MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 85127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016791	TTC	2	6	51539	51544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259428
1003	NC_016791	AAG	2	6	51558	51563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259428
1004	NC_016791	CAGG	2	8	51602	51609	25 %	0 %	50 %	25 %	376259428
1005	NC_016791	AAT	2	6	51656	51661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259428
1006	NC_016791	AGG	2	6	51699	51704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259428
1007	NC_016791	GAA	3	9	51800	51808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259428
1008	NC_016791	TAA	2	6	51843	51848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259428
1009	NC_016791	ATG	2	6	52007	52012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259429
1010	NC_016791	TAC	2	6	52044	52049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259429
1011	NC_016791	AGA	2	6	52091	52096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259429
1012	NC_016791	TTTC	2	8	52175	52182	0 %	75 %	0 %	25 %	376259429
1013	NC_016791	CCAAC	2	10	52291	52300	40 %	0 %	0 %	60 %	376259429
1014	NC_016791	CAAA	2	8	52316	52323	75 %	0 %	0 %	25 %	376259429
1015	NC_016791	TTCT	2	8	52327	52334	0 %	75 %	0 %	25 %	376259429
1016	NC_016791	CTG	2	6	52401	52406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259429
1017	NC_016791	CTT	2	6	52509	52514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259429
1018	NC_016791	TTC	2	6	52528	52533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259429
1019	NC_016791	GTA	2	6	52752	52757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259429
1020	NC_016791	TCA	2	6	52813	52818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259429
1021	NC_016791	TGTT	2	8	52846	52853	0 %	75 %	25 %	0 %	376259429
1022	NC_016791	TCAT	2	8	52882	52889	25 %	50 %	0 %	25 %	376259429
1023	NC_016791	CAA	2	6	52890	52895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259429
1024	NC_016791	AGT	2	6	52934	52939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259429
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1029	NC_016791	TAA	2	6	53227	53232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259429
1030	NC_016791	CAG	2	6	53381	53386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259429
1031	NC_016791	CTT	2	6	53405	53410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259429
1032	NC_016791	AGT	2	6	53418	53423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259429
1033	NC_016791	TTA	2	6	53470	53475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259429
1034	NC_016791	GAA	2	6	53539	53544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259429
1035	NC_016791	TAGTA	2	10	53568	53577	40 %	40 %	20 %	0 %	376259429
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1039	NC_016791	AAT	2	6	54021	54026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259430
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1041	NC_016791	TTC	2	6	54188	54193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259430
1042	NC_016791	ATTA	2	8	54200	54207	50 %	50 %	0 %	0 %	376259430
1043	NC_016791	GATA	2	8	54218	54225	50 %	25 %	25 %	0 %	376259430
1044	NC_016791	CT	3	6	54377	54382	0 %	50 %	0 %	50 %	376259430
1045	NC_016791	TATCT	2	10	54383	54392	20 %	60 %	0 %	20 %	376259430
1046	NC_016791	AT	3	6	54498	54503	50 %	50 %	0 %	0 %	376259430
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1048	NC_016791	T	6	6	54531	54536	0 %	100 %	0 %	0 %	376259430
1049	NC_016791	TA	3	6	54592	54597	50 %	50 %	0 %	0 %	376259430
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1051	NC_016791	T	6	6	54713	54718	0 %	100 %	0 %	0 %	376259430
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1053	NC_016791	ATTT	2	8	54778	54785	25 %	75 %	0 %	0 %	376259430
1054	NC_016791	CTTT	2	8	54823	54830	0 %	75 %	0 %	25 %	376259431
1055	NC_016791	CATC	2	8	54839	54846	25 %	25 %	0 %	50 %	376259431
1056	NC_016791	AAG	2	6	54854	54859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259431
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1058	NC_016791	CATA	2	8	55112	55119	50 %	25 %	0 %	25 %	376259431
1059	NC_016791	ATC	2	6	55128	55133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259431
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1061	NC_016791	T	6	6	55361	55366	0 %	100 %	0 %	0 %	376259431
1062	NC_016791	CTT	2	6	55418	55423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259431
1063	NC_016791	A	6	6	55758	55763	100 %	0 %	0 %	0 %	376259431
1064	NC_016791	ATTT	2	8	55779	55786	25 %	75 %	0 %	0 %	376259431
1065	NC_016791	TAG	2	6	55788	55793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259431
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1091	NC_016791	TCAT	2	8	56903	56910	25 %	50 %	0 %	25 %	376259432
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1098	NC_016791	GAA	2	6	57311	57316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259433
1099	NC_016791	CAA	3	9	57421	57429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259433
1100	NC_016791	CAG	2	6	57481	57486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259433
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1102	NC_016791	CAAT	2	8	57613	57620	50 %	25 %	0 %	25 %	376259433
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1107	NC_016791	GCT	2	6	58518	58523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259434
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1109	NC_016791	T	6	6	58703	58708	0 %	100 %	0 %	0 %	376259434
1110	NC_016791	ATT	2	6	58780	58785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259434
1111	NC_016791	ATT	2	6	58790	58795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259434
1112	NC_016791	AGC	2	6	58822	58827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259434
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1120	NC_016791	AT	3	6	59040	59045	50 %	50 %	0 %	0 %	376259434
1121	NC_016791	CAT	2	6	59079	59084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259434
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1125	NC_016791	AATT	2	8	59385	59392	50 %	50 %	0 %	0 %	376259434
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