MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017285	ACA	2	6	538462	538467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449469
10003	NC_017285	TC	3	6	538509	538514	0 %	50 %	0 %	50 %	384449469
10004	NC_017285	A	6	6	538535	538540	100 %	0 %	0 %	0 %	384449469
10005	NC_017285	TTAT	2	8	538566	538573	25 %	75 %	0 %	0 %	384449469
10006	NC_017285	CTC	2	6	538845	538850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449469
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10009	NC_017285	T	6	6	538972	538977	0 %	100 %	0 %	0 %	384449470
10010	NC_017285	TCC	2	6	539003	539008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449470
10011	NC_017285	GAAA	2	8	539012	539019	75 %	0 %	25 %	0 %	384449470
10012	NC_017285	AGA	2	6	539046	539051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449470
10013	NC_017285	GAA	2	6	539080	539085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449470
10014	NC_017285	CTT	2	6	539143	539148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449470
10015	NC_017285	TTGA	2	8	539156	539163	25 %	50 %	25 %	0 %	384449470
10016	NC_017285	CCA	2	6	539256	539261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449470
10017	NC_017285	GATTGA	2	12	539284	539295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449470
10018	NC_017285	TTC	2	6	539303	539308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449470
10019	NC_017285	CTT	2	6	539314	539319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449470
10020	NC_017285	TCA	2	6	539349	539354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449470
10021	NC_017285	AG	3	6	539396	539401	50 %	0 %	50 %	0 %	384449470
10022	NC_017285	TAA	2	6	539408	539413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449470
10023	NC_017285	AAG	2	6	539529	539534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449470
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10025	NC_017285	CGA	2	6	539634	539639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449470
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10027	NC_017285	A	6	6	539977	539982	100 %	0 %	0 %	0 %	384449471
10028	NC_017285	CTGAAG	2	12	540092	540103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384449471
10029	NC_017285	TAG	2	6	540251	540256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449471
10030	NC_017285	AGT	2	6	540480	540485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449471
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10032	NC_017285	A	6	6	540732	540737	100 %	0 %	0 %	0 %	384449471
10033	NC_017285	TTTA	2	8	540757	540764	25 %	75 %	0 %	0 %	384449471
10034	NC_017285	CTTT	2	8	540801	540808	0 %	75 %	0 %	25 %	384449471
10035	NC_017285	TTA	2	6	540813	540818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449471
10036	NC_017285	ACTT	2	8	540865	540872	25 %	50 %	0 %	25 %	384449472
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10040	NC_017285	CT	3	6	541010	541015	0 %	50 %	0 %	50 %	384449472
10041	NC_017285	T	7	7	541017	541023	0 %	100 %	0 %	0 %	384449472
10042	NC_017285	TTA	2	6	541053	541058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449472
10043	NC_017285	GAA	3	9	541065	541073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449472
10044	NC_017285	A	8	8	541093	541100	100 %	0 %	0 %	0 %	384449472
10045	NC_017285	GTA	2	6	541117	541122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449472
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10051	NC_017285	GAA	2	6	541492	541497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449472
10052	NC_017285	TCC	2	6	541567	541572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449472
10053	NC_017285	T	6	6	541650	541655	0 %	100 %	0 %	0 %	384449472
10054	NC_017285	T	6	6	541711	541716	0 %	100 %	0 %	0 %	384449472
10055	NC_017285	TCT	2	6	541743	541748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449472
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10062	NC_017285	GA	3	6	542368	542373	50 %	0 %	50 %	0 %	384449473
10063	NC_017285	CAG	2	6	542395	542400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449473
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10065	NC_017285	CTGC	2	8	542419	542426	0 %	25 %	25 %	50 %	384449473
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10104	NC_017285	T	7	7	544736	544742	0 %	100 %	0 %	0 %	384449475
10105	NC_017285	AAG	2	6	544802	544807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449475
10106	NC_017285	A	8	8	544900	544907	100 %	0 %	0 %	0 %	384449475
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10108	NC_017285	CT	4	8	544969	544976	0 %	50 %	0 %	50 %	384449475
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10111	NC_017285	T	6	6	545190	545195	0 %	100 %	0 %	0 %	384449475
10112	NC_017285	GGGA	2	8	545199	545206	25 %	0 %	75 %	0 %	384449475
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10117	NC_017285	TTG	2	6	545378	545383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449475
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10119	NC_017285	AAG	2	6	545480	545485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449475
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10487	NC_017285	TTA	2	6	565118	565123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449499
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