MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 37606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
2	NC_017031	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
3	NC_017031	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	383313192
4	NC_017031	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313192
5	NC_017031	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313192
6	NC_017031	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	383313192
7	NC_017031	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313192
8	NC_017031	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313192
9	NC_017031	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	383313192
10	NC_017031	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
11	NC_017031	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	383313192
12	NC_017031	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	383313192
13	NC_017031	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313192
14	NC_017031	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
15	NC_017031	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
16	NC_017031	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	383313192
17	NC_017031	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	383313192
18	NC_017031	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	383313192
19	NC_017031	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	383313192
20	NC_017031	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
21	NC_017031	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313192
22	NC_017031	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
23	NC_017031	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
24	NC_017031	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	383313192
25	NC_017031	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	383313192
26	NC_017031	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
27	NC_017031	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313192
28	NC_017031	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313192
29	NC_017031	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
30	NC_017031	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	383313192
31	NC_017031	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	383313192
32	NC_017031	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	383313192
33	NC_017031	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
34	NC_017031	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
35	NC_017031	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
36	NC_017031	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
37	NC_017031	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313192
38	NC_017031	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313193
39	NC_017031	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	383313194
40	NC_017031	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	383313194
41	NC_017031	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
42	NC_017031	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
43	NC_017031	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313194
44	NC_017031	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313194
45	NC_017031	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
46	NC_017031	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	383313194
47	NC_017031	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313194
48	NC_017031	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	383313194
49	NC_017031	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313194
50	NC_017031	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	383313194
51	NC_017031	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313194
52	NC_017031	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313194
53	NC_017031	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	383313194
54	NC_017031	TCGT	2	8	3682	3689	0 %	50 %	25 %	25 %	383313195
55	NC_017031	TTG	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313195
56	NC_017031	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	383313195
57	NC_017031	CTG	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313195
58	NC_017031	GTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313195
59	NC_017031	TTG	2	6	4065	4070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313195
60	NC_017031	GAT	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313195
61	NC_017031	GAG	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313195
62	NC_017031	CGT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313195
63	NC_017031	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	383313195
64	NC_017031	GAC	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313195
65	NC_017031	CGA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313195
66	NC_017031	AAGG	2	8	4838	4845	50 %	0 %	50 %	0 %	383313195
67	NC_017031	CTG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313196
68	NC_017031	AGA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313196
69	NC_017031	TGC	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313196
70	NC_017031	GCG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313196
71	NC_017031	TC	3	6	4955	4960	0 %	50 %	0 %	50 %	383313196
72	NC_017031	A	6	6	5023	5028	100 %	0 %	0 %	0 %	383313196
73	NC_017031	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313196
74	NC_017031	CGG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313196
75	NC_017031	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313196
76	NC_017031	A	6	6	5185	5190	100 %	0 %	0 %	0 %	383313196
77	NC_017031	AGC	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313196
78	NC_017031	AC	3	6	5198	5203	50 %	0 %	0 %	50 %	383313196
79	NC_017031	ATG	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313196
80	NC_017031	ATAC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	383313196
81	NC_017031	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	383313197
82	NC_017031	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313197
83	NC_017031	ATGC	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	383313197
84	NC_017031	TGG	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
85	NC_017031	GGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
86	NC_017031	ACC	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313197
87	NC_017031	ACC	3	9	6097	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313197
88	NC_017031	CAT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313197
89	NC_017031	TCG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
90	NC_017031	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
91	NC_017031	TGA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
92	NC_017031	A	6	6	6260	6265	100 %	0 %	0 %	0 %	383313197
93	NC_017031	CCGATG	2	12	6272	6283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383313197
94	NC_017031	CTG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
95	NC_017031	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
96	NC_017031	GAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
97	NC_017031	TTA	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313197
98	NC_017031	TGA	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
99	NC_017031	GAA	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
100	NC_017031	TGA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
101	NC_017031	CG	3	6	6576	6581	0 %	0 %	50 %	50 %	383313197
102	NC_017031	AAAGAA	2	12	6598	6609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383313197
103	NC_017031	TCT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313197
104	NC_017031	GGC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313197
105	NC_017031	TGG	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
106	NC_017031	GGT	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
107	NC_017031	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313197
108	NC_017031	ATG	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
109	NC_017031	CAA	2	6	7140	7145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313197
110	NC_017031	GCT	3	9	7209	7217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
111	NC_017031	TTG	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313197
112	NC_017031	CCG	2	6	7279	7284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313197
113	NC_017031	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
114	NC_017031	CAA	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313197
115	NC_017031	GAT	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
116	NC_017031	ATG	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
117	NC_017031	TGA	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
118	NC_017031	TCG	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
119	NC_017031	T	6	6	7803	7808	0 %	100 %	0 %	0 %	383313198
120	NC_017031	TTC	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313198
121	NC_017031	GAG	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313198
122	NC_017031	AGC	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313198
123	NC_017031	TGC	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313198
124	NC_017031	GAG	2	6	8104	8109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313198
125	NC_017031	AT	3	6	8126	8131	50 %	50 %	0 %	0 %	383313198
126	NC_017031	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313199
127	NC_017031	GAAA	2	8	8469	8476	75 %	0 %	25 %	0 %	383313200
128	NC_017031	CTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
129	NC_017031	GGA	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313200
130	NC_017031	TGT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313200
131	NC_017031	CTG	2	6	8599	8604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
132	NC_017031	TGC	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
133	NC_017031	GTC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
134	NC_017031	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313201
135	NC_017031	TGA	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313201
136	NC_017031	GCT	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313201
137	NC_017031	CGA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
138	NC_017031	GCG	2	6	9100	9105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313202
139	NC_017031	GAG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313202
140	NC_017031	CCG	2	6	9233	9238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313202
141	NC_017031	ACG	2	6	9439	9444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
142	NC_017031	CGC	2	6	9449	9454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313202
143	NC_017031	ACTC	2	8	9476	9483	25 %	25 %	0 %	50 %	383313202
144	NC_017031	TTC	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313202
145	NC_017031	CG	3	6	9580	9585	0 %	0 %	50 %	50 %	383313202
146	NC_017031	TGA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313202
147	NC_017031	CAAC	2	8	9634	9641	50 %	0 %	0 %	50 %	383313202
148	NC_017031	TCT	2	6	9679	9684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313202
149	NC_017031	GCAT	2	8	9729	9736	25 %	25 %	25 %	25 %	383313202
150	NC_017031	GAA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
151	NC_017031	CG	3	6	10045	10050	0 %	0 %	50 %	50 %	383313202
152	NC_017031	TGC	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
153	NC_017031	TTA	2	6	10163	10168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313202
154	NC_017031	TCG	2	6	10196	10201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
155	NC_017031	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
156	NC_017031	CGA	2	6	10277	10282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
157	NC_017031	GC	3	6	10323	10328	0 %	0 %	50 %	50 %	383313202
158	NC_017031	AGA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
159	NC_017031	GAAATT	3	18	10443	10460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383313202
160	NC_017031	CGT	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
161	NC_017031	ATT	2	6	10566	10571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313202
162	NC_017031	GAA	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
163	NC_017031	GTG	3	9	10620	10628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313202
164	NC_017031	CGT	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
165	NC_017031	CTT	2	6	10745	10750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313202
166	NC_017031	CACG	2	8	10760	10767	25 %	0 %	25 %	50 %	383313202
167	NC_017031	CG	4	8	10844	10851	0 %	0 %	50 %	50 %	383313202
168	NC_017031	AAG	2	6	10971	10976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
169	NC_017031	GGT	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313202
170	NC_017031	GAA	2	6	11037	11042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
171	NC_017031	ATG	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313202
172	NC_017031	GCT	2	6	11084	11089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
173	NC_017031	GAA	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
174	NC_017031	TGA	3	9	11129	11137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313202
175	NC_017031	CGA	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
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181	NC_017031	GGT	2	6	11369	11374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313202
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219	NC_017031	GCT	2	6	13581	13586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313205
220	NC_017031	CTG	2	6	13624	13629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313205
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235	NC_017031	TGGG	2	8	14428	14435	0 %	25 %	75 %	0 %	383313206
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242	NC_017031	AATC	2	8	14958	14965	50 %	25 %	0 %	25 %	383313207
243	NC_017031	AAAG	2	8	15050	15057	75 %	0 %	25 %	0 %	383313207
244	NC_017031	GCA	2	6	15063	15068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313207
245	NC_017031	GAA	2	6	15144	15149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313207
246	NC_017031	CT	3	6	15205	15210	0 %	50 %	0 %	50 %	383313207
247	NC_017031	AAG	2	6	15241	15246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313207
248	NC_017031	AGCT	2	8	15349	15356	25 %	25 %	25 %	25 %	383313207
249	NC_017031	TAG	2	6	15388	15393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313207
250	NC_017031	A	6	6	15425	15430	100 %	0 %	0 %	0 %	383313207
251	NC_017031	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	383313207
252	NC_017031	TTG	2	6	15628	15633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313207
253	NC_017031	CCA	2	6	15637	15642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313207
254	NC_017031	AAGG	2	8	15669	15676	50 %	0 %	50 %	0 %	383313207
255	NC_017031	ATT	2	6	15686	15691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313207
256	NC_017031	CGT	2	6	15864	15869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313208
257	NC_017031	TCG	2	6	15924	15929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313208
258	NC_017031	TAC	2	6	15991	15996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313208
259	NC_017031	CGA	2	6	16011	16016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313208
260	NC_017031	TTTA	2	8	16066	16073	25 %	75 %	0 %	0 %	383313208
261	NC_017031	TGC	2	6	16161	16166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313208
262	NC_017031	GC	3	6	16297	16302	0 %	0 %	50 %	50 %	383313208
263	NC_017031	T	6	6	16308	16313	0 %	100 %	0 %	0 %	383313208
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371	NC_017031	TTGA	2	8	23235	23242	25 %	50 %	25 %	0 %	383313220
372	NC_017031	TTGTCT	2	12	23309	23320	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383313220
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374	NC_017031	CCAATA	2	12	23397	23408	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383313220
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380	NC_017031	GTT	2	6	24123	24128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313221
381	NC_017031	AAT	2	6	24140	24145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383313221
382	NC_017031	TGCAGC	2	12	24173	24184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383313221
383	NC_017031	TGT	2	6	24188	24193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313221
384	NC_017031	TGG	2	6	24330	24335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313221
385	NC_017031	ATG	2	6	24343	24348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313221
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