MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 44847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_016788	CGT	2	6	2276308	2276313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249464
41002	NC_016788	GAG	2	6	2276331	2276336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249464
41003	NC_016788	CAA	2	6	2276368	2276373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249464
41004	NC_016788	AAC	2	6	2276443	2276448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249464
41005	NC_016788	ACC	2	6	2276500	2276505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249464
41006	NC_016788	TCA	2	6	2276549	2276554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41007	NC_016788	ACA	2	6	2276564	2276569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249464
41008	NC_016788	CAG	2	6	2276634	2276639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249464
41009	NC_016788	AAC	2	6	2276659	2276664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249464
41010	NC_016788	CTCAAA	2	12	2276680	2276691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41011	NC_016788	TGA	2	6	2276697	2276702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249464
41012	NC_016788	GGAGCA	2	12	2276711	2276722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	376249464
41013	NC_016788	TTC	2	6	2276728	2276733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41014	NC_016788	CAT	2	6	2276772	2276777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41015	NC_016788	CAG	2	6	2276796	2276801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249464
41016	NC_016788	CTT	2	6	2276836	2276841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41017	NC_016788	CAA	2	6	2276883	2276888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249464
41018	NC_016788	ATC	2	6	2276963	2276968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41019	NC_016788	TAT	2	6	2277027	2277032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249464
41020	NC_016788	TACA	2	8	2277040	2277047	50 %	25 %	0 %	25 %	376249464
41021	NC_016788	GAG	2	6	2277048	2277053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249464
41022	NC_016788	ATC	2	6	2277061	2277066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41023	NC_016788	CTT	2	6	2277183	2277188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41024	NC_016788	CTA	2	6	2277192	2277197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41025	NC_016788	AGTAA	2	10	2277229	2277238	60 %	20 %	20 %	0 %	376249464
41026	NC_016788	CTT	2	6	2277295	2277300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41027	NC_016788	AATA	2	8	2277510	2277517	75 %	25 %	0 %	0 %	376249464
41028	NC_016788	TCA	2	6	2277521	2277526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249464
41029	NC_016788	ATA	2	6	2277562	2277567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376249464
41030	NC_016788	A	6	6	2277611	2277616	100 %	0 %	0 %	0 %	376249464
41031	NC_016788	TCT	2	6	2277644	2277649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41032	NC_016788	CTT	2	6	2277658	2277663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41033	NC_016788	T	6	6	2277757	2277762	0 %	100 %	0 %	0 %	376249464
41034	NC_016788	GTC	2	6	2277815	2277820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249464
41035	NC_016788	GTT	2	6	2277907	2277912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249464
41036	NC_016788	TTC	2	6	2277913	2277918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249464
41037	NC_016788	TTTTC	2	10	2277939	2277948	0 %	80 %	0 %	20 %	376249464
41038	NC_016788	C	6	6	2277955	2277960	0 %	0 %	0 %	100 %	376249464
41039	NC_016788	AAT	2	6	2278006	2278011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376249464
41040	NC_016788	GC	3	6	2278558	2278563	0 %	0 %	50 %	50 %	376249465
41041	NC_016788	TTC	2	6	2278576	2278581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249465
41042	NC_016788	TGC	2	6	2278647	2278652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249465
41043	NC_016788	TTA	2	6	2278653	2278658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249465
41044	NC_016788	TTG	2	6	2278751	2278756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249465
41045	NC_016788	CGC	2	6	2278809	2278814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249465
41046	NC_016788	CTG	2	6	2278827	2278832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249465
41047	NC_016788	CTT	2	6	2278911	2278916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249465
41048	NC_016788	ATC	2	6	2279110	2279115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249466
41049	NC_016788	AAG	2	6	2279151	2279156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249466
41050	NC_016788	TGC	2	6	2279166	2279171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249466
41051	NC_016788	GCTCG	2	10	2279200	2279209	0 %	20 %	40 %	40 %	376249466
41052	NC_016788	CTT	2	6	2279286	2279291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249466
41053	NC_016788	T	6	6	2279294	2279299	0 %	100 %	0 %	0 %	376249466
41054	NC_016788	CGT	2	6	2279410	2279415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249466
41055	NC_016788	TCA	2	6	2279437	2279442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249466
41056	NC_016788	CTT	2	6	2279684	2279689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249467
41057	NC_016788	CGCAA	2	10	2279736	2279745	40 %	0 %	20 %	40 %	376249467
41058	NC_016788	CTT	2	6	2279843	2279848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249467
41059	NC_016788	CAT	2	6	2279849	2279854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249467
41060	NC_016788	GC	3	6	2279856	2279861	0 %	0 %	50 %	50 %	376249467
41061	NC_016788	CAG	2	6	2279878	2279883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249467
41062	NC_016788	ATC	2	6	2279901	2279906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249467
41063	NC_016788	GCA	3	9	2279916	2279924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249467
41064	NC_016788	TTC	2	6	2279979	2279984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249467
41065	NC_016788	AACC	2	8	2280094	2280101	50 %	0 %	0 %	50 %	376249467
41066	NC_016788	TGT	2	6	2280160	2280165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249467
41067	NC_016788	GCC	2	6	2280192	2280197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249467
41068	NC_016788	GGTT	2	8	2280240	2280247	0 %	50 %	50 %	0 %	376249467
41069	NC_016788	ATG	2	6	2280294	2280299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249467
41070	NC_016788	ATC	2	6	2280332	2280337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249467
41071	NC_016788	TCG	2	6	2280339	2280344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249467
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41075	NC_016788	TGC	2	6	2280492	2280497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249467
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41082	NC_016788	CAC	2	6	2280709	2280714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249467
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41084	NC_016788	CAC	2	6	2280829	2280834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249467
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41087	NC_016788	AGA	2	6	2281077	2281082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249467
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41089	NC_016788	TCG	2	6	2281119	2281124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249467
41090	NC_016788	GCCCGC	2	12	2281131	2281142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249467
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41092	NC_016788	CCA	2	6	2281293	2281298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249468
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41095	NC_016788	CAT	2	6	2281407	2281412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249468
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41097	NC_016788	CCG	2	6	2281530	2281535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249468
41098	NC_016788	GTG	2	6	2281559	2281564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249468
41099	NC_016788	CAT	2	6	2281579	2281584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249468
41100	NC_016788	CAG	2	6	2281615	2281620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
41101	NC_016788	TCT	2	6	2281653	2281658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249468
41102	NC_016788	TTC	2	6	2281696	2281701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249468
41103	NC_016788	AGCAA	2	10	2281742	2281751	60 %	0 %	20 %	20 %	376249468
41104	NC_016788	ATG	2	6	2281835	2281840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249468
41105	NC_016788	TCA	2	6	2281868	2281873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249468
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41107	NC_016788	ACG	2	6	2281909	2281914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
41108	NC_016788	GCTG	2	8	2282009	2282016	0 %	25 %	50 %	25 %	376249468
41109	NC_016788	GGGC	2	8	2282030	2282037	0 %	0 %	75 %	25 %	376249468
41110	NC_016788	GCA	2	6	2282040	2282045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
41111	NC_016788	CTG	2	6	2282119	2282124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249468
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41114	NC_016788	CGG	2	6	2282355	2282360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249468
41115	NC_016788	TCC	2	6	2282390	2282395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249468
41116	NC_016788	GCG	2	6	2282448	2282453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249468
41117	NC_016788	GATC	2	8	2282517	2282524	25 %	25 %	25 %	25 %	376249468
41118	NC_016788	GC	3	6	2282582	2282587	0 %	0 %	50 %	50 %	376249468
41119	NC_016788	CTC	2	6	2282593	2282598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249468
41120	NC_016788	ACT	2	6	2282660	2282665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249468
41121	NC_016788	ACC	2	6	2282672	2282677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249468
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41123	NC_016788	GTG	2	6	2282723	2282728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249468
41124	NC_016788	CTG	2	6	2282746	2282751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249468
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41126	NC_016788	GC	3	6	2282871	2282876	0 %	0 %	50 %	50 %	376249468
41127	NC_016788	GC	3	6	2282955	2282960	0 %	0 %	50 %	50 %	376249468
41128	NC_016788	GAC	2	6	2283008	2283013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
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41144	NC_016788	CCAC	2	8	2283572	2283579	25 %	0 %	0 %	75 %	376249468
41145	NC_016788	GGCT	2	8	2283607	2283614	0 %	25 %	50 %	25 %	376249468
41146	NC_016788	TTG	2	6	2283637	2283642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249468
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41148	NC_016788	CCA	2	6	2283675	2283680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249468
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41150	NC_016788	CATCG	2	10	2283760	2283769	20 %	20 %	20 %	40 %	376249468
41151	NC_016788	GCC	2	6	2283781	2283786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249468
41152	NC_016788	GGC	2	6	2283787	2283792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249468
41153	NC_016788	CAG	2	6	2283859	2283864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
41154	NC_016788	GGT	2	6	2283913	2283918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249468
41155	NC_016788	TGA	2	6	2283939	2283944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249468
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41160	NC_016788	CTT	2	6	2284033	2284038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249468
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41178	NC_016788	GC	3	6	2284814	2284819	0 %	0 %	50 %	50 %	376249468
41179	NC_016788	GCA	2	6	2284821	2284826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
41180	NC_016788	GAGCAC	2	12	2284951	2284962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249468
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41192	NC_016788	ATG	2	6	2285405	2285410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249468
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41212	NC_016788	TCT	2	6	2286565	2286570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249469
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41214	NC_016788	CAG	2	6	2286819	2286824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
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41217	NC_016788	CAG	2	6	2286953	2286958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
41218	NC_016788	GCA	2	6	2286994	2286999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
41219	NC_016788	ACG	2	6	2287050	2287055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
41220	NC_016788	GCT	2	6	2287082	2287087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249469
41221	NC_016788	CAT	2	6	2287107	2287112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249469
41222	NC_016788	CAA	2	6	2287128	2287133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249469
41223	NC_016788	AACA	2	8	2287137	2287144	75 %	0 %	0 %	25 %	376249469
41224	NC_016788	GAT	2	6	2287152	2287157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249469
41225	NC_016788	GCA	2	6	2287232	2287237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
41226	NC_016788	GGTT	2	8	2287256	2287263	0 %	50 %	50 %	0 %	376249469
41227	NC_016788	CAC	2	6	2287266	2287271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249469
41228	NC_016788	GCA	3	9	2287339	2287347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249469
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41461	NC_016788	GCA	2	6	2299696	2299701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249479
41462	NC_016788	CA	3	6	2299731	2299736	50 %	0 %	0 %	50 %	376249479
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41487	NC_016788	CTG	2	6	2301039	2301044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249480
41488	NC_016788	GTG	2	6	2301051	2301056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249480
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41491	NC_016788	CAG	3	9	2301107	2301115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249480
41492	NC_016788	TGG	2	6	2301124	2301129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249480
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41494	NC_016788	GCC	2	6	2301227	2301232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249480
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41496	NC_016788	CCAC	2	8	2301382	2301389	25 %	0 %	0 %	75 %	376249480
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