MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 93544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015726	TCCA	2	8	261202	261209	25 %	25 %	0 %	50 %	339324418
6502	NC_015726	TCA	2	6	261257	261262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324418
6503	NC_015726	CGC	2	6	261296	261301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324418
6504	NC_015726	GGCT	2	8	261340	261347	0 %	25 %	50 %	25 %	339324418
6505	NC_015726	GCG	2	6	261373	261378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324418
6506	NC_015726	TGA	2	6	261416	261421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324418
6507	NC_015726	CGG	2	6	261442	261447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324418
6508	NC_015726	CTT	2	6	261450	261455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324418
6509	NC_015726	GCA	2	6	261490	261495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324418
6510	NC_015726	GTG	4	12	261568	261579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324418
6511	NC_015726	ACG	2	6	261659	261664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324418
6512	NC_015726	TCA	3	9	261755	261763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324418
6513	NC_015726	CG	3	6	261860	261865	0 %	0 %	50 %	50 %	339324419
6514	NC_015726	TGG	2	6	261915	261920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324419
6515	NC_015726	CTG	2	6	261928	261933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324419
6516	NC_015726	GCA	2	6	261941	261946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324419
6517	NC_015726	GCTG	2	8	262013	262020	0 %	25 %	50 %	25 %	339324419
6518	NC_015726	CTA	2	6	262089	262094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324419
6519	NC_015726	GAA	2	6	262183	262188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324419
6520	NC_015726	ACT	2	6	262346	262351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324419
6521	NC_015726	GCC	2	6	262425	262430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324419
6522	NC_015726	CCA	2	6	262463	262468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324419
6523	NC_015726	CGG	2	6	262527	262532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324419
6524	NC_015726	C	6	6	262576	262581	0 %	0 %	0 %	100 %	339324420
6525	NC_015726	CT	3	6	262608	262613	0 %	50 %	0 %	50 %	339324420
6526	NC_015726	CCAAT	2	10	262617	262626	40 %	20 %	0 %	40 %	339324420
6527	NC_015726	ACA	2	6	262635	262640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324420
6528	NC_015726	TGC	2	6	262659	262664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324420
6529	NC_015726	TCC	2	6	262667	262672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324420
6530	NC_015726	TTGC	2	8	262679	262686	0 %	50 %	25 %	25 %	339324420
6531	NC_015726	CATG	2	8	262691	262698	25 %	25 %	25 %	25 %	339324420
6532	NC_015726	GAA	2	6	262714	262719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324420
6533	NC_015726	GCA	2	6	262755	262760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324420
6534	NC_015726	A	6	6	262799	262804	100 %	0 %	0 %	0 %	339324420
6535	NC_015726	A	6	6	262806	262811	100 %	0 %	0 %	0 %	339324420
6536	NC_015726	AAG	2	6	262829	262834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324420
6537	NC_015726	AGG	2	6	262848	262853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324420
6538	NC_015726	TAG	2	6	262910	262915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324420
6539	NC_015726	GAA	2	6	263161	263166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324421
6540	NC_015726	CCG	2	6	263187	263192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324421
6541	NC_015726	TCG	2	6	263196	263201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324421
6542	NC_015726	CTG	2	6	263220	263225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324421
6543	NC_015726	GGGCG	2	10	263251	263260	0 %	0 %	80 %	20 %	339324421
6544	NC_015726	GTC	2	6	263279	263284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324421
6545	NC_015726	GC	3	6	263337	263342	0 %	0 %	50 %	50 %	339324421
6546	NC_015726	GCC	2	6	263411	263416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324421
6547	NC_015726	CCA	2	6	263425	263430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324421
6548	NC_015726	GCC	2	6	263450	263455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324421
6549	NC_015726	CGC	2	6	263551	263556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324421
6550	NC_015726	GAA	2	6	263584	263589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324421
6551	NC_015726	CAT	2	6	264006	264011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324422
6552	NC_015726	GCT	2	6	264062	264067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324422
6553	NC_015726	ACG	2	6	264076	264081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324422
6554	NC_015726	GCA	2	6	264082	264087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324422
6555	NC_015726	GTC	2	6	264129	264134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324422
6556	NC_015726	TGC	2	6	264160	264165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324422
6557	NC_015726	TTG	2	6	264184	264189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324422
6558	NC_015726	TG	3	6	264241	264246	0 %	50 %	50 %	0 %	339324422
6559	NC_015726	AGT	2	6	264262	264267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324422
6560	NC_015726	CAG	2	6	264327	264332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6561	NC_015726	GCC	2	6	264359	264364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324423
6562	NC_015726	CAG	2	6	264408	264413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6563	NC_015726	CAGTTC	2	12	264450	264461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339324423
6564	NC_015726	AGC	2	6	264481	264486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6565	NC_015726	GTC	2	6	264507	264512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6566	NC_015726	CGGAT	2	10	264535	264544	20 %	20 %	40 %	20 %	339324423
6567	NC_015726	CGC	2	6	264548	264553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324423
6568	NC_015726	CCA	2	6	264566	264571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324423
6569	NC_015726	GCA	2	6	264581	264586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6570	NC_015726	CG	3	6	264620	264625	0 %	0 %	50 %	50 %	339324423
6571	NC_015726	CGG	2	6	264654	264659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324423
6572	NC_015726	GC	3	6	264794	264799	0 %	0 %	50 %	50 %	339324423
6573	NC_015726	GCA	2	6	264839	264844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6574	NC_015726	CGG	2	6	264847	264852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324423
6575	NC_015726	CAG	4	12	264861	264872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324423
6576	NC_015726	GTG	2	6	264874	264879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324423
6577	NC_015726	CA	3	6	266591	266596	50 %	0 %	0 %	50 %	339324424
6578	NC_015726	GCA	2	6	266642	266647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324424
6579	NC_015726	GGC	2	6	266673	266678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324424
6580	NC_015726	AGCC	2	8	266688	266695	25 %	0 %	25 %	50 %	339324424
6581	NC_015726	AC	3	6	266858	266863	50 %	0 %	0 %	50 %	339324424
6582	NC_015726	TCGTGG	2	12	266884	266895	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339324424
6583	NC_015726	GGCG	2	8	266914	266921	0 %	0 %	75 %	25 %	339324424
6584	NC_015726	TGCG	2	8	266929	266936	0 %	25 %	50 %	25 %	339324424
6585	NC_015726	CTT	2	6	266963	266968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324424
6586	NC_015726	GTT	2	6	266972	266977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324424
6587	NC_015726	GCG	2	6	267052	267057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324424
6588	NC_015726	TGG	2	6	267079	267084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324424
6589	NC_015726	AGCG	2	8	267088	267095	25 %	0 %	50 %	25 %	339324424
6590	NC_015726	TGG	2	6	267121	267126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324424
6591	NC_015726	AAAC	2	8	267169	267176	75 %	0 %	0 %	25 %	339324424
6592	NC_015726	GCC	2	6	267182	267187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324424
6593	NC_015726	CAGC	2	8	267248	267255	25 %	0 %	25 %	50 %	339324424
6594	NC_015726	CTT	3	9	267341	267349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324424
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6596	NC_015726	GCCA	2	8	267444	267451	25 %	0 %	25 %	50 %	339324424
6597	NC_015726	CTT	2	6	267512	267517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324424
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6601	NC_015726	AAG	2	6	267899	267904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324425
6602	NC_015726	GCG	2	6	267951	267956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324425
6603	NC_015726	ATC	2	6	267971	267976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324425
6604	NC_015726	CAA	2	6	267992	267997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324425
6605	NC_015726	CGC	2	6	268002	268007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324425
6606	NC_015726	GCC	2	6	268012	268017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324425
6607	NC_015726	CTGAA	2	10	268091	268100	40 %	20 %	20 %	20 %	339324426
6608	NC_015726	GGA	2	6	268127	268132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324426
6609	NC_015726	GAA	2	6	268134	268139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324426
6610	NC_015726	GGA	2	6	268168	268173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324426
6611	NC_015726	GCG	2	6	268179	268184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324426
6612	NC_015726	GGT	2	6	268257	268262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324426
6613	NC_015726	CGG	2	6	268577	268582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324426
6614	NC_015726	AGCC	2	8	268631	268638	25 %	0 %	25 %	50 %	339324426
6615	NC_015726	GGT	2	6	268648	268653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324426
6616	NC_015726	GTGC	2	8	268702	268709	0 %	25 %	50 %	25 %	339324426
6617	NC_015726	TGC	2	6	268809	268814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324426
6618	NC_015726	GC	3	6	268813	268818	0 %	0 %	50 %	50 %	339324426
6619	NC_015726	CCAG	2	8	268820	268827	25 %	0 %	25 %	50 %	339324426
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6621	NC_015726	CAGA	2	8	268928	268935	50 %	0 %	25 %	25 %	339324426
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6989	NC_015726	CG	3	6	285722	285727	0 %	0 %	50 %	50 %	339324442
6990	NC_015726	GGT	2	6	285750	285755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324442
6991	NC_015726	GCT	2	6	285759	285764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324442
6992	NC_015726	TGGC	2	8	285832	285839	0 %	25 %	50 %	25 %	339324442
6993	NC_015726	CG	3	6	285867	285872	0 %	0 %	50 %	50 %	339324442
6994	NC_015726	TGC	2	6	285884	285889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324442
6995	NC_015726	CGG	2	6	285897	285902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324442
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6997	NC_015726	GGC	2	6	285973	285978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324443
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6999	NC_015726	AGT	2	6	286020	286025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324443
7000	NC_015726	CG	3	6	286074	286079	0 %	0 %	50 %	50 %	339324443

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