MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 3849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015686	TGT	2	6	128069	128074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735149
2502	NC_015686	CAT	2	6	128091	128096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735149
2503	NC_015686	AT	3	6	128162	128167	50 %	50 %	0 %	0 %	337735149
2504	NC_015686	GAA	2	6	128207	128212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735149
2505	NC_015686	TTA	2	6	128228	128233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735149
2506	NC_015686	TGT	3	9	128239	128247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735149
2507	NC_015686	ATT	2	6	128248	128253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735149
2508	NC_015686	TGG	2	6	128269	128274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735149
2509	NC_015686	CCT	2	6	128300	128305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735149
2510	NC_015686	T	7	7	128317	128323	0 %	100 %	0 %	0 %	337735149
2511	NC_015686	TCA	2	6	128336	128341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735149
2512	NC_015686	GCT	2	6	128504	128509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735149
2513	NC_015686	TTG	2	6	128517	128522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735149
2514	NC_015686	CAT	2	6	128523	128528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735149
2515	NC_015686	TGC	2	6	128533	128538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735149
2516	NC_015686	AGA	2	6	128545	128550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735149
2517	NC_015686	CCA	2	6	128589	128594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735149
2518	NC_015686	TTTAA	2	10	128612	128621	40 %	60 %	0 %	0 %	337735149
2519	NC_015686	ATT	2	6	128649	128654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2520	NC_015686	TCC	2	6	128688	128693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735150
2521	NC_015686	ACAT	2	8	128706	128713	50 %	25 %	0 %	25 %	337735150
2522	NC_015686	CAG	2	6	128723	128728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735150
2523	NC_015686	ATC	2	6	128742	128747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2524	NC_015686	TAC	2	6	128765	128770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2525	NC_015686	AGA	2	6	128802	128807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735150
2526	NC_015686	TCT	2	6	128941	128946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735150
2527	NC_015686	TTGC	2	8	129025	129032	0 %	50 %	25 %	25 %	337735150
2528	NC_015686	ATT	2	6	129081	129086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2529	NC_015686	TAG	2	6	129140	129145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735150
2530	NC_015686	TAAA	2	8	129185	129192	75 %	25 %	0 %	0 %	337735150
2531	NC_015686	TAC	2	6	129197	129202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2532	NC_015686	AGA	2	6	129221	129226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735150
2533	NC_015686	CTG	2	6	129276	129281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735150
2534	NC_015686	CCT	2	6	129358	129363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735150
2535	NC_015686	ATT	2	6	129465	129470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2536	NC_015686	CCAA	2	8	129525	129532	50 %	0 %	0 %	50 %	337735150
2537	NC_015686	ATG	2	6	129744	129749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735150
2538	NC_015686	ATT	2	6	129750	129755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2539	NC_015686	ACC	2	6	129756	129761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735150
2540	NC_015686	AAGT	2	8	129769	129776	50 %	25 %	25 %	0 %	337735150
2541	NC_015686	GAT	2	6	129875	129880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735150
2542	NC_015686	AAT	2	6	129905	129910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735150
2543	NC_015686	AGT	2	6	129984	129989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735150
2544	NC_015686	ATT	2	6	130059	130064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2545	NC_015686	CCT	2	6	130066	130071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735150
2546	NC_015686	CCA	2	6	130081	130086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735150
2547	NC_015686	TCG	2	6	130108	130113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735150
2548	NC_015686	CTA	2	6	130115	130120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2549	NC_015686	CTG	2	6	130223	130228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735150
2550	NC_015686	GAA	2	6	130269	130274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735150
2551	NC_015686	ATC	2	6	130395	130400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2552	NC_015686	AGA	2	6	130401	130406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735150
2553	NC_015686	TAA	2	6	130550	130555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735150
2554	NC_015686	CAT	2	6	130619	130624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735150
2555	NC_015686	TAG	2	6	130638	130643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735150
2556	NC_015686	TG	4	8	130653	130660	0 %	50 %	50 %	0 %	337735150
2557	NC_015686	ATT	2	6	130762	130767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735150
2558	NC_015686	ATTA	2	8	131093	131100	50 %	50 %	0 %	0 %	337735151
2559	NC_015686	AAC	2	6	131148	131153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735151
2560	NC_015686	AAC	2	6	131162	131167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735151
2561	NC_015686	AC	3	6	131218	131223	50 %	0 %	0 %	50 %	337735151
2562	NC_015686	AGTA	2	8	131252	131259	50 %	25 %	25 %	0 %	337735151
2563	NC_015686	ATT	2	6	131289	131294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735151
2564	NC_015686	AACATA	2	12	131334	131345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	337735151
2565	NC_015686	CAA	2	6	131381	131386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735151
2566	NC_015686	T	8	8	131398	131405	0 %	100 %	0 %	0 %	337735151
2567	NC_015686	ACT	2	6	131438	131443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735151
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2569	NC_015686	CTT	2	6	131499	131504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735151
2570	NC_015686	TCT	2	6	131633	131638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735151
2571	NC_015686	ATTT	2	8	131670	131677	25 %	75 %	0 %	0 %	337735151
2572	NC_015686	CAA	2	6	131683	131688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735151
2573	NC_015686	TAA	2	6	131720	131725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735151
2574	NC_015686	TAT	2	6	131759	131764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735151
2575	NC_015686	AT	3	6	131763	131768	50 %	50 %	0 %	0 %	337735151
2576	NC_015686	ATA	2	6	131776	131781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735151
2577	NC_015686	AT	3	6	131811	131816	50 %	50 %	0 %	0 %	337735151
2578	NC_015686	CAA	2	6	131822	131827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735151
2579	NC_015686	AG	3	6	131873	131878	50 %	0 %	50 %	0 %	337735151
2580	NC_015686	GAA	2	6	131967	131972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735151
2581	NC_015686	CTA	2	6	131976	131981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735151
2582	NC_015686	ACT	2	6	131987	131992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735151
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2585	NC_015686	TTCAG	2	10	132109	132118	20 %	40 %	20 %	20 %	337735151
2586	NC_015686	T	6	6	132132	132137	0 %	100 %	0 %	0 %	337735151
2587	NC_015686	GCTA	2	8	132195	132202	25 %	25 %	25 %	25 %	337735151
2588	NC_015686	A	6	6	132237	132242	100 %	0 %	0 %	0 %	337735151
2589	NC_015686	GTC	2	6	132286	132291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735151
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2591	NC_015686	TAA	3	9	132368	132376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735151
2592	NC_015686	ATTT	2	8	132377	132384	25 %	75 %	0 %	0 %	337735151
2593	NC_015686	T	7	7	132382	132388	0 %	100 %	0 %	0 %	337735151
2594	NC_015686	GCA	2	6	132407	132412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735151
2595	NC_015686	GAA	2	6	132435	132440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735151
2596	NC_015686	GT	3	6	132493	132498	0 %	50 %	50 %	0 %	337735151
2597	NC_015686	CTACA	2	10	132594	132603	40 %	20 %	0 %	40 %	337735151
2598	NC_015686	AGA	2	6	132617	132622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735151
2599	NC_015686	AAT	2	6	132623	132628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735151
2600	NC_015686	AAT	2	6	132642	132647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735151
2601	NC_015686	T	6	6	132657	132662	0 %	100 %	0 %	0 %	337735151
2602	NC_015686	ATTT	2	8	132666	132673	25 %	75 %	0 %	0 %	337735151
2603	NC_015686	ATTAC	2	10	132776	132785	40 %	40 %	0 %	20 %	337735152
2604	NC_015686	ATC	2	6	132828	132833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735152
2605	NC_015686	TAT	2	6	132951	132956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735152
2606	NC_015686	AT	3	6	133040	133045	50 %	50 %	0 %	0 %	337735152
2607	NC_015686	TTG	2	6	133067	133072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735152
2608	NC_015686	CTT	2	6	133106	133111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735152
2609	NC_015686	TTTC	2	8	133112	133119	0 %	75 %	0 %	25 %	337735152
2610	NC_015686	ATT	2	6	133129	133134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735152
2611	NC_015686	GAA	2	6	133198	133203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735152
2612	NC_015686	ATC	2	6	133218	133223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735152
2613	NC_015686	T	7	7	133229	133235	0 %	100 %	0 %	0 %	337735152
2614	NC_015686	TGA	2	6	133317	133322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735152
2615	NC_015686	TCT	2	6	133348	133353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735152
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2617	NC_015686	GTTT	2	8	133410	133417	0 %	75 %	25 %	0 %	337735152
2618	NC_015686	GCA	3	9	133441	133449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735152
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2620	NC_015686	ATA	2	6	133747	133752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735153
2621	NC_015686	ATTT	2	8	133773	133780	25 %	75 %	0 %	0 %	337735153
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