MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 19690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	ATC	2	6	11	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319318
2	NC_015722	CA	3	6	20	25	50 %	0 %	0 %	50 %	339319318
3	NC_015722	TGTT	2	8	62	69	0 %	75 %	25 %	0 %	339319318
4	NC_015722	TTG	2	6	79	84	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319318
5	NC_015722	AGA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319318
6	NC_015722	ATT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
7	NC_015722	ATT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
8	NC_015722	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
9	NC_015722	TTTTTC	2	12	378	389	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339319318
10	NC_015722	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
11	NC_015722	TAAG	2	8	581	588	50 %	25 %	25 %	0 %	339319318
12	NC_015722	ATG	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319318
13	NC_015722	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	339319318
14	NC_015722	AGC	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319318
15	NC_015722	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
16	NC_015722	A	7	7	799	805	100 %	0 %	0 %	0 %	339319318
17	NC_015722	TTAGAT	2	12	838	849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339319318
18	NC_015722	GCT	2	6	898	903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319318
19	NC_015722	AT	3	6	923	928	50 %	50 %	0 %	0 %	339319318
20	NC_015722	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	339319318
21	NC_015722	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
22	NC_015722	AGC	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319318
23	NC_015722	ATT	2	6	1321	1326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
24	NC_015722	TAT	2	6	1327	1332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
25	NC_015722	A	6	6	1349	1354	100 %	0 %	0 %	0 %	339319318
26	NC_015722	AAG	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319318
27	NC_015722	ATA	2	6	1388	1393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
28	NC_015722	A	7	7	1395	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	339319318
29	NC_015722	AG	3	6	1468	1473	50 %	0 %	50 %	0 %	339319319
30	NC_015722	CAG	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319319
31	NC_015722	AGCATT	2	12	1577	1588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339319319
32	NC_015722	ATTT	2	8	1604	1611	25 %	75 %	0 %	0 %	339319319
33	NC_015722	ATT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319319
34	NC_015722	CTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319319
35	NC_015722	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	339319319
36	NC_015722	GAC	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319319
37	NC_015722	GCG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319320
38	NC_015722	CTT	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319320
39	NC_015722	TTA	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319320
40	NC_015722	CAG	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319320
41	NC_015722	TCC	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319320
42	NC_015722	TAA	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319320
43	NC_015722	TCG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319320
44	NC_015722	A	6	6	2167	2172	100 %	0 %	0 %	0 %	339319320
45	NC_015722	TCT	2	6	2195	2200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319320
46	NC_015722	CTA	2	6	2244	2249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319320
47	NC_015722	TC	3	6	2257	2262	0 %	50 %	0 %	50 %	339319320
48	NC_015722	GCG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319320
49	NC_015722	AAATT	2	10	2343	2352	60 %	40 %	0 %	0 %	339319320
50	NC_015722	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319321
51	NC_015722	CTTCTG	2	12	2528	2539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339319321
52	NC_015722	T	6	6	2631	2636	0 %	100 %	0 %	0 %	339319321
53	NC_015722	AAT	2	6	2642	2647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319321
54	NC_015722	ATTAGC	2	12	2655	2666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339319321
55	NC_015722	AG	3	6	2676	2681	50 %	0 %	50 %	0 %	339319321
56	NC_015722	GCT	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319321
57	NC_015722	GCGTTT	2	12	2749	2760	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339319321
58	NC_015722	ATA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319321
59	NC_015722	CTA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
60	NC_015722	TCAT	2	8	2871	2878	25 %	50 %	0 %	25 %	339319322
61	NC_015722	T	7	7	2894	2900	0 %	100 %	0 %	0 %	339319322
62	NC_015722	TAA	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319322
63	NC_015722	GA	3	6	2938	2943	50 %	0 %	50 %	0 %	339319322
64	NC_015722	ATT	2	6	2990	2995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
65	NC_015722	AGC	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319322
66	NC_015722	TAT	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
67	NC_015722	AATT	2	8	3065	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	339319322
68	NC_015722	ATC	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
69	NC_015722	GA	3	6	3163	3168	50 %	0 %	50 %	0 %	339319322
70	NC_015722	AG	3	6	3203	3208	50 %	0 %	50 %	0 %	339319322
71	NC_015722	T	6	6	3209	3214	0 %	100 %	0 %	0 %	339319322
72	NC_015722	ACAA	2	8	3215	3222	75 %	0 %	0 %	25 %	339319322
73	NC_015722	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319322
74	NC_015722	CTT	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319322
75	NC_015722	ATC	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
76	NC_015722	CTG	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319322
77	NC_015722	GCAC	2	8	3363	3370	25 %	0 %	25 %	50 %	339319322
78	NC_015722	TAA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319322
79	NC_015722	TGT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319322
80	NC_015722	CAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319322
81	NC_015722	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
82	NC_015722	A	7	7	3483	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	339319322
83	NC_015722	AT	3	6	3564	3569	50 %	50 %	0 %	0 %	339319323
84	NC_015722	ACC	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339319323
85	NC_015722	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319324
86	NC_015722	TTAA	2	8	4005	4012	50 %	50 %	0 %	0 %	339319324
87	NC_015722	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	339319324
88	NC_015722	AAG	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319324
89	NC_015722	A	6	6	4062	4067	100 %	0 %	0 %	0 %	339319324
90	NC_015722	TA	3	6	4158	4163	50 %	50 %	0 %	0 %	339319324
91	NC_015722	ATG	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319324
92	NC_015722	TGAT	2	8	4268	4275	25 %	50 %	25 %	0 %	339319325
93	NC_015722	ATT	2	6	4279	4284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319325
94	NC_015722	A	6	6	4323	4328	100 %	0 %	0 %	0 %	339319325
95	NC_015722	G	6	6	4402	4407	0 %	0 %	100 %	0 %	339319325
96	NC_015722	AGG	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319325
97	NC_015722	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319325
98	NC_015722	TTA	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319326
99	NC_015722	A	6	6	4558	4563	100 %	0 %	0 %	0 %	339319326
100	NC_015722	AGT	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319326
101	NC_015722	AAG	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
102	NC_015722	A	6	6	4638	4643	100 %	0 %	0 %	0 %	339319326
103	NC_015722	AGC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319326
104	NC_015722	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	339319326
105	NC_015722	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319326
106	NC_015722	TAA	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319326
107	NC_015722	GTT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319326
108	NC_015722	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319326
109	NC_015722	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319326
110	NC_015722	TTC	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319326
111	NC_015722	AAG	2	6	4987	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
112	NC_015722	GAA	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
113	NC_015722	GTT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319327
114	NC_015722	GGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319327
115	NC_015722	CTC	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319327
116	NC_015722	AAG	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319327
117	NC_015722	ATT	2	6	5275	5280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319327
118	NC_015722	TTA	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319327
119	NC_015722	TGA	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
120	NC_015722	CAA	2	6	5359	5364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319327
121	NC_015722	TTC	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319327
122	NC_015722	ATG	3	9	5411	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
123	NC_015722	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
124	NC_015722	TCT	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319328
125	NC_015722	CTT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319328
126	NC_015722	T	8	8	5537	5544	0 %	100 %	0 %	0 %	339319328
127	NC_015722	TAG	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319328
128	NC_015722	TTTGA	2	10	5624	5633	20 %	60 %	20 %	0 %	339319328
129	NC_015722	ATC	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
130	NC_015722	TAC	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
131	NC_015722	AT	3	6	5987	5992	50 %	50 %	0 %	0 %	339319329
132	NC_015722	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319329
133	NC_015722	TTAGGC	2	12	6016	6027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339319329
134	NC_015722	ACT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
135	NC_015722	T	6	6	6054	6059	0 %	100 %	0 %	0 %	339319329
136	NC_015722	T	7	7	6068	6074	0 %	100 %	0 %	0 %	339319329
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