MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 93544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015726	CAC	2	6	106566	106571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2502	NC_015726	TGG	2	6	106589	106594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324263
2503	NC_015726	GCTGGT	2	12	106596	106607	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339324263
2504	NC_015726	CCA	2	6	106620	106625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2505	NC_015726	CTG	2	6	106657	106662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2506	NC_015726	CTG	2	6	106666	106671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2507	NC_015726	GCT	2	6	106692	106697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2508	NC_015726	CTG	2	6	106723	106728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2509	NC_015726	CCG	2	6	106752	106757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324263
2510	NC_015726	TGC	2	6	106796	106801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2511	NC_015726	GCT	2	6	106803	106808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2512	NC_015726	CGGTGC	2	12	106823	106834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324263
2513	NC_015726	GC	3	6	106853	106858	0 %	0 %	50 %	50 %	339324263
2514	NC_015726	GCT	2	6	106902	106907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2515	NC_015726	CCA	2	6	106919	106924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2516	NC_015726	CTG	3	9	106927	106935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2517	NC_015726	CGA	2	6	106962	106967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2518	NC_015726	GGC	2	6	107090	107095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2519	NC_015726	CTG	2	6	107127	107132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2520	NC_015726	CAT	3	9	107234	107242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
2521	NC_015726	GC	3	6	107265	107270	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2522	NC_015726	ATT	2	6	107272	107277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339324264
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2524	NC_015726	TGG	2	6	107353	107358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324264
2525	NC_015726	CG	3	6	107368	107373	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2526	NC_015726	CAGC	2	8	107435	107442	25 %	0 %	25 %	50 %	339324264
2527	NC_015726	CGA	2	6	107447	107452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2528	NC_015726	GCTTCC	2	12	107479	107490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339324264
2529	NC_015726	GC	4	8	107504	107511	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2530	NC_015726	GAGC	2	8	107717	107724	25 %	0 %	50 %	25 %	339324264
2531	NC_015726	GGAAGT	2	12	107747	107758	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	339324264
2532	NC_015726	GCGG	2	8	107763	107770	0 %	0 %	75 %	25 %	339324264
2533	NC_015726	CAA	2	6	107813	107818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
2534	NC_015726	GCA	2	6	107846	107851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2535	NC_015726	CCG	2	6	107876	107881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2536	NC_015726	GC	3	6	107884	107889	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2537	NC_015726	TCG	2	6	107962	107967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2538	NC_015726	CAA	2	6	107999	108004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
2539	NC_015726	CCCG	2	8	108050	108057	0 %	0 %	25 %	75 %	339324264
2540	NC_015726	GGC	2	6	108086	108091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2541	NC_015726	ACC	2	6	108096	108101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324264
2542	NC_015726	CTT	2	6	108140	108145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324264
2543	NC_015726	CGA	2	6	108170	108175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2544	NC_015726	GGC	2	6	108183	108188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2545	NC_015726	CTA	3	9	108236	108244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
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2547	NC_015726	CATCGA	2	12	108320	108331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339324264
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2549	NC_015726	CG	3	6	108375	108380	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2550	NC_015726	AGC	2	6	108394	108399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2551	NC_015726	ACG	2	6	108409	108414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2552	NC_015726	ACA	2	6	108448	108453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
2553	NC_015726	CAA	2	6	108497	108502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
2554	NC_015726	TGA	2	6	108511	108516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324264
2555	NC_015726	GC	3	6	108629	108634	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2556	NC_015726	TGG	2	6	108637	108642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324264
2557	NC_015726	CG	4	8	108665	108672	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2558	NC_015726	CGG	2	6	108697	108702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2559	NC_015726	ACC	2	6	108754	108759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324264
2560	NC_015726	TCG	2	6	108844	108849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2561	NC_015726	CG	3	6	108887	108892	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2562	NC_015726	ACT	2	6	108904	108909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
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2569	NC_015726	CGC	2	6	109115	109120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2570	NC_015726	CGG	2	6	109138	109143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2571	NC_015726	TGC	2	6	109201	109206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
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2573	NC_015726	GCGCCC	2	12	109269	109280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
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2578	NC_015726	GCCGG	2	10	109480	109489	0 %	0 %	60 %	40 %	339324265
2579	NC_015726	CTG	2	6	109514	109519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
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2587	NC_015726	GCT	2	6	109918	109923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
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2590	NC_015726	GC	3	6	109968	109973	0 %	0 %	50 %	50 %	339324265
2591	NC_015726	TGC	2	6	109992	109997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2592	NC_015726	CAG	2	6	110006	110011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324265
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2600	NC_015726	GATC	2	8	110310	110317	25 %	25 %	25 %	25 %	339324265
2601	NC_015726	TCT	2	6	110325	110330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324265
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2603	NC_015726	TGCCGC	2	12	110388	110399	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324265
2604	NC_015726	TGA	2	6	110400	110405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324265
2605	NC_015726	GGC	2	6	110411	110416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324265
2606	NC_015726	TGA	2	6	110454	110459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324265
2607	NC_015726	GCC	2	6	110571	110576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324266
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2618	NC_015726	GCA	2	6	110989	110994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324266
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2620	NC_015726	GGC	2	6	111008	111013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324266
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2737	NC_015726	GCCC	2	8	115529	115536	0 %	0 %	25 %	75 %	339324271
2738	NC_015726	GCT	2	6	115564	115569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324271
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2740	NC_015726	CGA	2	6	115639	115644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324271
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2742	NC_015726	CGACAT	2	12	115681	115692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339324271
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2987	NC_015726	CAG	2	6	124274	124279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324281
2988	NC_015726	GC	4	8	124299	124306	0 %	0 %	50 %	50 %	339324281
2989	NC_015726	GCC	2	6	124328	124333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324281
2990	NC_015726	CCG	2	6	124342	124347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324281
2991	NC_015726	CG	3	6	124363	124368	0 %	0 %	50 %	50 %	339324281
2992	NC_015726	CCA	2	6	124378	124383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324281
2993	NC_015726	AGC	2	6	124395	124400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324281
2994	NC_015726	GCC	2	6	124401	124406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324281
2995	NC_015726	GC	3	6	124429	124434	0 %	0 %	50 %	50 %	339324281
2996	NC_015726	GCAGCG	2	12	124444	124455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339324281
2997	NC_015726	GC	3	6	124489	124494	0 %	0 %	50 %	50 %	339324281
2998	NC_015726	CGGGT	2	10	124554	124563	0 %	20 %	60 %	20 %	339324281
2999	NC_015726	GCA	2	6	124621	124626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324281
3000	NC_015726	GCC	2	6	124649	124654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324281

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