MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 53773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016024	TTCCG	2	10	500570	500579	0 %	40 %	20 %	40 %	347754139
10003	NC_016024	GGC	2	6	500649	500654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754139
10004	NC_016024	GAG	2	6	500709	500714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754139
10005	NC_016024	GCA	2	6	500780	500785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754139
10006	NC_016024	GCGG	2	8	500930	500937	0 %	0 %	75 %	25 %	347754139
10007	NC_016024	GC	3	6	501102	501107	0 %	0 %	50 %	50 %	347754139
10008	NC_016024	GC	3	6	501111	501116	0 %	0 %	50 %	50 %	347754139
10009	NC_016024	GCAC	2	8	501139	501146	25 %	0 %	25 %	50 %	347754139
10010	NC_016024	GCT	2	6	501149	501154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754139
10011	NC_016024	TCA	2	6	501190	501195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754139
10012	NC_016024	GAA	2	6	501201	501206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754139
10013	NC_016024	TGGCG	2	10	501215	501224	0 %	20 %	60 %	20 %	347754139
10014	NC_016024	GCG	2	6	501248	501253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754139
10015	NC_016024	CGT	2	6	501377	501382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754139
10016	NC_016024	GC	3	6	501432	501437	0 %	0 %	50 %	50 %	347754139
10017	NC_016024	T	6	6	501450	501455	0 %	100 %	0 %	0 %	347754139
10018	NC_016024	GCG	2	6	501516	501521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754139
10019	NC_016024	ATG	2	6	501573	501578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754139
10020	NC_016024	CGA	2	6	501613	501618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754139
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10022	NC_016024	TCA	2	6	501664	501669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754139
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10024	NC_016024	CCG	2	6	501762	501767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754139
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10026	NC_016024	GGC	2	6	501803	501808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754139
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10032	NC_016024	GCCCGC	2	12	502150	502161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754139
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10034	NC_016024	TGG	2	6	502306	502311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754139
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10042	NC_016024	CCTG	2	8	502840	502847	0 %	25 %	25 %	50 %	347754140
10043	NC_016024	CCA	2	6	502886	502891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754140
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10052	NC_016024	GCC	3	9	503763	503771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754140
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10107	NC_016024	TCGCT	2	10	506219	506228	0 %	40 %	20 %	40 %	347754142
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10115	NC_016024	TGA	2	6	506542	506547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754143
10116	NC_016024	ACGG	2	8	506581	506588	25 %	0 %	50 %	25 %	347754143
10117	NC_016024	CTG	2	6	506589	506594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754143
10118	NC_016024	TCA	2	6	506836	506841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754143
10119	NC_016024	CGG	2	6	506877	506882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754143
10120	NC_016024	GGAC	2	8	507053	507060	25 %	0 %	50 %	25 %	347754143
10121	NC_016024	CAT	2	6	507107	507112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754143
10122	NC_016024	CAG	2	6	507159	507164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754143
10123	NC_016024	GTG	2	6	507198	507203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754143
10124	NC_016024	GC	3	6	507225	507230	0 %	0 %	50 %	50 %	347754143
10125	NC_016024	CGG	2	6	507234	507239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754143
10126	NC_016024	TCA	2	6	507241	507246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754143
10127	NC_016024	ACG	3	9	507297	507305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754143
10128	NC_016024	CGC	2	6	507311	507316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754143
10129	NC_016024	ATC	2	6	507348	507353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754143
10130	NC_016024	CAT	2	6	507389	507394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754143
10131	NC_016024	GC	3	6	507443	507448	0 %	0 %	50 %	50 %	347754143
10132	NC_016024	CGC	2	6	507524	507529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754143
10133	NC_016024	CAC	2	6	507551	507556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754143
10134	NC_016024	CAA	2	6	507566	507571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754143
10135	NC_016024	GAA	2	6	507720	507725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754143
10136	NC_016024	CAAG	2	8	507739	507746	50 %	0 %	25 %	25 %	347754143
10137	NC_016024	T	6	6	507760	507765	0 %	100 %	0 %	0 %	347754143
10138	NC_016024	GCT	2	6	507778	507783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754143
10139	NC_016024	CGC	2	6	507894	507899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754143
10140	NC_016024	CG	3	6	507902	507907	0 %	0 %	50 %	50 %	347754143
10141	NC_016024	GAA	2	6	507909	507914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754143
10142	NC_016024	TCG	2	6	507997	508002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754143
10143	NC_016024	AAGG	2	8	508189	508196	50 %	0 %	50 %	0 %	347754144
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10145	NC_016024	GACCA	2	10	508408	508417	40 %	0 %	20 %	40 %	347754144
10146	NC_016024	CGG	2	6	508508	508513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754144
10147	NC_016024	GC	3	6	508558	508563	0 %	0 %	50 %	50 %	347754144
10148	NC_016024	TCA	2	6	508592	508597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754144
10149	NC_016024	CAT	2	6	508614	508619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754144
10150	NC_016024	CGT	2	6	508650	508655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754144
10151	NC_016024	CGGC	2	8	508724	508731	0 %	0 %	50 %	50 %	347754144
10152	NC_016024	CGG	2	6	508833	508838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754144
10153	NC_016024	TCA	2	6	508868	508873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754144
10154	NC_016024	GCT	2	6	508926	508931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754144
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10156	NC_016024	GCA	2	6	508947	508952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754144
10157	NC_016024	GGT	2	6	508953	508958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754144
10158	NC_016024	TGC	2	6	508979	508984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754144
10159	NC_016024	ATC	2	6	509014	509019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754144
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10167	NC_016024	GCCG	2	8	509241	509248	0 %	0 %	50 %	50 %	347754144
10168	NC_016024	TCT	2	6	509252	509257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754144
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10175	NC_016024	CGA	2	6	509612	509617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754144
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10221	NC_016024	TGC	3	9	512119	512127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754147
10222	NC_016024	GAC	2	6	512165	512170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754147
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10226	NC_016024	GCA	2	6	512423	512428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754147
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10229	NC_016024	TGC	2	6	512488	512493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754147
10230	NC_016024	CCG	2	6	512548	512553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754147
10231	NC_016024	TGC	2	6	512569	512574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754147
10232	NC_016024	TTC	2	6	512577	512582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754147
10233	NC_016024	TCAG	2	8	512677	512684	25 %	25 %	25 %	25 %	347754147
10234	NC_016024	CAC	2	6	512725	512730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754147
10235	NC_016024	AGC	2	6	512731	512736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754147
10236	NC_016024	TTC	2	6	512747	512752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754147
10237	NC_016024	GTT	2	6	512868	512873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754148
10238	NC_016024	CGC	2	6	512890	512895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754148
10239	NC_016024	TGC	2	6	512896	512901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754148
10240	NC_016024	ACG	2	6	512925	512930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754148
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10242	NC_016024	CG	3	6	513111	513116	0 %	0 %	50 %	50 %	347754148
10243	NC_016024	GCC	2	6	513129	513134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754148
10244	NC_016024	TGTGG	2	10	513225	513234	0 %	40 %	60 %	0 %	347754148
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10246	NC_016024	GGCAAT	2	12	513324	513335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347754148
10247	NC_016024	GC	5	10	513343	513352	0 %	0 %	50 %	50 %	347754148
10248	NC_016024	CGT	2	6	513353	513358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754148
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10250	NC_016024	TG	3	6	513450	513455	0 %	50 %	50 %	0 %	347754148
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10252	NC_016024	TCA	2	6	513529	513534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754148
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10255	NC_016024	GGC	2	6	513698	513703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754148
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10307	NC_016024	ACCG	2	8	516049	516056	25 %	0 %	25 %	50 %	347754152
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10344	NC_016024	CCGT	2	8	517562	517569	0 %	25 %	25 %	50 %	347754153
10345	NC_016024	TGC	2	6	517668	517673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754153
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10353	NC_016024	CCG	2	6	517847	517852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754153
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10355	NC_016024	GAT	2	6	517870	517875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754153
10356	NC_016024	CAA	2	6	517884	517889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754153
10357	NC_016024	GTG	2	6	518019	518024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754154
10358	NC_016024	GGT	2	6	518043	518048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754154
10359	NC_016024	T	6	6	518291	518296	0 %	100 %	0 %	0 %	347754154
10360	NC_016024	CGG	2	6	518363	518368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754155
10361	NC_016024	CAG	2	6	518385	518390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754155
10362	NC_016024	GC	3	6	518470	518475	0 %	0 %	50 %	50 %	347754155
10363	NC_016024	GTGCA	2	10	518550	518559	20 %	20 %	40 %	20 %	347754155
10364	NC_016024	CGGCT	2	10	518586	518595	0 %	20 %	40 %	40 %	347754155
10365	NC_016024	ATG	2	6	518659	518664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754155
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10367	NC_016024	GCC	2	6	519138	519143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754156
10368	NC_016024	TGA	2	6	519162	519167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754156
10369	NC_016024	TG	3	6	519239	519244	0 %	50 %	50 %	0 %	347754156
10370	NC_016024	GGC	2	6	519278	519283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754156
10371	NC_016024	GCT	2	6	519290	519295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754156
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10374	NC_016024	TGC	2	6	519354	519359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10375	NC_016024	CGC	2	6	519360	519365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754156
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10377	NC_016024	CAT	3	9	519442	519450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754156
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10379	NC_016024	CGCC	2	8	519492	519499	0 %	0 %	25 %	75 %	347754156
10380	NC_016024	CGG	2	6	519508	519513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754156
10381	NC_016024	GAC	2	6	519523	519528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10382	NC_016024	CAG	2	6	519536	519541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10383	NC_016024	GC	3	6	519559	519564	0 %	0 %	50 %	50 %	347754156
10384	NC_016024	GCA	2	6	519591	519596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10385	NC_016024	TTG	3	9	519606	519614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754156
10386	NC_016024	CGT	2	6	519627	519632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10387	NC_016024	CATC	2	8	519666	519673	25 %	25 %	0 %	50 %	347754156
10388	NC_016024	CGC	2	6	519768	519773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754156
10389	NC_016024	GC	4	8	519772	519779	0 %	0 %	50 %	50 %	347754156
10390	NC_016024	TGGAC	2	10	519820	519829	20 %	20 %	40 %	20 %	347754156
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10393	NC_016024	GTC	2	6	519866	519871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754156
10394	NC_016024	GAT	2	6	519944	519949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754156
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10411	NC_016024	CGG	2	6	520405	520410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754156
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10430	NC_016024	GCGATG	2	12	521606	521617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347754156
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10435	NC_016024	ACA	3	9	521799	521807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754156
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10439	NC_016024	TTG	2	6	522080	522085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754156
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10443	NC_016024	TCCAGT	2	12	522225	522236	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347754156
10444	NC_016024	CGGG	2	8	522252	522259	0 %	0 %	75 %	25 %	347754156
10445	NC_016024	GCC	2	6	522337	522342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754156
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10447	NC_016024	GTT	2	6	522607	522612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754157
10448	NC_016024	ATGTC	2	10	522666	522675	20 %	40 %	20 %	20 %	347754157
10449	NC_016024	CGG	2	6	522685	522690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754157
10450	NC_016024	GGCA	2	8	522733	522740	25 %	0 %	50 %	25 %	347754157
10451	NC_016024	CAC	2	6	522760	522765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754157
10452	NC_016024	GCT	2	6	522854	522859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754157
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10459	NC_016024	GAG	2	6	523117	523122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754157
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10463	NC_016024	GGT	2	6	523451	523456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754158
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10465	NC_016024	CTG	2	6	523516	523521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754158
10466	NC_016024	GGTGG	2	10	523529	523538	0 %	20 %	80 %	0 %	347754158
10467	NC_016024	TCT	2	6	523556	523561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754158
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10469	NC_016024	G	6	6	523593	523598	0 %	0 %	100 %	0 %	347754158
10470	NC_016024	GTT	2	6	523623	523628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754158
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10472	NC_016024	CTT	2	6	523666	523671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754158
10473	NC_016024	GC	3	6	523696	523701	0 %	0 %	50 %	50 %	347754158
10474	NC_016024	GGTT	2	8	523782	523789	0 %	50 %	50 %	0 %	347754158
10475	NC_016024	GGC	2	6	523840	523845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754158
10476	NC_016024	AACA	2	8	523905	523912	75 %	0 %	0 %	25 %	347754158
10477	NC_016024	AGGC	2	8	523913	523920	25 %	0 %	50 %	25 %	347754158
10478	NC_016024	TCAGG	2	10	524164	524173	20 %	20 %	40 %	20 %	347754159
10479	NC_016024	CGG	2	6	524195	524200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754159
10480	NC_016024	TCG	2	6	524335	524340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754159
10481	NC_016024	ACG	2	6	524344	524349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754159
10482	NC_016024	GCG	2	6	524356	524361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754159
10483	NC_016024	C	6	6	524380	524385	0 %	0 %	0 %	100 %	347754159
10484	NC_016024	GAT	2	6	524432	524437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754159
10485	NC_016024	CGGC	2	8	524513	524520	0 %	0 %	50 %	50 %	347754159
10486	NC_016024	ATG	2	6	524524	524529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754159
10487	NC_016024	GC	3	6	524553	524558	0 %	0 %	50 %	50 %	347754159
10488	NC_016024	GAT	2	6	524595	524600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754159
10489	NC_016024	CGT	2	6	524603	524608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754159
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10491	NC_016024	GAT	2	6	524724	524729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754159
10492	NC_016024	GGC	2	6	524737	524742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754159
10493	NC_016024	CG	3	6	524770	524775	0 %	0 %	50 %	50 %	347754159
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10497	NC_016024	CAG	2	6	524889	524894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754159
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10500	NC_016024	CGT	2	6	524970	524975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754159

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