MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017285	AAC	2	6	351466	351471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449293
6502	NC_017285	CAC	2	6	351481	351486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449293
6503	NC_017285	CTG	2	6	351511	351516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449293
6504	NC_017285	GTT	2	6	351522	351527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449293
6505	NC_017285	TCA	2	6	351576	351581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449293
6506	NC_017285	CTTTT	2	10	351659	351668	0 %	80 %	0 %	20 %	384449293
6507	NC_017285	GAG	2	6	351705	351710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449293
6508	NC_017285	TAC	2	6	351754	351759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449293
6509	NC_017285	T	6	6	351774	351779	0 %	100 %	0 %	0 %	384449293
6510	NC_017285	AG	3	6	351799	351804	50 %	0 %	50 %	0 %	384449293
6511	NC_017285	CTG	2	6	351805	351810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449293
6512	NC_017285	T	7	7	351873	351879	0 %	100 %	0 %	0 %	384449293
6513	NC_017285	CCTC	2	8	351918	351925	0 %	25 %	0 %	75 %	384449293
6514	NC_017285	CA	3	6	351935	351940	50 %	0 %	0 %	50 %	384449293
6515	NC_017285	GCC	2	6	351953	351958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384449293
6516	NC_017285	GAAA	2	8	352010	352017	75 %	0 %	25 %	0 %	384449293
6517	NC_017285	GCA	2	6	352041	352046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449293
6518	NC_017285	CAT	2	6	352048	352053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449293
6519	NC_017285	CAA	2	6	352096	352101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449293
6520	NC_017285	CTC	2	6	352111	352116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449293
6521	NC_017285	GTAG	2	8	352193	352200	25 %	25 %	50 %	0 %	384449293
6522	NC_017285	TGC	2	6	352235	352240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449293
6523	NC_017285	ACT	2	6	352247	352252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449293
6524	NC_017285	GAT	2	6	352272	352277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449293
6525	NC_017285	GA	3	6	352278	352283	50 %	0 %	50 %	0 %	384449293
6526	NC_017285	AGC	2	6	352292	352297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449293
6527	NC_017285	TTCT	2	8	352675	352682	0 %	75 %	0 %	25 %	384449294
6528	NC_017285	GATT	2	8	352780	352787	25 %	50 %	25 %	0 %	384449294
6529	NC_017285	TCT	2	6	352802	352807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449294
6530	NC_017285	TTC	2	6	352824	352829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449294
6531	NC_017285	TGC	2	6	352846	352851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449294
6532	NC_017285	CGG	2	6	352879	352884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384449294
6533	NC_017285	GAA	2	6	352891	352896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449294
6534	NC_017285	TCC	2	6	352920	352925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449294
6535	NC_017285	GCTC	2	8	353016	353023	0 %	25 %	25 %	50 %	384449294
6536	NC_017285	CTT	2	6	353041	353046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449294
6537	NC_017285	TGA	2	6	353059	353064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449294
6538	NC_017285	GGA	2	6	353086	353091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449294
6539	NC_017285	GTTTT	2	10	353129	353138	0 %	80 %	20 %	0 %	384449294
6540	NC_017285	AGA	2	6	353192	353197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449294
6541	NC_017285	CCGA	2	8	353214	353221	25 %	0 %	25 %	50 %	384449294
6542	NC_017285	TCC	2	6	353263	353268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449294
6543	NC_017285	T	6	6	353292	353297	0 %	100 %	0 %	0 %	384449294
6544	NC_017285	T	8	8	353312	353319	0 %	100 %	0 %	0 %	384449294
6545	NC_017285	TCG	2	6	353323	353328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449294
6546	NC_017285	TTTTC	2	10	353369	353378	0 %	80 %	0 %	20 %	384449294
6547	NC_017285	AAT	2	6	353405	353410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449294
6548	NC_017285	AATC	2	8	353454	353461	50 %	25 %	0 %	25 %	384449294
6549	NC_017285	CCA	2	6	353500	353505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449294
6550	NC_017285	GCA	2	6	353536	353541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449294
6551	NC_017285	ACG	2	6	353563	353568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449294
6552	NC_017285	AAT	2	6	353742	353747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449294
6553	NC_017285	TAA	2	6	353795	353800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449294
6554	NC_017285	TGC	3	9	353868	353876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449294
6555	NC_017285	TCA	2	6	354158	354163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449295
6556	NC_017285	G	6	6	354209	354214	0 %	0 %	100 %	0 %	384449295
6557	NC_017285	TAG	2	6	354249	354254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449295
6558	NC_017285	TGG	2	6	354292	354297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449295
6559	NC_017285	G	6	6	354296	354301	0 %	0 %	100 %	0 %	384449295
6560	NC_017285	AGACC	2	10	354318	354327	40 %	0 %	20 %	40 %	384449295
6561	NC_017285	AGCCA	2	10	354359	354368	40 %	0 %	20 %	40 %	384449295
6562	NC_017285	AG	3	6	354417	354422	50 %	0 %	50 %	0 %	384449295
6563	NC_017285	GTAGGG	2	12	354426	354437	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384449295
6564	NC_017285	GCA	2	6	354443	354448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449295
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6570	NC_017285	ATC	2	6	354886	354891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449296
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6573	NC_017285	T	7	7	355039	355045	0 %	100 %	0 %	0 %	384449296
6574	NC_017285	AAGC	2	8	355065	355072	50 %	0 %	25 %	25 %	384449296
6575	NC_017285	ACAG	2	8	355081	355088	50 %	0 %	25 %	25 %	384449296
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6580	NC_017285	AGAA	2	8	355321	355328	75 %	0 %	25 %	0 %	384449296
6581	NC_017285	T	6	6	355346	355351	0 %	100 %	0 %	0 %	384449296
6582	NC_017285	AG	3	6	355375	355380	50 %	0 %	50 %	0 %	384449296
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6594	NC_017285	GAT	2	6	356312	356317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449297
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6601	NC_017285	TCT	2	6	356758	356763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449298
6602	NC_017285	GCT	2	6	356791	356796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449298
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