MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_016790	GAA	2	6	2392852	2392857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376258207
43502	NC_016790	AAC	2	6	2392886	2392891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376258207
43503	NC_016790	CAT	2	6	2392948	2392953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376258207
43504	NC_016790	TCA	2	6	2392959	2392964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376258207
43505	NC_016790	CATCTG	3	18	2392969	2392986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376258207
43506	NC_016790	CGG	2	6	2392996	2393001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376258207
43507	NC_016790	ACG	2	6	2393020	2393025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376258207
43508	NC_016790	GTG	2	6	2393091	2393096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376258207
43509	NC_016790	CCA	2	6	2393100	2393105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376258207
43510	NC_016790	AAG	2	6	2393210	2393215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376258207
43511	NC_016790	CAG	2	6	2393226	2393231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376258207
43512	NC_016790	GTACCG	2	12	2393291	2393302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376258207
43513	NC_016790	GCA	2	6	2393319	2393324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376258207
43514	NC_016790	GCAA	2	8	2393367	2393374	50 %	0 %	25 %	25 %	376258207
43515	NC_016790	TTC	2	6	2393419	2393424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376258207
43516	NC_016790	CTG	2	6	2393434	2393439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376258207
43517	NC_016790	CAA	2	6	2393533	2393538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376258207
43518	NC_016790	TGC	2	6	2393993	2393998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376258208
43519	NC_016790	CTC	2	6	2394017	2394022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376258208
43520	NC_016790	CGC	2	6	2394035	2394040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376258208
43521	NC_016790	CAA	2	6	2394058	2394063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376258208
43522	NC_016790	TAC	2	6	2394101	2394106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376258208
43523	NC_016790	GCC	2	6	2394185	2394190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376258208
43524	NC_016790	GAA	2	6	2394232	2394237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376258208
43525	NC_016790	CTC	2	6	2394246	2394251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376258208
43526	NC_016790	ACG	2	6	2394387	2394392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376258209
43527	NC_016790	ATACGG	2	12	2394427	2394438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376258209
43528	NC_016790	CGA	2	6	2394457	2394462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376258209
43529	NC_016790	GTT	2	6	2394465	2394470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376258209

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.