MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016790	GGA	2	6	154699	154704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256169
3002	NC_016790	CG	3	6	154708	154713	0 %	0 %	50 %	50 %	376256169
3003	NC_016790	GGT	2	6	154877	154882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3004	NC_016790	GAA	2	6	154910	154915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256169
3005	NC_016790	TGG	2	6	154977	154982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3006	NC_016790	CTG	2	6	154997	155002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3007	NC_016790	ACT	2	6	155121	155126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256169
3008	NC_016790	CGC	2	6	155150	155155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256169
3009	NC_016790	GCT	2	6	155158	155163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3010	NC_016790	GCC	2	6	155183	155188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256169
3011	NC_016790	CGG	2	6	155214	155219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3012	NC_016790	CATTC	2	10	155275	155284	20 %	40 %	0 %	40 %	376256169
3013	NC_016790	TGC	2	6	155302	155307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3014	NC_016790	TGCGG	2	10	155389	155398	0 %	20 %	60 %	20 %	376256169
3015	NC_016790	GCG	2	6	155410	155415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3016	NC_016790	GTGG	2	8	155446	155453	0 %	25 %	75 %	0 %	376256169
3017	NC_016790	CG	3	6	155465	155470	0 %	0 %	50 %	50 %	376256169
3018	NC_016790	GTG	2	6	155477	155482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3019	NC_016790	CGT	2	6	155494	155499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3020	NC_016790	CTGC	2	8	155519	155526	0 %	25 %	25 %	50 %	376256169
3021	NC_016790	TGG	3	9	155643	155651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3022	NC_016790	CG	3	6	155702	155707	0 %	0 %	50 %	50 %	376256169
3023	NC_016790	GGC	3	9	155737	155745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3024	NC_016790	GCG	2	6	155750	155755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3025	NC_016790	ATT	2	6	155765	155770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256169
3026	NC_016790	GGA	2	6	155824	155829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256169
3027	NC_016790	GGC	2	6	155836	155841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
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3029	NC_016790	GTC	2	6	155863	155868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3030	NC_016790	AGA	2	6	155872	155877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256169
3031	NC_016790	AGC	2	6	155889	155894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3032	NC_016790	CCT	2	6	155905	155910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256169
3033	NC_016790	AAC	2	6	155930	155935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256169
3034	NC_016790	GCA	2	6	155977	155982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3035	NC_016790	GGCG	2	8	156001	156008	0 %	0 %	75 %	25 %	376256169
3036	NC_016790	TGG	2	6	156033	156038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3037	NC_016790	GTT	2	6	156049	156054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256169
3038	NC_016790	TGA	2	6	156057	156062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256169
3039	NC_016790	GCA	2	6	156072	156077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256169
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3041	NC_016790	CT	3	6	156113	156118	0 %	50 %	0 %	50 %	376256169
3042	NC_016790	GCG	2	6	156125	156130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3043	NC_016790	CCA	2	6	156309	156314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256169
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3045	NC_016790	CTG	2	6	156378	156383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
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3049	NC_016790	GCA	2	6	156515	156520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256169
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3051	NC_016790	TGC	2	6	156573	156578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256169
3052	NC_016790	TGAC	2	8	156932	156939	25 %	25 %	25 %	25 %	376256170
3053	NC_016790	GAC	2	6	156967	156972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256170
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3055	NC_016790	CCA	2	6	157052	157057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256170
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3057	NC_016790	CGG	2	6	157173	157178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256170
3058	NC_016790	CGG	2	6	157224	157229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256170
3059	NC_016790	TGA	2	6	157238	157243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256170
3060	NC_016790	CG	3	6	157309	157314	0 %	0 %	50 %	50 %	376256170
3061	NC_016790	A	6	6	157318	157323	100 %	0 %	0 %	0 %	376256170
3062	NC_016790	TGA	2	6	157341	157346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256170
3063	NC_016790	CAT	2	6	157440	157445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256170
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3066	NC_016790	CACC	2	8	157512	157519	25 %	0 %	0 %	75 %	376256170
3067	NC_016790	CGC	2	6	157528	157533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256170
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3091	NC_016790	CAA	2	6	158469	158474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256171
3092	NC_016790	CG	3	6	158557	158562	0 %	0 %	50 %	50 %	376256171
3093	NC_016790	CA	3	6	158564	158569	50 %	0 %	0 %	50 %	376256171
3094	NC_016790	GAG	2	6	158623	158628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256171
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3103	NC_016790	ATGTGC	2	12	158915	158926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376256171
3104	NC_016790	CGG	2	6	158942	158947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256171
3105	NC_016790	CG	3	6	159008	159013	0 %	0 %	50 %	50 %	376256171
3106	NC_016790	GAA	2	6	159061	159066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256171
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3119	NC_016790	TGC	2	6	159601	159606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256172
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3121	NC_016790	CTC	2	6	159765	159770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256172
3122	NC_016790	ATC	2	6	159777	159782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256172
3123	NC_016790	GCC	2	6	159832	159837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256172
3124	NC_016790	TGC	2	6	159931	159936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256172
3125	NC_016790	GC	3	6	160019	160024	0 %	0 %	50 %	50 %	376256172
3126	NC_016790	GCA	2	6	160039	160044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256172
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3145	NC_016790	GTC	3	9	160938	160946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256173
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3225	NC_016790	GGGT	2	8	165020	165027	0 %	25 %	75 %	0 %	376256177
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3229	NC_016790	TGA	2	6	165216	165221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256177
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3232	NC_016790	CGC	2	6	165649	165654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256178
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3239	NC_016790	CTG	2	6	165896	165901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
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3241	NC_016790	CG	3	6	166008	166013	0 %	0 %	50 %	50 %	376256178
3242	NC_016790	TGC	2	6	166086	166091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
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3342	NC_016790	CA	3	6	170729	170734	50 %	0 %	0 %	50 %	376256183
3343	NC_016790	CCA	2	6	170832	170837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256183
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3345	NC_016790	CG	3	6	170956	170961	0 %	0 %	50 %	50 %	376256183
3346	NC_016790	CCA	2	6	171024	171029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256183
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3348	NC_016790	GC	5	10	171069	171078	0 %	0 %	50 %	50 %	376256183
3349	NC_016790	GTTGC	2	10	171114	171123	0 %	40 %	40 %	20 %	376256183
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3352	NC_016790	CTGC	2	8	171223	171230	0 %	25 %	25 %	50 %	376256183
3353	NC_016790	CGACTG	2	12	171245	171256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376256183
3354	NC_016790	GCA	2	6	171269	171274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256183
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3356	NC_016790	GGC	2	6	171531	171536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256183
3357	NC_016790	TCG	2	6	171537	171542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256183
3358	NC_016790	CTGC	2	8	171615	171622	0 %	25 %	25 %	50 %	376256183
3359	NC_016790	CGG	2	6	171624	171629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256183
3360	NC_016790	CTT	2	6	171657	171662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256183
3361	NC_016790	TTA	2	6	171668	171673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256183
3362	NC_016790	GCA	2	6	171794	171799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256184
3363	NC_016790	GTA	2	6	171862	171867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256184
3364	NC_016790	GGT	2	6	171868	171873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256184
3365	NC_016790	GCA	2	6	172038	172043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256184
3366	NC_016790	GCA	2	6	172058	172063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256184
3367	NC_016790	AGGC	2	8	172139	172146	25 %	0 %	50 %	25 %	376256184
3368	NC_016790	GCA	2	6	172181	172186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256184
3369	NC_016790	GGA	2	6	172212	172217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256184
3370	NC_016790	CAG	2	6	172249	172254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256184
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3372	NC_016790	GCT	2	6	172392	172397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256184
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3374	NC_016790	GGT	2	6	172423	172428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256184
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3380	NC_016790	GTC	2	6	172771	172776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256185
3381	NC_016790	GGCG	2	8	172796	172803	0 %	0 %	75 %	25 %	376256185
3382	NC_016790	GCA	2	6	172834	172839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256185
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3386	NC_016790	TGG	2	6	173221	173226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256185
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3390	NC_016790	ATC	2	6	173587	173592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256185
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3393	NC_016790	CGA	2	6	173663	173668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256185
3394	NC_016790	CGAT	2	8	173753	173760	25 %	25 %	25 %	25 %	376256185
3395	NC_016790	GCA	2	6	173773	173778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256185
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3397	NC_016790	TAC	2	6	173820	173825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256185
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3434	NC_016790	CTA	2	6	176055	176060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256187
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3436	NC_016790	CACC	2	8	176163	176170	25 %	0 %	0 %	75 %	376256187
3437	NC_016790	ACA	2	6	176186	176191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256187
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3451	NC_016790	GTG	2	6	176719	176724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256187
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3461	NC_016790	ATC	2	6	178627	178632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256188
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3463	NC_016790	CTG	2	6	178717	178722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256188
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3466	NC_016790	ATA	2	6	178808	178813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256188
3467	NC_016790	GCA	2	6	178867	178872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256188
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3470	NC_016790	ATG	2	6	178990	178995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256188
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3472	NC_016790	CTG	2	6	179079	179084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256189
3473	NC_016790	ATC	2	6	179205	179210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256189
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3475	NC_016790	TGC	2	6	179231	179236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256189
3476	NC_016790	CATCGG	2	12	179273	179284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376256189
3477	NC_016790	ACCT	2	8	179439	179446	25 %	25 %	0 %	50 %	376256189
3478	NC_016790	CCG	2	6	179458	179463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256189
3479	NC_016790	CTAC	2	8	179512	179519	25 %	25 %	0 %	50 %	376256189
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3481	NC_016790	CCT	2	6	179605	179610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256189
3482	NC_016790	TGT	2	6	179624	179629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256189
3483	NC_016790	GTAC	2	8	179738	179745	25 %	25 %	25 %	25 %	376256189
3484	NC_016790	TTC	2	6	179778	179783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256189
3485	NC_016790	TGC	3	9	179854	179862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256189
3486	NC_016790	TGA	2	6	179914	179919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256189
3487	NC_016790	TGA	2	6	179977	179982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256189
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3490	NC_016790	ATC	2	6	180084	180089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256189
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