MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 35997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
2	NC_017281	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384442355
3	NC_017281	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	384442355
4	NC_017281	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
5	NC_017281	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
6	NC_017281	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442355
7	NC_017281	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442355
8	NC_017281	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
9	NC_017281	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
10	NC_017281	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442355
11	NC_017281	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442355
12	NC_017281	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
13	NC_017281	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
14	NC_017281	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
15	NC_017281	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442355
16	NC_017281	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442355
17	NC_017281	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
18	NC_017281	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442355
19	NC_017281	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384442355
20	NC_017281	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
21	NC_017281	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	384442355
22	NC_017281	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442355
23	NC_017281	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384442355
24	NC_017281	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	384442355
25	NC_017281	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442355
26	NC_017281	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
27	NC_017281	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
28	NC_017281	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	384442356
29	NC_017281	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442356
30	NC_017281	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442356
31	NC_017281	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	384442356
32	NC_017281	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
33	NC_017281	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
34	NC_017281	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
35	NC_017281	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442356
36	NC_017281	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	384442356
37	NC_017281	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
38	NC_017281	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	384442356
39	NC_017281	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442356
40	NC_017281	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442356
41	NC_017281	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
42	NC_017281	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
43	NC_017281	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
44	NC_017281	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	384442356
45	NC_017281	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
46	NC_017281	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
47	NC_017281	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	384442356
48	NC_017281	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442356
49	NC_017281	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
50	NC_017281	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
51	NC_017281	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
52	NC_017281	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442356
53	NC_017281	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	384442357
54	NC_017281	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
55	NC_017281	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
56	NC_017281	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	384442357
57	NC_017281	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	384442357
58	NC_017281	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442357
59	NC_017281	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	384442357
60	NC_017281	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
61	NC_017281	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	384442357
62	NC_017281	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
63	NC_017281	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442357
64	NC_017281	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442357
65	NC_017281	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	384442357
66	NC_017281	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
67	NC_017281	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
68	NC_017281	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384442357
69	NC_017281	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	384442357
70	NC_017281	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442357
71	NC_017281	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442357
72	NC_017281	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	384442357
73	NC_017281	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	384442357
74	NC_017281	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442357
75	NC_017281	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442357
76	NC_017281	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
77	NC_017281	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384442357
78	NC_017281	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442357
79	NC_017281	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
80	NC_017281	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
81	NC_017281	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442357
82	NC_017281	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442357
83	NC_017281	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
84	NC_017281	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442357
85	NC_017281	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	384442357
86	NC_017281	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442357
87	NC_017281	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
88	NC_017281	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	384442357
89	NC_017281	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	384442357
90	NC_017281	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442357
91	NC_017281	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
92	NC_017281	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
93	NC_017281	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
94	NC_017281	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
95	NC_017281	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	384442357
96	NC_017281	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
97	NC_017281	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
98	NC_017281	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442357
99	NC_017281	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442358
100	NC_017281	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	384442358
101	NC_017281	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442358
102	NC_017281	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442358
103	NC_017281	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	384442358
104	NC_017281	CATC	2	8	5055	5062	25 %	25 %	0 %	50 %	384442358
105	NC_017281	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442358
106	NC_017281	TGCA	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	384442358
107	NC_017281	AATC	2	8	5169	5176	50 %	25 %	0 %	25 %	384442358
108	NC_017281	T	7	7	5246	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	384442358
109	NC_017281	GCAT	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	384442359
110	NC_017281	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	384442359
111	NC_017281	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442359
112	NC_017281	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442359
113	NC_017281	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442359
114	NC_017281	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
115	NC_017281	T	6	6	5692	5697	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
116	NC_017281	CAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442359
117	NC_017281	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442359
118	NC_017281	ACAA	2	8	5771	5778	75 %	0 %	0 %	25 %	384442359
119	NC_017281	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442359
120	NC_017281	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442359
121	NC_017281	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442359
122	NC_017281	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442359
123	NC_017281	T	6	6	6117	6122	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
124	NC_017281	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442359
125	NC_017281	T	6	6	6143	6148	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
126	NC_017281	TCTT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	384442359
127	NC_017281	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442359
128	NC_017281	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442359
129	NC_017281	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442359
130	NC_017281	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
131	NC_017281	A	6	6	6390	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	384442359
132	NC_017281	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	384442359
133	NC_017281	TACT	2	8	6714	6721	25 %	50 %	0 %	25 %	384442360
134	NC_017281	GTT	2	6	6740	6745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
135	NC_017281	TGA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
136	NC_017281	TTTG	2	8	6759	6766	0 %	75 %	25 %	0 %	384442360
137	NC_017281	TTG	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
138	NC_017281	GAAA	2	8	6871	6878	75 %	0 %	25 %	0 %	384442360
139	NC_017281	TA	3	6	6899	6904	50 %	50 %	0 %	0 %	384442360
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181	NC_017281	A	6	6	8677	8682	100 %	0 %	0 %	0 %	384442361
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251	NC_017281	A	6	6	11797	11802	100 %	0 %	0 %	0 %	384442361
252	NC_017281	GATT	2	8	11804	11811	25 %	50 %	25 %	0 %	384442361
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262	NC_017281	A	6	6	12513	12518	100 %	0 %	0 %	0 %	384442361
263	NC_017281	T	6	6	12522	12527	0 %	100 %	0 %	0 %	384442361
264	NC_017281	AGC	2	6	12602	12607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442361
265	NC_017281	CA	3	6	12620	12625	50 %	0 %	0 %	50 %	384442361
266	NC_017281	T	6	6	12659	12664	0 %	100 %	0 %	0 %	384442362
267	NC_017281	A	7	7	12687	12693	100 %	0 %	0 %	0 %	384442362
268	NC_017281	A	6	6	12747	12752	100 %	0 %	0 %	0 %	384442362
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