MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 26152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017028	A	6	6	262601	262606	100 %	0 %	0 %	0 %	383312148
5003	NC_017028	ATT	2	6	262669	262674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312148
5004	NC_017028	ATA	2	6	263616	263621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5005	NC_017028	ATA	2	6	263643	263648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5006	NC_017028	A	6	6	263659	263664	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
5007	NC_017028	TAG	2	6	263682	263687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5008	NC_017028	TTGA	2	8	263702	263709	25 %	50 %	25 %	0 %	383312149
5009	NC_017028	A	7	7	263715	263721	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
5010	NC_017028	GAAA	2	8	263765	263772	75 %	0 %	25 %	0 %	383312149
5011	NC_017028	A	6	6	263770	263775	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
5012	NC_017028	TCC	2	6	263822	263827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383312149
5013	NC_017028	ATG	2	6	263877	263882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5014	NC_017028	AGA	2	6	263884	263889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5015	NC_017028	AAG	2	6	263899	263904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5016	NC_017028	TGC	2	6	263914	263919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312149
5017	NC_017028	AAG	2	6	264003	264008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5018	NC_017028	TA	3	6	264009	264014	50 %	50 %	0 %	0 %	383312149
5019	NC_017028	TAT	2	6	264052	264057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312149
5020	NC_017028	AGT	2	6	264073	264078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5021	NC_017028	ATG	2	6	264120	264125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5022	NC_017028	TTAT	2	8	264222	264229	25 %	75 %	0 %	0 %	383312149
5023	NC_017028	AAAG	2	8	264246	264253	75 %	0 %	25 %	0 %	383312149
5024	NC_017028	TAC	3	9	264259	264267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
5025	NC_017028	GAA	2	6	264296	264301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5026	NC_017028	TAT	2	6	264314	264319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312149
5027	NC_017028	TAC	2	6	264385	264390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
5028	NC_017028	TAG	2	6	264411	264416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5029	NC_017028	A	6	6	264453	264458	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
5030	NC_017028	A	6	6	264476	264481	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
5031	NC_017028	TAA	2	6	264499	264504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5032	NC_017028	TAG	2	6	264510	264515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5033	NC_017028	CTG	2	6	264606	264611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312149
5034	NC_017028	TTA	2	6	264624	264629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312149
5035	NC_017028	TTAAAA	2	12	264636	264647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5036	NC_017028	AATC	2	8	264664	264671	50 %	25 %	0 %	25 %	383312149
5037	NC_017028	AT	3	6	264685	264690	50 %	50 %	0 %	0 %	383312149
5038	NC_017028	GCA	2	6	264731	264736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312149
5039	NC_017028	GAA	2	6	264893	264898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5040	NC_017028	TGA	2	6	264916	264921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5041	NC_017028	TAG	2	6	264945	264950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5042	NC_017028	AGT	2	6	265150	265155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
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5044	NC_017028	CAAA	2	8	265199	265206	75 %	0 %	0 %	25 %	383312149
5045	NC_017028	AAG	2	6	265231	265236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
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5047	NC_017028	AATA	2	8	265390	265397	75 %	25 %	0 %	0 %	383312149
5048	NC_017028	AG	3	6	265411	265416	50 %	0 %	50 %	0 %	383312149
5049	NC_017028	AGA	2	6	265424	265429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5050	NC_017028	GATG	2	8	265436	265443	25 %	25 %	50 %	0 %	383312149
5051	NC_017028	TAA	2	6	265519	265524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5052	NC_017028	TTA	2	6	265548	265553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312149
5053	NC_017028	GTA	2	6	265631	265636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5054	NC_017028	GAT	2	6	265673	265678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5055	NC_017028	GTA	2	6	265772	265777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5056	NC_017028	TTG	2	6	265821	265826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312149
5057	NC_017028	ATA	2	6	265932	265937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5058	NC_017028	GAA	2	6	266192	266197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5059	NC_017028	GAA	2	6	266225	266230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312149
5060	NC_017028	CAT	2	6	266237	266242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
5061	NC_017028	TGA	2	6	266245	266250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5062	NC_017028	AAT	2	6	266257	266262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
5063	NC_017028	TA	3	6	266264	266269	50 %	50 %	0 %	0 %	383312149
5064	NC_017028	CTA	2	6	266351	266356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
5065	NC_017028	GTA	2	6	266432	266437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5066	NC_017028	GCTATT	2	12	266483	266494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312149
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5069	NC_017028	TAG	2	6	266586	266591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
5070	NC_017028	ATT	2	6	266600	266605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312149
5071	NC_017028	TAC	2	6	266641	266646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
5072	NC_017028	AATG	2	8	266710	266717	50 %	25 %	25 %	0 %	383312149
5073	NC_017028	ATG	2	6	266742	266747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312149
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5075	NC_017028	CTA	2	6	266778	266783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312149
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5080	NC_017028	TGGG	2	8	267040	267047	0 %	25 %	75 %	0 %	383312149
5081	NC_017028	A	8	8	267064	267071	100 %	0 %	0 %	0 %	383312149
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5089	NC_017028	AAT	2	6	267623	267628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
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5094	NC_017028	GTA	2	6	268408	268413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312150
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5101	NC_017028	GAT	2	6	268686	268691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312150
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5103	NC_017028	CGG	2	6	268746	268751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383312150
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5105	NC_017028	TAAT	2	8	268793	268800	50 %	50 %	0 %	0 %	383312150
5106	NC_017028	AAT	2	6	268804	268809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312150
5107	NC_017028	ATA	2	6	268846	268851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312150
5108	NC_017028	A	6	6	268862	268867	100 %	0 %	0 %	0 %	383312150
5109	NC_017028	AAG	2	6	268877	268882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312150
5110	NC_017028	GTC	2	6	268907	268912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312150
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5112	NC_017028	A	6	6	268926	268931	100 %	0 %	0 %	0 %	383312150
5113	NC_017028	TAA	2	6	268935	268940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312150
5114	NC_017028	A	7	7	269086	269092	100 %	0 %	0 %	0 %	383312150
5115	NC_017028	TTTA	2	8	269116	269123	25 %	75 %	0 %	0 %	383312150
5116	NC_017028	TGG	2	6	269177	269182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312150
5117	NC_017028	AG	3	6	269227	269232	50 %	0 %	50 %	0 %	383312150
5118	NC_017028	TG	4	8	269334	269341	0 %	50 %	50 %	0 %	383312150
5119	NC_017028	ATG	2	6	269428	269433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312150
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5121	NC_017028	GTC	2	6	269465	269470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312150
5122	NC_017028	TAT	2	6	269509	269514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312150
5123	NC_017028	ATG	2	6	269551	269556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312150
5124	NC_017028	TA	3	6	269588	269593	50 %	50 %	0 %	0 %	383312150
5125	NC_017028	TAC	2	6	269679	269684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312150
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5127	NC_017028	AACT	2	8	269756	269763	50 %	25 %	0 %	25 %	383312150
5128	NC_017028	A	6	6	269764	269769	100 %	0 %	0 %	0 %	383312150
5129	NC_017028	TTC	2	6	269871	269876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312150
5130	NC_017028	GTA	2	6	269905	269910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312150
5131	NC_017028	AAC	2	6	269966	269971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312150
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5133	NC_017028	GA	3	6	269999	270004	50 %	0 %	50 %	0 %	383312150
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5143	NC_017028	TAT	2	6	270234	270239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312150
5144	NC_017028	AAGG	2	8	270250	270257	50 %	0 %	50 %	0 %	383312150
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5148	NC_017028	AT	3	6	270500	270505	50 %	50 %	0 %	0 %	383312150
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5154	NC_017028	CAA	2	6	270782	270787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312150
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5162	NC_017028	TTA	2	6	271139	271144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312150
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5166	NC_017028	GTAGA	2	10	271436	271445	40 %	20 %	40 %	0 %	383312150
5167	NC_017028	TAT	3	9	271476	271484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312150
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5231	NC_017028	T	6	6	274368	274373	0 %	100 %	0 %	0 %	383312152
5232	NC_017028	GATGTT	2	12	274464	274475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383312152
5233	NC_017028	GTG	2	6	274557	274562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312152
5234	NC_017028	GGC	2	6	274575	274580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383312152
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5236	NC_017028	GCA	2	6	274698	274703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312152
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5240	NC_017028	AAT	2	6	275001	275006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312152
5241	NC_017028	TAA	2	6	275026	275031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312152
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5487	NC_017028	TTATC	2	10	288334	288343	20 %	60 %	0 %	20 %	383312164
5488	NC_017028	CAT	2	6	288352	288357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312164
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