MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 26592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327782
2	NC_015727	GCC	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
3	NC_015727	GCC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
4	NC_015727	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
5	NC_015727	CGC	2	6	423	428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
6	NC_015727	GA	3	6	442	447	50 %	0 %	50 %	0 %	339327782
7	NC_015727	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327782
8	NC_015727	TG	3	6	594	599	0 %	50 %	50 %	0 %	339327782
9	NC_015727	CTTGA	2	10	713	722	20 %	40 %	20 %	20 %	339327782
10	NC_015727	CTTG	2	8	898	905	0 %	50 %	25 %	25 %	339327782
11	NC_015727	TCA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
12	NC_015727	TCA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
13	NC_015727	GTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327782
14	NC_015727	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327782
15	NC_015727	CGTG	2	8	1090	1097	0 %	25 %	50 %	25 %	339327782
16	NC_015727	TCGA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	25 %	25 %	339327782
17	NC_015727	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327782
18	NC_015727	CA	3	6	1207	1212	50 %	0 %	0 %	50 %	339327782
19	NC_015727	GGT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327782
20	NC_015727	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
21	NC_015727	GC	3	6	1302	1307	0 %	0 %	50 %	50 %	339327782
22	NC_015727	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
23	NC_015727	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327783
24	NC_015727	GCGTC	2	10	1475	1484	0 %	20 %	40 %	40 %	339327783
25	NC_015727	CGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327783
26	NC_015727	GC	3	6	1656	1661	0 %	0 %	50 %	50 %	339327783
27	NC_015727	CGT	3	9	1695	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
28	NC_015727	GAC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327783
29	NC_015727	CTGT	2	8	1786	1793	0 %	50 %	25 %	25 %	339327783
30	NC_015727	TGC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
31	NC_015727	GC	3	6	2088	2093	0 %	0 %	50 %	50 %	339327783
32	NC_015727	T	7	7	2134	2140	0 %	100 %	0 %	0 %	339327783
33	NC_015727	CAC	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327783
34	NC_015727	AAGT	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	339327783
35	NC_015727	CGCA	2	8	2460	2467	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
36	NC_015727	CGCA	2	8	2617	2624	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
37	NC_015727	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327784
38	NC_015727	GC	3	6	2931	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	339327784
39	NC_015727	C	6	6	3122	3127	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
40	NC_015727	C	6	6	3353	3358	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
41	NC_015727	C	6	6	3935	3940	0 %	0 %	0 %	100 %	339327784
42	NC_015727	GC	4	8	3982	3989	0 %	0 %	50 %	50 %	339327784
43	NC_015727	CCG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
44	NC_015727	GC	3	6	4637	4642	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
45	NC_015727	GCC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
46	NC_015727	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327785
47	NC_015727	CGGC	2	8	4825	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
48	NC_015727	CGG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
49	NC_015727	GGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
50	NC_015727	CCA	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327785
51	NC_015727	C	6	6	5012	5017	0 %	0 %	0 %	100 %	339327785
52	NC_015727	GC	3	6	5108	5113	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
53	NC_015727	CAG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327785
54	NC_015727	CG	3	6	5151	5156	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
55	NC_015727	CCAG	2	8	5325	5332	25 %	0 %	25 %	50 %	339327785
56	NC_015727	GCGG	2	8	5450	5457	0 %	0 %	75 %	25 %	339327785
57	NC_015727	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327785
58	NC_015727	GGCC	2	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
59	NC_015727	GCGCC	2	10	5545	5554	0 %	0 %	40 %	60 %	339327785
60	NC_015727	ACTG	2	8	5565	5572	25 %	25 %	25 %	25 %	339327785
61	NC_015727	GC	3	6	5582	5587	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
62	NC_015727	CGG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
63	NC_015727	GC	3	6	5624	5629	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
64	NC_015727	GCCC	2	8	5649	5656	0 %	0 %	25 %	75 %	339327785
65	NC_015727	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339327786
66	NC_015727	TCCG	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	339327786
67	NC_015727	CAGGCC	2	12	5896	5907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339327786
68	NC_015727	TCG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327786
69	NC_015727	GAAG	2	8	5922	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	339327786
70	NC_015727	ACC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327786
71	NC_015727	CGC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327786
72	NC_015727	GGCG	2	8	6428	6435	0 %	0 %	75 %	25 %	339327787
73	NC_015727	TGCGC	2	10	6445	6454	0 %	20 %	40 %	40 %	339327787
74	NC_015727	CG	3	6	6536	6541	0 %	0 %	50 %	50 %	339327787
75	NC_015727	AGC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327787
76	NC_015727	CG	3	6	6887	6892	0 %	0 %	50 %	50 %	339327788
77	NC_015727	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327788
78	NC_015727	CCT	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327788
79	NC_015727	GC	3	6	7017	7022	0 %	0 %	50 %	50 %	339327788
80	NC_015727	GTT	3	9	7126	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327789
81	NC_015727	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
82	NC_015727	TCA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327789
83	NC_015727	CAG	2	6	7249	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
84	NC_015727	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327789
85	NC_015727	GGCG	2	8	7309	7316	0 %	0 %	75 %	25 %	339327789
86	NC_015727	GCC	2	6	7375	7380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327790
87	NC_015727	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
88	NC_015727	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
89	NC_015727	CACTTG	2	12	7431	7442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339327790
90	NC_015727	GCC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
91	NC_015727	CGA	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
92	NC_015727	GGC	2	6	7771	7776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
93	NC_015727	GCG	2	6	7787	7792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
94	NC_015727	GGGCA	2	10	7808	7817	20 %	0 %	60 %	20 %	339327791
95	NC_015727	GT	3	6	7840	7845	0 %	50 %	50 %	0 %	339327791
96	NC_015727	GA	3	6	7858	7863	50 %	0 %	50 %	0 %	339327791
97	NC_015727	GATGCG	2	12	7871	7882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339327791
98	NC_015727	CGAG	2	8	7903	7910	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
99	NC_015727	GCC	2	6	7928	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
100	NC_015727	CGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
101	NC_015727	GC	4	8	8017	8024	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
102	NC_015727	GC	3	6	8061	8066	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
103	NC_015727	GC	3	6	8093	8098	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
104	NC_015727	CCA	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327791
105	NC_015727	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
106	NC_015727	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
107	NC_015727	GCAG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
108	NC_015727	GGCC	2	8	8203	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
109	NC_015727	CGC	3	9	8267	8275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
110	NC_015727	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327791
111	NC_015727	CCGG	2	8	8317	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
112	NC_015727	CGC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
113	NC_015727	ACG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
114	NC_015727	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
115	NC_015727	GTC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327791
116	NC_015727	ATG	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
117	NC_015727	GCG	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
118	NC_015727	GCA	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
119	NC_015727	GGC	2	6	8968	8973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
120	NC_015727	CAG	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
121	NC_015727	CAG	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
122	NC_015727	TGG	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
123	NC_015727	AGC	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
124	NC_015727	CG	3	6	9310	9315	0 %	0 %	50 %	50 %	339327792
125	NC_015727	GCGG	2	8	9381	9388	0 %	0 %	75 %	25 %	339327792
126	NC_015727	ATG	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
127	NC_015727	CGT	2	6	9453	9458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
128	NC_015727	TTG	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327792
129	NC_015727	AAG	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327792
130	NC_015727	GGT	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
131	NC_015727	ATC	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327792
132	NC_015727	CGG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
133	NC_015727	GCA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
134	NC_015727	CAGC	2	8	9687	9694	25 %	0 %	25 %	50 %	339327792
135	NC_015727	AGC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
136	NC_015727	AGC	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
137	NC_015727	CGT	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
138	NC_015727	TCG	2	6	9779	9784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
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262	NC_015727	CAC	2	6	15360	15365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327798
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264	NC_015727	ACG	2	6	15388	15393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327798
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389	NC_015727	TCC	2	6	23048	23053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327802
390	NC_015727	CAG	2	6	23065	23070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327802
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