MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017285	TTC	2	6	835123	835128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449733
15503	NC_017285	TCA	2	6	835132	835137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15504	NC_017285	ATC	2	6	835149	835154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15505	NC_017285	AGC	2	6	835159	835164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449733
15506	NC_017285	AAT	2	6	835166	835171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449733
15507	NC_017285	CTT	3	9	835172	835180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449733
15508	NC_017285	TCT	2	6	835192	835197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449733
15509	NC_017285	CTTC	2	8	835208	835215	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15510	NC_017285	TGCC	2	8	835230	835237	0 %	25 %	25 %	50 %	384449733
15511	NC_017285	TC	3	6	835241	835246	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15512	NC_017285	CCAT	2	8	835265	835272	25 %	25 %	0 %	50 %	384449733
15513	NC_017285	CTA	2	6	835340	835345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15514	NC_017285	CT	3	6	835440	835445	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15515	NC_017285	GAT	2	6	835448	835453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449733
15516	NC_017285	GTAC	2	8	835462	835469	25 %	25 %	25 %	25 %	384449733
15517	NC_017285	TC	3	6	835500	835505	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15518	NC_017285	TGT	2	6	835628	835633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449733
15519	NC_017285	AGT	2	6	835672	835677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449733
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15521	NC_017285	ATC	2	6	835726	835731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15522	NC_017285	TTC	2	6	835797	835802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449733
15523	NC_017285	CAT	2	6	835815	835820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15524	NC_017285	TCT	2	6	835876	835881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449733
15525	NC_017285	CCT	2	6	835904	835909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449733
15526	NC_017285	AG	3	6	835914	835919	50 %	0 %	50 %	0 %	384449733
15527	NC_017285	TGCTCT	2	12	835978	835989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384449733
15528	NC_017285	GTG	2	6	835998	836003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449733
15529	NC_017285	TTTCT	2	10	836007	836016	0 %	80 %	0 %	20 %	384449733
15530	NC_017285	T	6	6	836046	836051	0 %	100 %	0 %	0 %	384449733
15531	NC_017285	TC	3	6	836061	836066	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15532	NC_017285	CT	4	8	836072	836079	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15533	NC_017285	CT	3	6	836112	836117	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15534	NC_017285	TC	3	6	836220	836225	0 %	50 %	0 %	50 %	384449733
15535	NC_017285	GCT	2	6	836236	836241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449733
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15537	NC_017285	CAT	2	6	836364	836369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449733
15538	NC_017285	TACG	2	8	836378	836385	25 %	25 %	25 %	25 %	384449733
15539	NC_017285	TCC	2	6	836440	836445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449733
15540	NC_017285	CAA	2	6	836446	836451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449733
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15543	NC_017285	CCT	2	6	836714	836719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449733
15544	NC_017285	CA	3	6	836771	836776	50 %	0 %	0 %	50 %	384449733
15545	NC_017285	AGT	2	6	836786	836791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449733
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15550	NC_017285	CTC	2	6	837221	837226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449733
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15552	NC_017285	CAA	2	6	837315	837320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449733
15553	NC_017285	AG	3	6	840300	840305	50 %	0 %	50 %	0 %	384449734
15554	NC_017285	AG	3	6	840314	840319	50 %	0 %	50 %	0 %	384449734
15555	NC_017285	A	6	6	840360	840365	100 %	0 %	0 %	0 %	384449734
15556	NC_017285	TAT	2	6	841014	841019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449735
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15558	NC_017285	TGC	2	6	841132	841137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449735
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15562	NC_017285	CAA	2	6	841457	841462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449735
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15565	NC_017285	A	6	6	841544	841549	100 %	0 %	0 %	0 %	384449735
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15588	NC_017285	CCCT	2	8	842986	842993	0 %	25 %	0 %	75 %	384449735
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15593	NC_017285	CTA	2	6	843222	843227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449735
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15595	NC_017285	AG	3	6	843373	843378	50 %	0 %	50 %	0 %	384449735
15596	NC_017285	CAA	2	6	843422	843427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449735
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15601	NC_017285	CAT	2	6	843606	843611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449735
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15604	NC_017285	AAG	2	6	843684	843689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449735
15605	NC_017285	A	6	6	843717	843722	100 %	0 %	0 %	0 %	384449735
15606	NC_017285	TAAAAG	2	12	844062	844073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384449736
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15608	NC_017285	CTG	2	6	844103	844108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449736
15609	NC_017285	ACC	2	6	844195	844200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449736
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15611	NC_017285	CAT	2	6	844296	844301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449736
15612	NC_017285	A	6	6	844497	844502	100 %	0 %	0 %	0 %	384449736
15613	NC_017285	TA	3	6	844623	844628	50 %	50 %	0 %	0 %	384449736
15614	NC_017285	CT	3	6	844690	844695	0 %	50 %	0 %	50 %	384449736
15615	NC_017285	T	7	7	844715	844721	0 %	100 %	0 %	0 %	384449736
15616	NC_017285	GGTA	2	8	844739	844746	25 %	25 %	50 %	0 %	384449736
15617	NC_017285	GTT	2	6	844808	844813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449736
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