MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 43784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016786	GTT	2	6	260154	260159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244841
5003	NC_016786	AAG	2	6	260161	260166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244841
5004	NC_016786	GCA	2	6	260193	260198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244841
5005	NC_016786	CTG	2	6	260223	260228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244841
5006	NC_016786	CCA	2	6	260231	260236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244841
5007	NC_016786	TGC	2	6	260239	260244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244841
5008	NC_016786	ACC	2	6	260250	260255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244841
5009	NC_016786	CCG	2	6	260257	260262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244841
5010	NC_016786	GAA	2	6	260373	260378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244841
5011	NC_016786	CACT	2	8	260381	260388	25 %	25 %	0 %	50 %	376244841
5012	NC_016786	TGT	2	6	260425	260430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244841
5013	NC_016786	TGG	2	6	260434	260439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244841
5014	NC_016786	AAT	2	6	260512	260517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376244841
5015	NC_016786	TGG	2	6	260529	260534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244842
5016	NC_016786	CCGC	2	8	260607	260614	0 %	0 %	25 %	75 %	376244842
5017	NC_016786	GAGT	2	8	260685	260692	25 %	25 %	50 %	0 %	376244842
5018	NC_016786	CCT	2	6	260771	260776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376244842
5019	NC_016786	CCG	2	6	260786	260791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244842
5020	NC_016786	ACCA	2	8	260841	260848	50 %	0 %	0 %	50 %	376244842
5021	NC_016786	CCG	2	6	260855	260860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244842
5022	NC_016786	GAAG	2	8	260957	260964	50 %	0 %	50 %	0 %	376244842
5023	NC_016786	GAA	2	6	260975	260980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244842
5024	NC_016786	GCT	2	6	260992	260997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244842
5025	NC_016786	TTG	2	6	261028	261033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244842
5026	NC_016786	GC	3	6	261036	261041	0 %	0 %	50 %	50 %	376244842
5027	NC_016786	GTT	2	6	261109	261114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244842
5028	NC_016786	AGGGG	2	10	261213	261222	20 %	0 %	80 %	0 %	376244842
5029	NC_016786	GCG	2	6	261244	261249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244842
5030	NC_016786	AT	3	6	261268	261273	50 %	50 %	0 %	0 %	376244842
5031	NC_016786	TA	4	8	261294	261301	50 %	50 %	0 %	0 %	376244842
5032	NC_016786	TTC	2	6	261322	261327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244842
5033	NC_016786	TAG	2	6	261365	261370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244842
5034	NC_016786	GT	3	6	261372	261377	0 %	50 %	50 %	0 %	376244842
5035	NC_016786	TTG	2	6	261404	261409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244842
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5037	NC_016786	GGTGA	2	10	261445	261454	20 %	20 %	60 %	0 %	376244842
5038	NC_016786	CAAT	2	8	261486	261493	50 %	25 %	0 %	25 %	376244842
5039	NC_016786	CAG	2	6	261522	261527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244842
5040	NC_016786	TG	3	6	261567	261572	0 %	50 %	50 %	0 %	376244842
5041	NC_016786	AGC	2	6	261646	261651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244842
5042	NC_016786	GA	3	6	261833	261838	50 %	0 %	50 %	0 %	376244842
5043	NC_016786	ACT	2	6	261884	261889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244842
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5045	NC_016786	CGT	2	6	261932	261937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244842
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5050	NC_016786	TCG	2	6	262219	262224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244843
5051	NC_016786	TCGG	2	8	262230	262237	0 %	25 %	50 %	25 %	376244843
5052	NC_016786	TGC	2	6	262262	262267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244843
5053	NC_016786	GC	3	6	262302	262307	0 %	0 %	50 %	50 %	376244843
5054	NC_016786	AGA	2	6	262366	262371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244843
5055	NC_016786	CAAGCT	2	12	262391	262402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376244843
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5057	NC_016786	CGA	2	6	262565	262570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
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5059	NC_016786	CAACC	2	10	262799	262808	40 %	0 %	0 %	60 %	376244843
5060	NC_016786	GTG	2	6	262876	262881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244843
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5062	NC_016786	TCG	2	6	262930	262935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244843
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5070	NC_016786	AAG	2	6	263248	263253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244843
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5078	NC_016786	AGCC	2	8	263630	263637	25 %	0 %	25 %	50 %	376244843
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5089	NC_016786	AAG	2	6	264031	264036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244843
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5091	NC_016786	GC	3	6	264125	264130	0 %	0 %	50 %	50 %	376244843
5092	NC_016786	ACTC	2	8	264161	264168	25 %	25 %	0 %	50 %	376244843
5093	NC_016786	AAC	2	6	264234	264239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244843
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5095	NC_016786	ACG	3	9	264295	264303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
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5100	NC_016786	GCA	2	6	264417	264422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
5101	NC_016786	AAAAG	2	10	264428	264437	80 %	0 %	20 %	0 %	376244843
5102	NC_016786	ATC	2	6	264450	264455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244843
5103	NC_016786	GTT	2	6	264485	264490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244843
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5106	NC_016786	GAA	2	6	264623	264628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244843
5107	NC_016786	GCGA	2	8	264651	264658	25 %	0 %	50 %	25 %	376244843
5108	NC_016786	CGA	2	6	264683	264688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
5109	NC_016786	CGC	2	6	264693	264698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244843
5110	NC_016786	GTCGCG	2	12	264718	264729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	376244843
5111	NC_016786	ACG	2	6	264769	264774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
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5113	NC_016786	CGA	2	6	264860	264865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
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5118	NC_016786	CGA	2	6	264955	264960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244843
5119	NC_016786	A	6	6	264960	264965	100 %	0 %	0 %	0 %	376244843
5120	NC_016786	ACC	2	6	264978	264983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244843
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5243	NC_016786	GCA	2	6	270330	270335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244849
5244	NC_016786	GC	3	6	270347	270352	0 %	0 %	50 %	50 %	376244849
5245	NC_016786	ACG	2	6	270433	270438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244849
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5247	NC_016786	CAT	2	6	270485	270490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244849
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5255	NC_016786	GAC	2	6	270621	270626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244849
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5262	NC_016786	TCG	2	6	270931	270936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244849
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5313	NC_016786	AGT	2	6	273163	273168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244851
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5353	NC_016786	AGCG	2	8	276086	276093	25 %	0 %	50 %	25 %	376244852
5354	NC_016786	GC	3	6	276105	276110	0 %	0 %	50 %	50 %	376244852
5355	NC_016786	CAAC	2	8	276168	276175	50 %	0 %	0 %	50 %	376244852
5356	NC_016786	CCGA	2	8	276191	276198	25 %	0 %	25 %	50 %	376244852
5357	NC_016786	ACT	2	6	276206	276211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244852
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5479	NC_016786	CG	3	6	284011	284016	0 %	0 %	50 %	50 %	376244862
5480	NC_016786	TTTG	2	8	284078	284085	0 %	75 %	25 %	0 %	376244862
5481	NC_016786	TGC	2	6	284118	284123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244862
5482	NC_016786	CGC	2	6	284133	284138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244862
5483	NC_016786	GGA	2	6	284142	284147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244862
5484	NC_016786	TCCGC	2	10	284207	284216	0 %	20 %	20 %	60 %	376244862
5485	NC_016786	TG	3	6	284234	284239	0 %	50 %	50 %	0 %	376244862
5486	NC_016786	AGC	2	6	284249	284254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244862
5487	NC_016786	GTG	2	6	284269	284274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244862
5488	NC_016786	CTGC	2	8	284299	284306	0 %	25 %	25 %	50 %	376244862
5489	NC_016786	T	6	6	284379	284384	0 %	100 %	0 %	0 %	376244863
5490	NC_016786	GAT	2	6	284460	284465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244863
5491	NC_016786	GTA	2	6	284483	284488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244863
5492	NC_016786	AGG	2	6	284498	284503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244863
5493	NC_016786	CGC	2	6	284549	284554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244863
5494	NC_016786	CTTGC	2	10	284577	284586	0 %	40 %	20 %	40 %	376244863
5495	NC_016786	CGT	2	6	284597	284602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244863
5496	NC_016786	CGC	2	6	284624	284629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244863
5497	NC_016786	GAC	2	6	284661	284666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244863
5498	NC_016786	GTT	2	6	284670	284675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244863
5499	NC_016786	CAC	2	6	284691	284696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244863
5500	NC_016786	GTGG	2	8	284711	284718	0 %	25 %	75 %	0 %	376244863

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