MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TA	3	6	2681	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	384442306
2	NC_017282	CTAAAT	2	12	2704	2715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442306
3	NC_017282	T	6	6	2723	2728	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
4	NC_017282	ACT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442306
5	NC_017282	TCT	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442306
6	NC_017282	TTC	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442306
7	NC_017282	T	6	6	2839	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
8	NC_017282	T	8	8	2888	2895	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
9	NC_017282	ATT	3	9	2898	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442306
10	NC_017282	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
11	NC_017282	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	384442307
12	NC_017282	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442307
13	NC_017282	ACT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442307
14	NC_017282	TTTCTC	2	12	3106	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442307
15	NC_017282	ATC	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442307
16	NC_017282	AAT	3	9	3220	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
17	NC_017282	TTA	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442307
18	NC_017282	CTTT	2	8	3236	3243	0 %	75 %	0 %	25 %	384442307
19	NC_017282	AAT	2	6	3244	3249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
20	NC_017282	ACC	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442307
21	NC_017282	T	8	8	3303	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	384442307
22	NC_017282	A	6	6	3377	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	384442307
23	NC_017282	ACC	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442307
24	NC_017282	T	6	6	3436	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	384442307
25	NC_017282	ACA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442307
26	NC_017282	AAAT	2	8	3525	3532	75 %	25 %	0 %	0 %	384442308
27	NC_017282	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442308
28	NC_017282	TA	3	6	3646	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
29	NC_017282	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
30	NC_017282	CAT	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442308
31	NC_017282	TCT	2	6	3683	3688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442308
32	NC_017282	TTTA	2	8	3737	3744	25 %	75 %	0 %	0 %	384442308
33	NC_017282	TAT	3	9	3766	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442308
34	NC_017282	TTA	2	6	3789	3794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442309
35	NC_017282	TCT	2	6	3843	3848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
36	NC_017282	CTCTTT	2	12	3849	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
37	NC_017282	TCT	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
38	NC_017282	T	6	6	3915	3920	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
39	NC_017282	ATA	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442309
40	NC_017282	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
41	NC_017282	ATC	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
42	NC_017282	GTT	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442309
43	NC_017282	ATC	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
44	NC_017282	CTT	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
45	NC_017282	T	7	7	4123	4129	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
46	NC_017282	A	7	7	4170	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	384442309
47	NC_017282	TCT	3	9	4204	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
48	NC_017282	AAC	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442309
49	NC_017282	T	6	6	4324	4329	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
50	NC_017282	TAC	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
51	NC_017282	TCC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442310
52	NC_017282	A	6	6	4400	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	384442310
53	NC_017282	AAC	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442310
54	NC_017282	TCA	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
55	NC_017282	TAAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
56	NC_017282	T	6	6	4539	4544	0 %	100 %	0 %	0 %	384442310
57	NC_017282	ATTT	2	8	4577	4584	25 %	75 %	0 %	0 %	384442310
58	NC_017282	A	6	6	4598	4603	100 %	0 %	0 %	0 %	384442310
59	NC_017282	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442310
60	NC_017282	TAA	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442310
61	NC_017282	ATAA	2	8	4736	4743	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
62	NC_017282	AGATA	2	10	4763	4772	60 %	20 %	20 %	0 %	384442310
63	NC_017282	ATC	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
64	NC_017282	ACT	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
65	NC_017282	A	6	6	4818	4823	100 %	0 %	0 %	0 %	384442310
66	NC_017282	CTA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
67	NC_017282	T	7	7	4849	4855	0 %	100 %	0 %	0 %	384442310
68	NC_017282	ATA	2	6	5435	5440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442311
69	NC_017282	A	7	7	5471	5477	100 %	0 %	0 %	0 %	384442311
70	NC_017282	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442311
71	NC_017282	AATC	2	8	5510	5517	50 %	25 %	0 %	25 %	384442311
72	NC_017282	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	384442311
73	NC_017282	AT	3	6	5544	5549	50 %	50 %	0 %	0 %	384442311
74	NC_017282	A	8	8	5565	5572	100 %	0 %	0 %	0 %	384442311
75	NC_017282	TTA	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442311
76	NC_017282	T	6	6	5670	5675	0 %	100 %	0 %	0 %	384442311
77	NC_017282	A	6	6	5702	5707	100 %	0 %	0 %	0 %	384442311
78	NC_017282	T	6	6	5716	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	384442311
79	NC_017282	AAAT	2	8	5744	5751	75 %	25 %	0 %	0 %	384442311
80	NC_017282	TCA	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442311
81	NC_017282	CTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442311
82	NC_017282	GCT	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442311
83	NC_017282	CT	3	6	5888	5893	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
84	NC_017282	CTGCT	2	10	5898	5907	0 %	40 %	20 %	40 %	384442311
85	NC_017282	CTG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442311
86	NC_017282	TC	3	6	5925	5930	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
87	NC_017282	GTA	2	6	5970	5975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442312
88	NC_017282	CCTG	2	8	6016	6023	0 %	25 %	25 %	50 %	384442312
89	NC_017282	TCAT	2	8	6091	6098	25 %	50 %	0 %	25 %	384442312
90	NC_017282	TGA	2	6	6505	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442313
91	NC_017282	AATC	2	8	6536	6543	50 %	25 %	0 %	25 %	384442313
92	NC_017282	TCCT	2	8	6594	6601	0 %	50 %	0 %	50 %	384442313
93	NC_017282	TTA	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442313
94	NC_017282	TCA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442313
95	NC_017282	GCG	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384442314
96	NC_017282	AAAT	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	384442314
97	NC_017282	GCTG	2	8	6795	6802	0 %	25 %	50 %	25 %	384442314
98	NC_017282	CAT	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442314
99	NC_017282	GA	3	6	6978	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	384442314
100	NC_017282	T	7	7	7043	7049	0 %	100 %	0 %	0 %	384442314
101	NC_017282	AGC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442314
102	NC_017282	TCCA	2	8	7156	7163	25 %	25 %	0 %	50 %	384442314
103	NC_017282	GATT	2	8	7218	7225	25 %	50 %	25 %	0 %	384442314
104	NC_017282	AT	4	8	7371	7378	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
105	NC_017282	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	384442314
106	NC_017282	GTA	2	6	7488	7493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442314
107	NC_017282	ATA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442314
108	NC_017282	GTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442314
109	NC_017282	CAT	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442314
110	NC_017282	ACAT	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
111	NC_017282	TAA	2	6	7789	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442314
112	NC_017282	TA	4	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
113	NC_017282	CGC	2	6	7842	7847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384442314
114	NC_017282	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442314
115	NC_017282	TTC	2	6	8021	8026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442314
116	NC_017282	AT	3	6	8064	8069	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
117	NC_017282	TGC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442314
118	NC_017282	GAA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442314
119	NC_017282	GCTTT	2	10	8191	8200	0 %	60 %	20 %	20 %	384442314
120	NC_017282	AATC	2	8	8224	8231	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
121	NC_017282	TGA	2	6	8251	8256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442314
122	NC_017282	A	7	7	8256	8262	100 %	0 %	0 %	0 %	384442314
123	NC_017282	TAA	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442314
124	NC_017282	A	6	6	8388	8393	100 %	0 %	0 %	0 %	384442314
125	NC_017282	TCC	2	6	8433	8438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442314
126	NC_017282	CTG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442314
127	NC_017282	TTG	2	6	8509	8514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442314
128	NC_017282	CAC	2	6	8548	8553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442314
129	NC_017282	TGT	2	6	8579	8584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442314
130	NC_017282	ATT	2	6	8622	8627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442314
131	NC_017282	ATC	2	6	8990	8995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442315
132	NC_017282	AAT	2	6	9008	9013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442315
133	NC_017282	TTC	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442315
134	NC_017282	A	6	6	9065	9070	100 %	0 %	0 %	0 %	384442315
135	NC_017282	AGT	2	6	9097	9102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442315
136	NC_017282	TTTG	2	8	9156	9163	0 %	75 %	25 %	0 %	384442315
137	NC_017282	T	6	6	9185	9190	0 %	100 %	0 %	0 %	384442316
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