MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 100888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017079	TCG	2	6	249980	249985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761141
5002	NC_017079	CCG	2	6	250191	250196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761141
5003	NC_017079	TCG	2	6	250210	250215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761141
5004	NC_017079	TG	3	6	250743	250748	0 %	50 %	50 %	0 %	383761142
5005	NC_017079	GAT	2	6	250749	250754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761142
5006	NC_017079	CG	3	6	250761	250766	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5007	NC_017079	TAC	2	6	250875	250880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761142
5008	NC_017079	CCA	2	6	250924	250929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761142
5009	NC_017079	TGG	2	6	250947	250952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761142
5010	NC_017079	GCA	2	6	250953	250958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5011	NC_017079	GGC	2	6	251033	251038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761142
5012	NC_017079	G	6	6	251047	251052	0 %	0 %	100 %	0 %	383761142
5013	NC_017079	GGC	2	6	251054	251059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761142
5014	NC_017079	CGGT	2	8	251080	251087	0 %	25 %	50 %	25 %	383761142
5015	NC_017079	CAAC	2	8	251093	251100	50 %	0 %	0 %	50 %	383761142
5016	NC_017079	GC	3	6	251152	251157	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5017	NC_017079	TAC	2	6	251181	251186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761142
5018	NC_017079	AACC	2	8	251189	251196	50 %	0 %	0 %	50 %	383761142
5019	NC_017079	TGA	2	6	251218	251223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761142
5020	NC_017079	CAG	2	6	251264	251269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5021	NC_017079	ACC	2	6	251301	251306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761142
5022	NC_017079	GTC	2	6	251377	251382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5023	NC_017079	GGATT	2	10	251384	251393	20 %	40 %	40 %	0 %	383761142
5024	NC_017079	TGA	2	6	251509	251514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761142
5025	NC_017079	CCG	2	6	251515	251520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761142
5026	NC_017079	CAA	2	6	251600	251605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761142
5027	NC_017079	TGGC	2	8	251608	251615	0 %	25 %	50 %	25 %	383761142
5028	NC_017079	CCA	2	6	251707	251712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761142
5029	NC_017079	CTG	2	6	251721	251726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5030	NC_017079	TGG	2	6	251737	251742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761142
5031	NC_017079	ATC	2	6	251746	251751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761142
5032	NC_017079	TTA	2	6	251765	251770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383761142
5033	NC_017079	CCAGG	2	10	251771	251780	20 %	0 %	40 %	40 %	383761142
5034	NC_017079	GC	5	10	251819	251828	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5035	NC_017079	GC	3	6	251877	251882	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5036	NC_017079	GAA	2	6	251946	251951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383761142
5037	NC_017079	TCT	2	6	251963	251968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383761142
5038	NC_017079	GC	3	6	251987	251992	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5039	NC_017079	GGC	2	6	252020	252025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761142
5040	NC_017079	GCCTG	2	10	252129	252138	0 %	20 %	40 %	40 %	383761142
5041	NC_017079	CGC	2	6	252197	252202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761142
5042	NC_017079	TGA	2	6	252212	252217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761142
5043	NC_017079	ACA	2	6	252218	252223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761142
5044	NC_017079	G	6	6	252256	252261	0 %	0 %	100 %	0 %	383761142
5045	NC_017079	GGCG	2	8	252361	252368	0 %	0 %	75 %	25 %	383761142
5046	NC_017079	AAC	2	6	252456	252461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761142
5047	NC_017079	TCA	2	6	252526	252531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761142
5048	NC_017079	CTG	2	6	252567	252572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5049	NC_017079	GATC	2	8	252593	252600	25 %	25 %	25 %	25 %	383761142
5050	NC_017079	TC	3	6	252631	252636	0 %	50 %	0 %	50 %	383761142
5051	NC_017079	GTT	2	6	252708	252713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761142
5052	NC_017079	AGGC	2	8	252784	252791	25 %	0 %	50 %	25 %	383761142
5053	NC_017079	CCG	2	6	252898	252903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761142
5054	NC_017079	GC	3	6	252921	252926	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5055	NC_017079	AC	3	6	252952	252957	50 %	0 %	0 %	50 %	383761142
5056	NC_017079	AGC	2	6	252967	252972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761142
5057	NC_017079	TCC	2	6	253086	253091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383761143
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5059	NC_017079	CAA	2	6	253121	253126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761143
5060	NC_017079	CAA	2	6	253154	253159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761143
5061	NC_017079	CA	3	6	253193	253198	50 %	0 %	0 %	50 %	383761143
5062	NC_017079	CGA	2	6	253207	253212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761143
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5064	NC_017079	TGG	3	9	253344	253352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761143
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5070	NC_017079	TTG	2	6	253488	253493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761143
5071	NC_017079	TTG	2	6	253595	253600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761143
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5079	NC_017079	GC	3	6	253972	253977	0 %	0 %	50 %	50 %	383761143
5080	NC_017079	GTTT	2	8	254018	254025	0 %	75 %	25 %	0 %	383761143
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5087	NC_017079	CAA	2	6	254588	254593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761144
5088	NC_017079	GGA	2	6	254641	254646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761144
5089	NC_017079	TGG	2	6	254657	254662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761144
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5091	NC_017079	ACG	2	6	254889	254894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761144
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5093	NC_017079	CAA	2	6	254911	254916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761144
5094	NC_017079	CAA	2	6	255001	255006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761145
5095	NC_017079	ACT	2	6	255037	255042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761145
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5097	NC_017079	GGC	3	9	255183	255191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761145
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5099	NC_017079	GC	3	6	255384	255389	0 %	0 %	50 %	50 %	383761145
5100	NC_017079	CCGA	2	8	255442	255449	25 %	0 %	25 %	50 %	383761145
5101	NC_017079	GAT	2	6	255464	255469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761145
5102	NC_017079	TGA	2	6	255515	255520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761145
5103	NC_017079	TAC	2	6	255588	255593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761145
5104	NC_017079	AGG	2	6	255610	255615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761145
5105	NC_017079	TG	4	8	255642	255649	0 %	50 %	50 %	0 %	383761145
5106	NC_017079	CAT	2	6	255833	255838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761145
5107	NC_017079	GC	3	6	255843	255848	0 %	0 %	50 %	50 %	383761145
5108	NC_017079	GGC	2	6	255852	255857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761145
5109	NC_017079	TGG	2	6	255888	255893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761145
5110	NC_017079	CGT	2	6	256178	256183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761146
5111	NC_017079	ACA	2	6	256211	256216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761146
5112	NC_017079	GAG	2	6	256217	256222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761146
5113	NC_017079	GCC	2	6	256293	256298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761146
5114	NC_017079	ACA	2	6	256305	256310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761146
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5117	NC_017079	CAGC	2	8	256423	256430	25 %	0 %	25 %	50 %	383761146
5118	NC_017079	TTG	2	6	256500	256505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761146
5119	NC_017079	GAG	2	6	256544	256549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761146
5120	NC_017079	CGG	2	6	256562	256567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761146
5121	NC_017079	ACA	2	6	256594	256599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761146
5122	NC_017079	GC	3	6	256628	256633	0 %	0 %	50 %	50 %	383761146
5123	NC_017079	CGA	2	6	256693	256698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761146
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5133	NC_017079	CTG	2	6	257414	257419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761146
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5224	NC_017079	GC	3	6	261757	261762	0 %	0 %	50 %	50 %	383761149
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5227	NC_017079	CGGA	2	8	261882	261889	25 %	0 %	50 %	25 %	383761149
5228	NC_017079	ATA	2	6	261905	261910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383761149
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5230	NC_017079	C	6	6	262091	262096	0 %	0 %	0 %	100 %	383761149
5231	NC_017079	CGT	2	6	262113	262118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761149
5232	NC_017079	GCAG	2	8	262175	262182	25 %	0 %	50 %	25 %	383761149
5233	NC_017079	GATG	2	8	262215	262222	25 %	25 %	50 %	0 %	383761149
5234	NC_017079	GACT	2	8	262232	262239	25 %	25 %	25 %	25 %	383761149
5235	NC_017079	CGCGCA	2	12	262254	262265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383761149
5236	NC_017079	AGC	2	6	262277	262282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761149
5237	NC_017079	GCCA	2	8	262370	262377	25 %	0 %	25 %	50 %	383761149
5238	NC_017079	AGC	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761149
5239	NC_017079	GC	4	8	262432	262439	0 %	0 %	50 %	50 %	383761149
5240	NC_017079	ATA	2	6	262510	262515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383761149
5241	NC_017079	CAC	2	6	262519	262524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761149
5242	NC_017079	ATG	2	6	262535	262540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761149
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