MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 100888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	TCA	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
2	NC_017079	CTA	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
3	NC_017079	CAT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
4	NC_017079	CGT	2	6	184	189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
5	NC_017079	CGT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
6	NC_017079	TGC	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
7	NC_017079	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760956
8	NC_017079	CTG	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
9	NC_017079	TGC	2	6	335	340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
10	NC_017079	AGTA	2	8	382	389	50 %	25 %	25 %	0 %	383760956
11	NC_017079	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760956
12	NC_017079	TGG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760956
13	NC_017079	GAA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760956
14	NC_017079	ACC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760956
15	NC_017079	CCA	2	6	787	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760956
16	NC_017079	GAA	2	6	811	816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760956
17	NC_017079	GAG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760956
18	NC_017079	ATGC	2	8	1009	1016	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
19	NC_017079	CATG	2	8	1020	1027	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
20	NC_017079	CAG	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760956
21	NC_017079	TGG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760956
22	NC_017079	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760956
23	NC_017079	CCG	2	6	1145	1150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760956
24	NC_017079	CGG	2	6	1165	1170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760956
25	NC_017079	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	383760956
26	NC_017079	AGG	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760956
27	NC_017079	TGC	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
28	NC_017079	CTGG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	383760957
29	NC_017079	GGC	2	6	1722	1727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
30	NC_017079	CG	3	6	1732	1737	0 %	0 %	50 %	50 %	383760957
31	NC_017079	GAC	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
32	NC_017079	GCGCA	2	10	1809	1818	20 %	0 %	40 %	40 %	383760957
33	NC_017079	CGG	2	6	1820	1825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
34	NC_017079	GCG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
35	NC_017079	CAGC	2	8	1910	1917	25 %	0 %	25 %	50 %	383760957
36	NC_017079	TGG	3	9	1984	1992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760957
37	NC_017079	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
38	NC_017079	CG	3	6	2014	2019	0 %	0 %	50 %	50 %	383760957
39	NC_017079	TGA	2	6	2071	2076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760957
40	NC_017079	CCTG	2	8	2122	2129	0 %	25 %	25 %	50 %	383760957
41	NC_017079	AGA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760957
42	NC_017079	ACG	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
43	NC_017079	GTC	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
44	NC_017079	GAA	3	9	2300	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760957
45	NC_017079	CCG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760957
46	NC_017079	CAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760957
47	NC_017079	CGG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
48	NC_017079	AAGC	2	8	2414	2421	50 %	0 %	25 %	25 %	383760957
49	NC_017079	ACG	2	6	2443	2448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
50	NC_017079	GCT	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
51	NC_017079	GCT	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
52	NC_017079	CGAAA	2	10	2551	2560	60 %	0 %	20 %	20 %	383760957
53	NC_017079	CTC	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760958
54	NC_017079	GCGCT	2	10	2945	2954	0 %	20 %	40 %	40 %	383760958
55	NC_017079	GCA	2	6	3049	3054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
56	NC_017079	CAT	2	6	3057	3062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
57	NC_017079	CAGA	2	8	3084	3091	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
58	NC_017079	AGA	3	9	3108	3116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
59	NC_017079	GATG	2	8	3135	3142	25 %	25 %	50 %	0 %	383760958
60	NC_017079	CGC	2	6	3157	3162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760958
61	NC_017079	GAA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
62	NC_017079	CAG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
63	NC_017079	AGA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
64	NC_017079	GAAC	2	8	3321	3328	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
65	NC_017079	TGC	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760958
66	NC_017079	GC	3	6	3412	3417	0 %	0 %	50 %	50 %	383760958
67	NC_017079	ATC	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
68	NC_017079	ACCT	2	8	3542	3549	25 %	25 %	0 %	50 %	383760958
69	NC_017079	ATGAA	2	10	3554	3563	60 %	20 %	20 %	0 %	383760958
70	NC_017079	CAT	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
71	NC_017079	TGG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760958
72	NC_017079	CGA	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
73	NC_017079	ATC	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
74	NC_017079	AGC	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
75	NC_017079	GCA	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
76	NC_017079	ATT	2	6	3790	3795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760958
77	NC_017079	AGA	2	6	3857	3862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
78	NC_017079	GGCG	2	8	3936	3943	0 %	0 %	75 %	25 %	383760958
79	NC_017079	TC	3	6	4019	4024	0 %	50 %	0 %	50 %	383760958
80	NC_017079	GGT	3	9	4089	4097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760958
81	NC_017079	TCA	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
82	NC_017079	GCA	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
83	NC_017079	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
84	NC_017079	AAG	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
85	NC_017079	CGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760958
86	NC_017079	GA	3	6	4520	4525	50 %	0 %	50 %	0 %	383760959
87	NC_017079	CCA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760959
88	NC_017079	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760959
89	NC_017079	AAC	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760959
90	NC_017079	GC	3	6	4647	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	383760959
91	NC_017079	GCG	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
92	NC_017079	GGC	2	6	4774	4779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
93	NC_017079	AAG	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760959
94	NC_017079	TTGA	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	383760959
95	NC_017079	GC	3	6	4834	4839	0 %	0 %	50 %	50 %	383760959
96	NC_017079	GAG	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760959
97	NC_017079	GCC	2	6	4915	4920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
98	NC_017079	GACC	2	8	4938	4945	25 %	0 %	25 %	50 %	383760959
99	NC_017079	TCA	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760959
100	NC_017079	CAT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760959
101	NC_017079	GCC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
102	NC_017079	GCAGC	2	10	5087	5096	20 %	0 %	40 %	40 %	383760959
103	NC_017079	CGC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
104	NC_017079	CAG	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760959
105	NC_017079	TC	3	6	5343	5348	0 %	50 %	0 %	50 %	383760959
106	NC_017079	CTG	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760959
107	NC_017079	GCG	2	6	5477	5482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
108	NC_017079	CTGTC	2	10	5496	5505	0 %	40 %	20 %	40 %	383760959
109	NC_017079	CGG	2	6	5517	5522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
110	NC_017079	GCA	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760959
111	NC_017079	GATC	2	8	5661	5668	25 %	25 %	25 %	25 %	383760959
112	NC_017079	GCG	2	6	5691	5696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
113	NC_017079	GGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760959
114	NC_017079	TTC	2	6	5725	5730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760959
115	NC_017079	GAT	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760959
116	NC_017079	GGC	2	6	5787	5792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
117	NC_017079	CGG	2	6	5838	5843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
118	NC_017079	CT	3	6	5869	5874	0 %	50 %	0 %	50 %	383760959
119	NC_017079	TCC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760959
120	NC_017079	GGAC	2	8	6144	6151	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
121	NC_017079	GAG	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
122	NC_017079	GC	3	6	6253	6258	0 %	0 %	50 %	50 %	383760960
123	NC_017079	GGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760960
124	NC_017079	GGA	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
125	NC_017079	CCG	2	6	6434	6439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
126	NC_017079	CCA	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760960
127	NC_017079	CCG	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
128	NC_017079	AGGC	2	8	6591	6598	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
129	NC_017079	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760960
130	NC_017079	GC	4	8	6634	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	383760960
131	NC_017079	ATC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760960
132	NC_017079	AGG	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
133	NC_017079	CGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
134	NC_017079	GC	3	6	6995	7000	0 %	0 %	50 %	50 %	383760961
135	NC_017079	CAT	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760961
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139	NC_017079	TCA	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760961
140	NC_017079	GC	3	6	7321	7326	0 %	0 %	50 %	50 %	383760961
141	NC_017079	GGC	2	6	7329	7334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760961
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250	NC_017079	TGCGCC	2	12	12701	12712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383760965
251	NC_017079	ACC	2	6	12743	12748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760965
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255	NC_017079	GCAT	2	8	13067	13074	25 %	25 %	25 %	25 %	383760965
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259	NC_017079	GCG	2	6	13381	13386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760966
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261	NC_017079	CGC	2	6	13424	13429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760966
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263	NC_017079	CGG	2	6	13468	13473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760966
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