MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017285	AAAC	2	8	1165937	1165944	75 %	0 %	0 %	25 %	384450019
21502	NC_017285	AATGA	2	10	1165955	1165964	60 %	20 %	20 %	0 %	384450019
21503	NC_017285	GCA	2	6	1166036	1166041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450019
21504	NC_017285	GCT	2	6	1166218	1166223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21505	NC_017285	A	7	7	1166271	1166277	100 %	0 %	0 %	0 %	384450020
21506	NC_017285	ACT	2	6	1166293	1166298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450020
21507	NC_017285	AGT	2	6	1166302	1166307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450020
21508	NC_017285	A	6	6	1166315	1166320	100 %	0 %	0 %	0 %	384450020
21509	NC_017285	GCAAGT	2	12	1166359	1166370	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384450020
21510	NC_017285	AAT	2	6	1166419	1166424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450020
21511	NC_017285	A	6	6	1166482	1166487	100 %	0 %	0 %	0 %	384450020
21512	NC_017285	CTC	2	6	1166506	1166511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450020
21513	NC_017285	TGC	2	6	1166538	1166543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21514	NC_017285	CTG	2	6	1166747	1166752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21515	NC_017285	GCT	2	6	1166812	1166817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21516	NC_017285	TGC	2	6	1166823	1166828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21517	NC_017285	TTC	2	6	1166853	1166858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450020
21518	NC_017285	GGC	2	6	1166889	1166894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450020
21519	NC_017285	AAC	2	6	1166895	1166900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450020
21520	NC_017285	AGC	2	6	1166901	1166906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21521	NC_017285	CAG	2	6	1166921	1166926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21522	NC_017285	CCA	2	6	1166927	1166932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450020
21523	NC_017285	GAT	2	6	1166953	1166958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450020
21524	NC_017285	GCA	2	6	1166965	1166970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450020
21525	NC_017285	AGG	2	6	1167009	1167014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450020
21526	NC_017285	TAAA	2	8	1167032	1167039	75 %	25 %	0 %	0 %	384450020
21527	NC_017285	CAT	2	6	1167104	1167109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450020
21528	NC_017285	TTC	2	6	1167126	1167131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450020
21529	NC_017285	CAT	2	6	1167217	1167222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450020
21530	NC_017285	AGCA	2	8	1167290	1167297	50 %	0 %	25 %	25 %	384450020
21531	NC_017285	CAAACA	2	12	1167379	1167390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450020
21532	NC_017285	TAAT	2	8	1167405	1167412	50 %	50 %	0 %	0 %	384450020
21533	NC_017285	CTTTA	2	10	1167476	1167485	20 %	60 %	0 %	20 %	384450021
21534	NC_017285	GAC	2	6	1167527	1167532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450021
21535	NC_017285	CCA	2	6	1167539	1167544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450021
21536	NC_017285	TC	3	6	1167584	1167589	0 %	50 %	0 %	50 %	384450021
21537	NC_017285	GAAAG	2	10	1167646	1167655	60 %	0 %	40 %	0 %	384450021
21538	NC_017285	GAA	2	6	1167658	1167663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450021
21539	NC_017285	TAA	2	6	1167672	1167677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450021
21540	NC_017285	CAAAT	2	10	1167697	1167706	60 %	20 %	0 %	20 %	384450021
21541	NC_017285	AT	3	6	1167749	1167754	50 %	50 %	0 %	0 %	384450021
21542	NC_017285	TGAT	2	8	1167800	1167807	25 %	50 %	25 %	0 %	384450021
21543	NC_017285	AAG	2	6	1167882	1167887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450021
21544	NC_017285	AAG	2	6	1167899	1167904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450021
21545	NC_017285	TGC	2	6	1167912	1167917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450021
21546	NC_017285	TCC	2	6	1167975	1167980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450021
21547	NC_017285	CCA	2	6	1167982	1167987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450021
21548	NC_017285	A	6	6	1168076	1168081	100 %	0 %	0 %	0 %	384450021
21549	NC_017285	GA	3	6	1168097	1168102	50 %	0 %	50 %	0 %	384450021
21550	NC_017285	ATAA	2	8	1168107	1168114	75 %	25 %	0 %	0 %	384450021
21551	NC_017285	AT	3	6	1168201	1168206	50 %	50 %	0 %	0 %	384450021
21552	NC_017285	TTC	2	6	1168216	1168221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450021
21553	NC_017285	CAA	2	6	1168229	1168234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450021
21554	NC_017285	GCA	2	6	1168252	1168257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450021
21555	NC_017285	AGA	3	9	1168347	1168355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450021
21556	NC_017285	AAAT	2	8	1168358	1168365	75 %	25 %	0 %	0 %	384450021
21557	NC_017285	GAT	2	6	1168593	1168598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450022
21558	NC_017285	A	7	7	1168616	1168622	100 %	0 %	0 %	0 %	384450022
21559	NC_017285	TAC	2	6	1168641	1168646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450022
21560	NC_017285	AGC	2	6	1168647	1168652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450022
21561	NC_017285	A	6	6	1168671	1168676	100 %	0 %	0 %	0 %	384450022
21562	NC_017285	TCA	2	6	1168680	1168685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450022
21563	NC_017285	AACG	2	8	1168705	1168712	50 %	0 %	25 %	25 %	384450022
21564	NC_017285	CCAC	2	8	1168727	1168734	25 %	0 %	0 %	75 %	384450022
21565	NC_017285	TTC	2	6	1168796	1168801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450022
21566	NC_017285	TCT	2	6	1168815	1168820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450022
21567	NC_017285	TTG	2	6	1168961	1168966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450022
21568	NC_017285	CAA	2	6	1169008	1169013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450022
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21570	NC_017285	T	6	6	1169107	1169112	0 %	100 %	0 %	0 %	384450022
21571	NC_017285	A	7	7	1169292	1169298	100 %	0 %	0 %	0 %	384450022
21572	NC_017285	ACC	2	6	1169303	1169308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450022
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21575	NC_017285	CA	3	6	1169428	1169433	50 %	0 %	0 %	50 %	384450022
21576	NC_017285	TGA	2	6	1169468	1169473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450022
21577	NC_017285	CGA	2	6	1169541	1169546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450022
21578	NC_017285	ATGC	2	8	1169583	1169590	25 %	25 %	25 %	25 %	384450022
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21582	NC_017285	GAT	2	6	1169719	1169724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450022
21583	NC_017285	TTC	2	6	1169774	1169779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450022
21584	NC_017285	AGTT	2	8	1169780	1169787	25 %	50 %	25 %	0 %	384450022
21585	NC_017285	GAT	2	6	1169863	1169868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450022
21586	NC_017285	TTCC	2	8	1170037	1170044	0 %	50 %	0 %	50 %	384450022
21587	NC_017285	ATC	2	6	1170205	1170210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450022
21588	NC_017285	GTC	2	6	1170277	1170282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450022
21589	NC_017285	GTAA	2	8	1170307	1170314	50 %	25 %	25 %	0 %	384450022
21590	NC_017285	ATG	2	6	1170425	1170430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450022
21591	NC_017285	AG	3	6	1170438	1170443	50 %	0 %	50 %	0 %	384450022
21592	NC_017285	GAA	2	6	1170463	1170468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450022
21593	NC_017285	ATT	2	6	1170492	1170497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450022
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21597	NC_017285	CTG	2	6	1170787	1170792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450023
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21600	NC_017285	CTC	2	6	1170913	1170918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450023
21601	NC_017285	TTG	2	6	1170926	1170931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450023
21602	NC_017285	TGC	2	6	1170953	1170958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450023
21603	NC_017285	CTGG	2	8	1171017	1171024	0 %	25 %	50 %	25 %	384450023
21604	NC_017285	GCTGA	2	10	1171119	1171128	20 %	20 %	40 %	20 %	384450023
21605	NC_017285	ATT	2	6	1171252	1171257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450023
21606	NC_017285	TTA	2	6	1171284	1171289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450023
21607	NC_017285	CTC	2	6	1171403	1171408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450024
21608	NC_017285	GAA	2	6	1171501	1171506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450024
21609	NC_017285	CTG	2	6	1171535	1171540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450024
21610	NC_017285	CAT	2	6	1171555	1171560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450024
21611	NC_017285	TCT	2	6	1171636	1171641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450024
21612	NC_017285	T	6	6	1171683	1171688	0 %	100 %	0 %	0 %	384450024
21613	NC_017285	TAC	2	6	1171693	1171698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450024
21614	NC_017285	CTT	2	6	1171711	1171716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450024
21615	NC_017285	A	8	8	1171796	1171803	100 %	0 %	0 %	0 %	384450024
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