MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_016790	ATA	2	6	254484	254489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256262
5004	NC_016790	ATAA	2	8	254519	254526	75 %	25 %	0 %	0 %	376256262
5005	NC_016790	CTT	2	6	254549	254554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256262
5006	NC_016790	GCA	2	6	254555	254560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256262
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5008	NC_016790	TGC	2	6	254707	254712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256262
5009	NC_016790	CGAT	2	8	254876	254883	25 %	25 %	25 %	25 %	376256262
5010	NC_016790	GGC	2	6	254901	254906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256262
5011	NC_016790	CTT	2	6	254921	254926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256262
5012	NC_016790	CG	3	6	255015	255020	0 %	0 %	50 %	50 %	376256262
5013	NC_016790	CTTTT	2	10	255099	255108	0 %	80 %	0 %	20 %	376256262
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5017	NC_016790	TGT	2	6	255409	255414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256263
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5019	NC_016790	TGC	2	6	255556	255561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256263
5020	NC_016790	CGG	2	6	255578	255583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256263
5021	NC_016790	ACC	2	6	255663	255668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256263
5022	NC_016790	GC	3	6	255716	255721	0 %	0 %	50 %	50 %	376256263
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5029	NC_016790	TGG	2	6	255955	255960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256263
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5036	NC_016790	CAATC	2	10	256301	256310	40 %	20 %	0 %	40 %	376256264
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5116	NC_016790	AT	3	6	261880	261885	50 %	50 %	0 %	0 %	376256269
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5119	NC_016790	AGC	2	6	261949	261954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256269
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5121	NC_016790	TGA	2	6	262058	262063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256269
5122	NC_016790	TTG	2	6	262078	262083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256269
5123	NC_016790	AACA	2	8	262105	262112	75 %	0 %	0 %	25 %	376256269
5124	NC_016790	TC	3	6	262180	262185	0 %	50 %	0 %	50 %	376256269
5125	NC_016790	GTT	2	6	262233	262238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256269
5126	NC_016790	GCG	2	6	262267	262272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256269
5127	NC_016790	GGC	2	6	262344	262349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256269
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5129	NC_016790	GAA	2	6	262403	262408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256269
5130	NC_016790	ATG	2	6	262447	262452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256269
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5132	NC_016790	TGT	2	6	262595	262600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256269
5133	NC_016790	TGG	2	6	262634	262639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256269
5134	NC_016790	CCTG	2	8	262659	262666	0 %	25 %	25 %	50 %	376256269
5135	NC_016790	ACTGA	2	10	262674	262683	40 %	20 %	20 %	20 %	376256269
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5138	NC_016790	TAGA	2	8	262855	262862	50 %	25 %	25 %	0 %	376256269
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5144	NC_016790	TGA	2	6	263032	263037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256269
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5151	NC_016790	CAAGC	2	10	263419	263428	40 %	0 %	20 %	40 %	376256269
5152	NC_016790	CGCA	2	8	263489	263496	25 %	0 %	25 %	50 %	376256269
5153	NC_016790	GCT	2	6	263564	263569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256269
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5157	NC_016790	GAA	2	6	263747	263752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256269
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5162	NC_016790	TCGAGG	2	12	263884	263895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376256269
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5164	NC_016790	GCCG	2	8	264014	264021	0 %	0 %	50 %	50 %	376256269
5165	NC_016790	CAG	2	6	264117	264122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256269
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5170	NC_016790	ACA	2	6	264515	264520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256269
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5240	NC_016790	TCT	2	6	268579	268584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256270
5241	NC_016790	CTTCGA	2	12	268589	268600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376256270
5242	NC_016790	GAG	2	6	268624	268629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256270
5243	NC_016790	ATC	2	6	268630	268635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256270
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5245	NC_016790	CGG	2	6	268690	268695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256270
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5253	NC_016790	TGC	2	6	269183	269188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256270
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5255	NC_016790	GCT	2	6	269341	269346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256270
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5269	NC_016790	CG	3	6	270078	270083	0 %	0 %	50 %	50 %	376256271
5270	NC_016790	TTTG	2	8	270145	270152	0 %	75 %	25 %	0 %	376256271
5271	NC_016790	TGC	2	6	270185	270190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256271
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5273	NC_016790	GGA	2	6	270209	270214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256271
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5285	NC_016790	GTAG	2	8	270655	270662	25 %	25 %	50 %	0 %	376256272
5286	NC_016790	CGT	2	6	270664	270669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256272
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5342	NC_016790	CG	3	6	273189	273194	0 %	0 %	50 %	50 %	376256274
5343	NC_016790	GAT	2	6	273200	273205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256274
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5351	NC_016790	CAC	3	9	273444	273452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256274
5352	NC_016790	CCA	2	6	273464	273469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256274
5353	NC_016790	CCA	2	6	273476	273481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256274
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5358	NC_016790	GAA	2	6	273836	273841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256275
5359	NC_016790	GCTGC	2	10	273843	273852	0 %	20 %	40 %	40 %	376256275
5360	NC_016790	AGC	2	6	273855	273860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256275
5361	NC_016790	CAC	2	6	273886	273891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256275
5362	NC_016790	AC	3	6	273898	273903	50 %	0 %	0 %	50 %	376256275
5363	NC_016790	ATC	2	6	273905	273910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256275
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5365	NC_016790	CCG	3	9	273994	274002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256275
5366	NC_016790	CCG	2	6	274009	274014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256275
5367	NC_016790	AACCAC	2	12	274023	274034	50 %	0 %	0 %	50 %	376256275
5368	NC_016790	ATC	2	6	274070	274075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256275
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5373	NC_016790	CGG	2	6	274334	274339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256275
5374	NC_016790	GCG	2	6	274368	274373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256275
5375	NC_016790	TGC	2	6	274434	274439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256275
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5377	NC_016790	GTG	2	6	274476	274481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256275
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5381	NC_016790	CCA	2	6	274609	274614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256275
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5392	NC_016790	CCG	2	6	275307	275312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256276
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5481	NC_016790	TCG	2	6	279875	279880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256278
5482	NC_016790	CA	3	6	279884	279889	50 %	0 %	0 %	50 %	376256278
5483	NC_016790	CTG	2	6	279913	279918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256278
5484	NC_016790	GAA	2	6	279958	279963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256278
5485	NC_016790	GAAG	2	8	280008	280015	50 %	0 %	50 %	0 %	376256278
5486	NC_016790	GAT	2	6	280256	280261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256279
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5491	NC_016790	CTA	2	6	280580	280585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256279
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5500	NC_016790	GC	3	6	280985	280990	0 %	0 %	50 %	50 %	376256279

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