MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 44571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_016802	TGC	2	6	2463788	2463793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294343
44502	NC_016802	TTTTC	2	10	2463814	2463823	0 %	80 %	0 %	20 %	376294343
44503	NC_016802	GTG	2	6	2463835	2463840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294343
44504	NC_016802	ACG	2	6	2463861	2463866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294343
44505	NC_016802	CGG	2	6	2463871	2463876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294343
44506	NC_016802	CAG	2	6	2463895	2463900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294343
44507	NC_016802	GCT	2	6	2463905	2463910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294343
44508	NC_016802	GCA	2	6	2463921	2463926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294343
44509	NC_016802	GCG	2	6	2464143	2464148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294344
44510	NC_016802	CTT	2	6	2464282	2464287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294344
44511	NC_016802	CAT	2	6	2464318	2464323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294344
44512	NC_016802	AGC	2	6	2464395	2464400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44513	NC_016802	ATA	2	6	2464421	2464426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376294344
44514	NC_016802	TGA	2	6	2464537	2464542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376294344
44515	NC_016802	CAT	2	6	2464546	2464551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294344
44516	NC_016802	TGG	2	6	2464624	2464629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294344
44517	NC_016802	AGA	2	6	2464639	2464644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294344
44518	NC_016802	CTG	2	6	2464664	2464669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44519	NC_016802	AGCC	2	8	2464808	2464815	25 %	0 %	25 %	50 %	376294344
44520	NC_016802	CGA	2	6	2464832	2464837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44521	NC_016802	GGT	2	6	2464838	2464843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294344
44522	NC_016802	TTGG	2	8	2464862	2464869	0 %	50 %	50 %	0 %	376294344
44523	NC_016802	TCA	2	6	2464924	2464929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294344
44524	NC_016802	GCT	2	6	2464935	2464940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44525	NC_016802	GCC	2	6	2464947	2464952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294344
44526	NC_016802	GCA	2	6	2464953	2464958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44527	NC_016802	GTC	2	6	2464967	2464972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44528	NC_016802	GTC	2	6	2464982	2464987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294344
44529	NC_016802	TGGT	2	8	2465141	2465148	0 %	50 %	50 %	0 %	376294345
44530	NC_016802	CCG	3	9	2465188	2465196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294345
44531	NC_016802	T	6	6	2465210	2465215	0 %	100 %	0 %	0 %	376294345
44532	NC_016802	GAG	2	6	2465242	2465247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376294345
44533	NC_016802	ACGA	2	8	2465277	2465284	50 %	0 %	25 %	25 %	376294345
44534	NC_016802	GCT	2	6	2465357	2465362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294345
44535	NC_016802	TCC	2	6	2465377	2465382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294345
44536	NC_016802	CG	3	6	2465494	2465499	0 %	0 %	50 %	50 %	376294345
44537	NC_016802	AAG	2	6	2465592	2465597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294345
44538	NC_016802	TCC	2	6	2465700	2465705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294345
44539	NC_016802	TTC	2	6	2465733	2465738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294345
44540	NC_016802	TTTCTT	2	12	2465909	2465920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	376294346
44541	NC_016802	CTG	2	6	2465927	2465932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44542	NC_016802	GCT	2	6	2466031	2466036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44543	NC_016802	GAA	2	6	2466038	2466043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294346
44544	NC_016802	AAC	2	6	2466072	2466077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376294346
44545	NC_016802	CAT	2	6	2466134	2466139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294346
44546	NC_016802	TCA	2	6	2466145	2466150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294346
44547	NC_016802	CATCTG	3	18	2466155	2466172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376294346
44548	NC_016802	CGG	2	6	2466182	2466187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376294346
44549	NC_016802	ACG	2	6	2466206	2466211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44550	NC_016802	GTG	2	6	2466277	2466282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376294346
44551	NC_016802	CCA	2	6	2466286	2466291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376294346
44552	NC_016802	AAG	2	6	2466396	2466401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294346
44553	NC_016802	CAG	2	6	2466412	2466417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44554	NC_016802	GTACCG	2	12	2466477	2466488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44555	NC_016802	GCA	2	6	2466505	2466510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44556	NC_016802	GCAA	2	8	2466553	2466560	50 %	0 %	25 %	25 %	376294346
44557	NC_016802	TTC	2	6	2466605	2466610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376294346
44558	NC_016802	CTG	2	6	2466620	2466625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294346
44559	NC_016802	CAA	2	6	2466719	2466724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376294346
44560	NC_016802	TGC	2	6	2467179	2467184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376294347
44561	NC_016802	CTC	2	6	2467203	2467208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294347
44562	NC_016802	CGC	2	6	2467221	2467226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294347
44563	NC_016802	CAA	2	6	2467244	2467249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376294347
44564	NC_016802	TAC	2	6	2467287	2467292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376294347
44565	NC_016802	GCC	2	6	2467371	2467376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376294347
44566	NC_016802	GAA	2	6	2467418	2467423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376294347
44567	NC_016802	CTC	2	6	2467432	2467437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376294347
44568	NC_016802	ACG	2	6	2467573	2467578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294348
44569	NC_016802	ATACGG	2	12	2467613	2467624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376294348
44570	NC_016802	CGA	2	6	2467643	2467648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376294348
44571	NC_016802	GTT	2	6	2467651	2467656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376294348

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.