MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 26152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	TATT	2	8	72	79	25 %	75 %	0 %	0 %	383311893
2	NC_017028	T	10	10	127	136	0 %	100 %	0 %	0 %	383311893
3	NC_017028	CGC	2	6	250	255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311893
4	NC_017028	ATC	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311893
5	NC_017028	ACA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311893
6	NC_017028	TAT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
7	NC_017028	ATATA	2	10	459	468	60 %	40 %	0 %	0 %	383311894
8	NC_017028	TAA	2	6	473	478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
9	NC_017028	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
10	NC_017028	AGA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311894
11	NC_017028	TAT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
12	NC_017028	TAA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
13	NC_017028	ATA	2	6	689	694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
14	NC_017028	ATA	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
15	NC_017028	CCA	2	6	735	740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311894
16	NC_017028	ACTAA	2	10	778	787	60 %	20 %	0 %	20 %	383311894
17	NC_017028	AAAGTA	2	12	790	801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311894
18	NC_017028	TAG	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311894
19	NC_017028	TGC	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311894
20	NC_017028	ACAT	2	8	928	935	50 %	25 %	0 %	25 %	383311894
21	NC_017028	TAAA	2	8	987	994	75 %	25 %	0 %	0 %	383311894
22	NC_017028	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311894
23	NC_017028	TAT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
24	NC_017028	ATA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
25	NC_017028	TG	3	6	1211	1216	0 %	50 %	50 %	0 %	383311895
26	NC_017028	CAT	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
27	NC_017028	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	383311895
28	NC_017028	TA	3	6	1336	1341	50 %	50 %	0 %	0 %	383311895
29	NC_017028	ACT	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
30	NC_017028	CA	3	6	1465	1470	50 %	0 %	0 %	50 %	383311895
31	NC_017028	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
32	NC_017028	AAT	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
33	NC_017028	T	7	7	1581	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	383311895
34	NC_017028	CAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
35	NC_017028	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	383311895
36	NC_017028	TTA	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
37	NC_017028	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311895
38	NC_017028	CAA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
39	NC_017028	TTC	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311895
40	NC_017028	TGG	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311895
41	NC_017028	ATT	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
42	NC_017028	TTA	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
43	NC_017028	T	6	6	1987	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	383311895
44	NC_017028	CTA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
45	NC_017028	TAAA	2	8	2044	2051	75 %	25 %	0 %	0 %	383311895
46	NC_017028	AAG	2	6	2056	2061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
47	NC_017028	AT	4	8	2068	2075	50 %	50 %	0 %	0 %	383311895
48	NC_017028	AAT	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
49	NC_017028	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
50	NC_017028	AAT	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
51	NC_017028	TTAG	2	8	2154	2161	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
52	NC_017028	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
53	NC_017028	T	7	7	2212	2218	0 %	100 %	0 %	0 %	383311895
54	NC_017028	AAT	2	6	2246	2251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
55	NC_017028	ATAC	3	12	2262	2273	50 %	25 %	0 %	25 %	383311895
56	NC_017028	AGT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
57	NC_017028	GTTTT	2	10	2305	2314	0 %	80 %	20 %	0 %	383311895
58	NC_017028	T	6	6	2311	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	383311895
59	NC_017028	GAA	2	6	2334	2339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
60	NC_017028	A	7	7	2348	2354	100 %	0 %	0 %	0 %	383311895
61	NC_017028	GCAAA	2	10	2361	2370	60 %	0 %	20 %	20 %	383311895
62	NC_017028	ATTG	2	8	2373	2380	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
63	NC_017028	A	6	6	2383	2388	100 %	0 %	0 %	0 %	383311895
64	NC_017028	T	6	6	2404	2409	0 %	100 %	0 %	0 %	383311895
65	NC_017028	GAT	4	12	2422	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
66	NC_017028	CGG	2	6	2435	2440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311895
67	NC_017028	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
68	NC_017028	AGG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311895
69	NC_017028	AAG	2	6	2509	2514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
70	NC_017028	GATT	2	8	2519	2526	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
71	NC_017028	TAAT	2	8	2569	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	383311895
72	NC_017028	GTA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
73	NC_017028	ATAA	2	8	2590	2597	75 %	25 %	0 %	0 %	383311895
74	NC_017028	TTA	2	6	2608	2613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
75	NC_017028	TAT	2	6	2847	2852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311896
76	NC_017028	CTT	2	6	2939	2944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311896
77	NC_017028	GGC	2	6	2954	2959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311896
78	NC_017028	TTG	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311896
79	NC_017028	GTAGGT	2	12	3008	3019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383311896
80	NC_017028	TGG	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311896
81	NC_017028	AGA	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311896
82	NC_017028	GTA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311896
83	NC_017028	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311896
84	NC_017028	ACA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311896
85	NC_017028	ATGC	2	8	3276	3283	25 %	25 %	25 %	25 %	383311896
86	NC_017028	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311897
87	NC_017028	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	383311897
88	NC_017028	CAG	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311897
89	NC_017028	ATAG	2	8	3695	3702	50 %	25 %	25 %	0 %	383311897
90	NC_017028	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	383311898
91	NC_017028	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
92	NC_017028	ATAA	2	8	3958	3965	75 %	25 %	0 %	0 %	383311898
93	NC_017028	A	8	8	3982	3989	100 %	0 %	0 %	0 %	383311898
94	NC_017028	ACT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311898
95	NC_017028	GCG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311898
96	NC_017028	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	383311898
97	NC_017028	AGG	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311898
98	NC_017028	TAA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
99	NC_017028	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311898
100	NC_017028	CAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311898
101	NC_017028	TTA	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311898
102	NC_017028	ATTT	2	8	4442	4449	25 %	75 %	0 %	0 %	383311898
103	NC_017028	TAA	2	6	4454	4459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
104	NC_017028	A	6	6	4458	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	383311898
105	NC_017028	CAC	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311898
106	NC_017028	ATC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311899
107	NC_017028	TA	3	6	5595	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	383311899
108	NC_017028	ATC	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311899
109	NC_017028	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311900
110	NC_017028	AAT	2	6	6092	6097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
111	NC_017028	CAA	2	6	6160	6165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311900
112	NC_017028	TTA	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
113	NC_017028	TCG	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311900
114	NC_017028	TCA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
115	NC_017028	TA	3	6	6233	6238	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
116	NC_017028	CAC	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311900
117	NC_017028	AGT	2	6	6311	6316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311900
118	NC_017028	TAAT	2	8	6364	6371	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
119	NC_017028	T	6	6	6391	6396	0 %	100 %	0 %	0 %	383311900
120	NC_017028	A	6	6	6398	6403	100 %	0 %	0 %	0 %	383311900
121	NC_017028	GCATC	2	10	6406	6415	20 %	20 %	20 %	40 %	383311900
122	NC_017028	TCA	3	9	6424	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
123	NC_017028	TATTT	2	10	6459	6468	20 %	80 %	0 %	0 %	383311900
124	NC_017028	TAT	2	6	6481	6486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
125	NC_017028	TTA	2	6	6550	6555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
126	NC_017028	GAG	2	6	6706	6711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311900
127	NC_017028	GATT	2	8	6726	6733	25 %	50 %	25 %	0 %	383311900
128	NC_017028	AAT	2	6	6740	6745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
129	NC_017028	AT	3	6	6753	6758	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
130	NC_017028	CT	3	6	6773	6778	0 %	50 %	0 %	50 %	383311900
131	NC_017028	TA	3	6	6832	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
132	NC_017028	ATC	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
133	NC_017028	TTG	2	6	6933	6938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311900
134	NC_017028	TAT	2	6	6967	6972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
135	NC_017028	GAC	2	6	7012	7017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311900
136	NC_017028	TACC	2	8	7026	7033	25 %	25 %	0 %	50 %	383311900
137	NC_017028	TTC	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
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