MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015470	TGCT	2	8	188441	188448	0 %	50 %	25 %	25 %	332287133
3502	NC_015470	TGA	2	6	188454	188459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
3503	NC_015470	TGC	2	6	188606	188611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287133
3504	NC_015470	TATC	2	8	188622	188629	25 %	50 %	0 %	25 %	332287133
3505	NC_015470	GTT	2	6	188750	188755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287133
3506	NC_015470	GTT	2	6	188777	188782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287133
3507	NC_015470	ATCT	2	8	188799	188806	25 %	50 %	0 %	25 %	332287133
3508	NC_015470	AAGGAG	2	12	188852	188863	50 %	0 %	50 %	0 %	332287133
3509	NC_015470	AAG	2	6	189104	189109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
3510	NC_015470	GTT	2	6	189146	189151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287133
3511	NC_015470	TGC	2	6	189177	189182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287133
3512	NC_015470	TTG	2	6	189203	189208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287133
3513	NC_015470	GAG	2	6	189242	189247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287133
3514	NC_015470	GATT	2	8	189267	189274	25 %	50 %	25 %	0 %	332287133
3515	NC_015470	ATC	2	6	189311	189316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
3516	NC_015470	AAGG	2	8	189337	189344	50 %	0 %	50 %	0 %	332287133
3517	NC_015470	TGA	2	6	189360	189365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
3518	NC_015470	CG	3	6	189372	189377	0 %	0 %	50 %	50 %	332287133
3519	NC_015470	TTC	2	6	189462	189467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3520	NC_015470	GTA	2	6	189505	189510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
3521	NC_015470	AAG	2	6	189677	189682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
3522	NC_015470	TTC	2	6	189738	189743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3523	NC_015470	TAC	2	6	189756	189761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
3524	NC_015470	A	6	6	189855	189860	100 %	0 %	0 %	0 %	332287133
3525	NC_015470	GA	3	6	189954	189959	50 %	0 %	50 %	0 %	332287133
3526	NC_015470	CATG	2	8	189967	189974	25 %	25 %	25 %	25 %	332287133
3527	NC_015470	TACT	2	8	189981	189988	25 %	50 %	0 %	25 %	332287133
3528	NC_015470	TTC	2	6	190026	190031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3529	NC_015470	TGT	2	6	190053	190058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287133
3530	NC_015470	TAGT	2	8	190073	190080	25 %	50 %	25 %	0 %	332287133
3531	NC_015470	AGCG	2	8	190113	190120	25 %	0 %	50 %	25 %	332287133
3532	NC_015470	GAA	2	6	190210	190215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
3533	NC_015470	TC	3	6	190220	190225	0 %	50 %	0 %	50 %	332287133
3534	NC_015470	CAG	2	6	190240	190245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287133
3535	NC_015470	GCCTTG	2	12	190271	190282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287133
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3537	NC_015470	CGG	2	6	190320	190325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287133
3538	NC_015470	TCT	2	6	190356	190361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
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3540	NC_015470	AAG	2	6	190534	190539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
3541	NC_015470	CTT	2	6	190591	190596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3542	NC_015470	TTAT	2	8	190675	190682	25 %	75 %	0 %	0 %	332287133
3543	NC_015470	TTC	3	9	190690	190698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3544	NC_015470	ATG	2	6	190738	190743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
3545	NC_015470	GAT	2	6	190797	190802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
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3550	NC_015470	GATAA	2	10	191020	191029	60 %	20 %	20 %	0 %	332287133
3551	NC_015470	ATTT	2	8	191032	191039	25 %	75 %	0 %	0 %	332287133
3552	NC_015470	CTAT	2	8	191107	191114	25 %	50 %	0 %	25 %	332287133
3553	NC_015470	TGA	2	6	191117	191122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287133
3554	NC_015470	TCT	2	6	191152	191157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3555	NC_015470	TAA	2	6	191211	191216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287133
3556	NC_015470	ACA	2	6	191223	191228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287133
3557	NC_015470	TTA	2	6	191254	191259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287133
3558	NC_015470	TCT	2	6	191334	191339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3559	NC_015470	CTT	3	9	191370	191378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287133
3560	NC_015470	A	6	6	191381	191386	100 %	0 %	0 %	0 %	332287133
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3565	NC_015470	A	6	6	191534	191539	100 %	0 %	0 %	0 %	332287133
3566	NC_015470	GAA	2	6	191546	191551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287133
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3569	NC_015470	TGG	2	6	191604	191609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287133
3570	NC_015470	TCA	2	6	191633	191638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287133
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3588	NC_015470	T	6	6	192657	192662	0 %	100 %	0 %	0 %	332287134
3589	NC_015470	TTG	2	6	192767	192772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287134
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3593	NC_015470	A	6	6	192873	192878	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
3594	NC_015470	A	6	6	192883	192888	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
3595	NC_015470	AGC	2	6	192910	192915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287134
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3603	NC_015470	A	6	6	193201	193206	100 %	0 %	0 %	0 %	332287134
3604	NC_015470	CCCTT	2	10	193224	193233	0 %	40 %	0 %	60 %	332287134
3605	NC_015470	TGA	2	6	193252	193257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287134
3606	NC_015470	CT	3	6	193274	193279	0 %	50 %	0 %	50 %	332287134
3607	NC_015470	TTA	2	6	193364	193369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287134
3608	NC_015470	ATC	2	6	193377	193382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287134
3609	NC_015470	GAAA	2	8	193406	193413	75 %	0 %	25 %	0 %	332287134
3610	NC_015470	CAC	2	6	193497	193502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287134
3611	NC_015470	GGA	2	6	193523	193528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287134
3612	NC_015470	TCAT	2	8	193530	193537	25 %	50 %	0 %	25 %	332287134
3613	NC_015470	TTC	2	6	193560	193565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287134
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3617	NC_015470	TTATT	2	10	194235	194244	20 %	80 %	0 %	0 %	332287135
3618	NC_015470	CTG	2	6	194301	194306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287135
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3993	NC_015470	T	6	6	215004	215009	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
3994	NC_015470	T	7	7	215037	215043	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
3995	NC_015470	T	6	6	215098	215103	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
3996	NC_015470	TTC	2	6	215237	215242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287155
3997	NC_015470	AAGAA	2	10	215272	215281	80 %	0 %	20 %	0 %	332287155
3998	NC_015470	AAG	2	6	215288	215293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287155
3999	NC_015470	GAA	2	6	215906	215911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287156
4000	NC_015470	TCA	2	6	215931	215936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287156

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