MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 111516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015856	GCT	2	6	20	25	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
2	NC_015856	CAA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785198
3	NC_015856	GGAC	2	8	102	109	25 %	0 %	50 %	25 %	340785198
4	NC_015856	GTG	2	6	217	222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785198
5	NC_015856	TAA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785198
6	NC_015856	GC	3	6	308	313	0 %	0 %	50 %	50 %	340785198
7	NC_015856	GTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
8	NC_015856	CGG	3	9	327	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
9	NC_015856	ACAGC	2	10	386	395	40 %	0 %	20 %	40 %	340785198
10	NC_015856	GC	4	8	475	482	0 %	0 %	50 %	50 %	340785198
11	NC_015856	AAT	2	6	502	507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785198
12	NC_015856	GCT	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
13	NC_015856	CGA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
14	NC_015856	CTA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785198
15	NC_015856	TGC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
16	NC_015856	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
17	NC_015856	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785198
18	NC_015856	GGC	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
19	NC_015856	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785198
20	NC_015856	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785198
21	NC_015856	TGC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
22	NC_015856	ATC	3	9	817	825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785198
23	NC_015856	GAAA	2	8	843	850	75 %	0 %	25 %	0 %	340785198
24	NC_015856	GCC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785198
25	NC_015856	A	6	6	949	954	100 %	0 %	0 %	0 %	340785198
26	NC_015856	CGA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
27	NC_015856	T	6	6	994	999	0 %	100 %	0 %	0 %	340785198
28	NC_015856	CTG	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
29	NC_015856	AGA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785198
30	NC_015856	CGGC	2	8	1222	1229	0 %	0 %	50 %	50 %	340785198
31	NC_015856	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
32	NC_015856	CAC	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785198
33	NC_015856	AACC	2	8	1740	1747	50 %	0 %	0 %	50 %	340785199
34	NC_015856	CA	3	6	1801	1806	50 %	0 %	0 %	50 %	340785199
35	NC_015856	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
36	NC_015856	CGAC	2	8	1865	1872	25 %	0 %	25 %	50 %	340785199
37	NC_015856	CAC	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
38	NC_015856	CCA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
39	NC_015856	CGC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
40	NC_015856	GC	3	6	1942	1947	0 %	0 %	50 %	50 %	340785199
41	NC_015856	GCT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
42	NC_015856	GC	3	6	1965	1970	0 %	0 %	50 %	50 %	340785199
43	NC_015856	CAA	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
44	NC_015856	GCC	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
45	NC_015856	GAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
46	NC_015856	TAC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
47	NC_015856	CTG	3	9	2203	2211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
48	NC_015856	CG	3	6	2295	2300	0 %	0 %	50 %	50 %	340785199
49	NC_015856	TCA	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
50	NC_015856	CAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
51	NC_015856	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
52	NC_015856	GAA	2	6	2353	2358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
53	NC_015856	CGA	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785199
54	NC_015856	CAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
55	NC_015856	GTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785199
56	NC_015856	GCT	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
57	NC_015856	CGC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
58	NC_015856	CAT	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
59	NC_015856	CCA	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
60	NC_015856	GAA	2	6	2641	2646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
61	NC_015856	CGG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785199
62	NC_015856	ACCT	2	8	2695	2702	25 %	25 %	0 %	50 %	340785199
63	NC_015856	CAA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
64	NC_015856	TTC	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785199
65	NC_015856	GTA	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785199
66	NC_015856	TCA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
67	NC_015856	ACA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
68	NC_015856	CAC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
69	NC_015856	CGA	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
70	NC_015856	GGCC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	340785200
71	NC_015856	CTCGAT	2	12	3271	3282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340785200
72	NC_015856	CGA	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
73	NC_015856	AGCGC	2	10	3342	3351	20 %	0 %	40 %	40 %	340785200
74	NC_015856	CGG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
75	NC_015856	CGG	2	6	3418	3423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
76	NC_015856	GCT	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
77	NC_015856	CCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
78	NC_015856	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
79	NC_015856	CGAAAC	2	12	3541	3552	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340785200
80	NC_015856	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
81	NC_015856	TCCT	2	8	3698	3705	0 %	50 %	0 %	50 %	340785200
82	NC_015856	CAA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
83	NC_015856	GACC	2	8	3730	3737	25 %	0 %	25 %	50 %	340785200
84	NC_015856	AGA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
85	NC_015856	GGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
86	NC_015856	CAA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
87	NC_015856	CGA	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
88	NC_015856	ACG	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
89	NC_015856	CAA	2	6	3925	3930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
90	NC_015856	CGG	2	6	3946	3951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
91	NC_015856	CACC	2	8	3952	3959	25 %	0 %	0 %	75 %	340785200
92	NC_015856	GC	3	6	3970	3975	0 %	0 %	50 %	50 %	340785200
93	NC_015856	GAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
94	NC_015856	GCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
95	NC_015856	AGA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
96	NC_015856	TCG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
97	NC_015856	ACG	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
98	NC_015856	ATC	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
99	NC_015856	TCG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
100	NC_015856	GCC	2	6	4247	4252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
101	NC_015856	CGC	2	6	4264	4269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
102	NC_015856	GC	3	6	4277	4282	0 %	0 %	50 %	50 %	340785200
103	NC_015856	CGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
104	NC_015856	CGGCCT	2	12	4312	4323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340785200
105	NC_015856	TCG	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
106	NC_015856	GTC	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
107	NC_015856	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
108	NC_015856	CGA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
109	NC_015856	ACC	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
110	NC_015856	CAT	4	12	4591	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
111	NC_015856	CTG	3	9	4640	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
112	NC_015856	CCG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
113	NC_015856	GAC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
114	NC_015856	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
115	NC_015856	ATG	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785200
116	NC_015856	ACG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
117	NC_015856	GC	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	340785200
118	NC_015856	CGGCC	2	10	4843	4852	0 %	0 %	40 %	60 %	340785200
119	NC_015856	ACA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
120	NC_015856	CAT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
121	NC_015856	CG	4	8	4908	4915	0 %	0 %	50 %	50 %	340785200
122	NC_015856	GCC	2	6	4925	4930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
123	NC_015856	CAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
124	NC_015856	GTC	3	9	5036	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
125	NC_015856	CGA	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
126	NC_015856	TCG	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
127	NC_015856	CGC	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
128	NC_015856	CCG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
129	NC_015856	CAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
130	NC_015856	CCA	2	6	5260	5265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
131	NC_015856	CGA	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
132	NC_015856	AGCA	2	8	5306	5313	50 %	0 %	25 %	25 %	340785200
133	NC_015856	GTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785200
134	NC_015856	TGC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
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137	NC_015856	ATCG	2	8	5902	5909	25 %	25 %	25 %	25 %	340785201
138	NC_015856	TGT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785201
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141	NC_015856	GCA	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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143	NC_015856	TCA	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
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162	NC_015856	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
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165	NC_015856	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
166	NC_015856	ACA	3	9	6887	6895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785201
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239	NC_015856	TGAAG	2	10	10316	10325	40 %	20 %	40 %	0 %	340785202
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241	NC_015856	TCA	2	6	10542	10547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785203
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250	NC_015856	AAAT	2	8	10856	10863	75 %	25 %	0 %	0 %	340785203
251	NC_015856	CCA	2	6	10970	10975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785203
252	NC_015856	CAA	2	6	10995	11000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785203
253	NC_015856	TGG	2	6	11103	11108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785203
254	NC_015856	GGT	2	6	11194	11199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785203
255	NC_015856	A	6	6	11211	11216	100 %	0 %	0 %	0 %	340785203
256	NC_015856	G	7	7	11231	11237	0 %	0 %	100 %	0 %	340785203
257	NC_015856	TTC	2	6	11248	11253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785203
258	NC_015856	CAG	2	6	11294	11299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785203
259	NC_015856	ATTAC	2	10	11300	11309	40 %	40 %	0 %	20 %	340785203
260	NC_015856	CGA	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785203
261	NC_015856	AGT	2	6	11329	11334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785203
262	NC_015856	TCA	2	6	11363	11368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785203
263	NC_015856	TCA	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785203
264	NC_015856	AAC	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785203
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389	NC_015856	CGGCAT	2	12	21455	21466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340785209
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393	NC_015856	TGC	2	6	21556	21561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785209
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497	NC_015856	CGCC	2	8	27077	27084	0 %	0 %	25 %	75 %	340785215
498	NC_015856	GC	4	8	27124	27131	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
499	NC_015856	GCTG	2	8	27142	27149	0 %	25 %	50 %	25 %	340785215
500	NC_015856	AGC	2	6	27201	27206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785215

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