450115
612	NC_017287	ATC	2	6	29879	29884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450115
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615	NC_017287	GTT	2	6	30117	30122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450115
616	NC_017287	TAG	2	6	30143	30148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450115
617	NC_017287	ACCA	2	8	30149	30156	50 %	0 %	0 %	50 %	384450115
618	NC_017287	CGT	2	6	30184	30189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450115
619	NC_017287	T	6	6	30200	30205	0 %	100 %	0 %	0 %	384450115
620	NC_017287	T	6	6	30213	30218	0 %	100 %	0 %	0 %	384450115
621	NC_017287	CCT	2	6	30292	30297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450116
622	NC_017287	AG	3	6	30495	30500	50 %	0 %	50 %	0 %	384450116
623	NC_017287	A	6	6	30537	30542	100 %	0 %	0 %	0 %	384450116
624	NC_017287	T	7	7	30582	30588	0 %	100 %	0 %	0 %	384450116
625	NC_017287	AGG	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450116
626	NC_017287	TTG	2	6	30674	30679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450116
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628	NC_017287	AGC	2	6	30902	30907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450117
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