MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015470	TCT	2	6	805344	805349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287626
15003	NC_015470	ACA	2	6	805431	805436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287626
15004	NC_015470	TTTG	2	8	805479	805486	0 %	75 %	25 %	0 %	332287626
15005	NC_015470	AAC	2	6	805511	805516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287626
15006	NC_015470	AGC	2	6	805538	805543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287626
15007	NC_015470	TTC	2	6	805661	805666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287626
15008	NC_015470	CTG	2	6	805714	805719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287626
15009	NC_015470	CAA	2	6	806092	806097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287627
15010	NC_015470	TCT	2	6	806226	806231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287627
15011	NC_015470	T	7	7	806231	806237	0 %	100 %	0 %	0 %	332287627
15012	NC_015470	TCT	2	6	806546	806551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287628
15013	NC_015470	CTC	2	6	806565	806570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287628
15014	NC_015470	TCT	2	6	806693	806698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287628
15015	NC_015470	CCCTC	2	10	806701	806710	0 %	20 %	0 %	80 %	332287628
15016	NC_015470	TC	3	6	806709	806714	0 %	50 %	0 %	50 %	332287628
15017	NC_015470	TGA	2	6	806715	806720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287628
15018	NC_015470	A	6	6	806781	806786	100 %	0 %	0 %	0 %	332287628
15019	NC_015470	AT	3	6	806815	806820	50 %	50 %	0 %	0 %	332287628
15020	NC_015470	CTTG	2	8	806834	806841	0 %	50 %	25 %	25 %	332287628
15021	NC_015470	TCA	2	6	806860	806865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287628
15022	NC_015470	GGTGTT	2	12	806909	806920	0 %	50 %	50 %	0 %	332287628
15023	NC_015470	TGA	2	6	806994	806999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287628
15024	NC_015470	CAG	2	6	807011	807016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287628
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15026	NC_015470	TTC	2	6	807070	807075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287628
15027	NC_015470	TGCA	2	8	807118	807125	25 %	25 %	25 %	25 %	332287628
15028	NC_015470	GAC	2	6	807176	807181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287628
15029	NC_015470	AATT	2	8	807252	807259	50 %	50 %	0 %	0 %	332287628
15030	NC_015470	CAA	2	6	807305	807310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287628
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15032	NC_015470	GTT	2	6	807512	807517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287628
15033	NC_015470	GAG	2	6	807518	807523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287628
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15036	NC_015470	TGT	2	6	807626	807631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287629
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15039	NC_015470	TCT	2	6	807790	807795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287629
15040	NC_015470	AGC	2	6	807801	807806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287629
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15042	NC_015470	T	6	6	807868	807873	0 %	100 %	0 %	0 %	332287629
15043	NC_015470	TTAA	2	8	808500	808507	50 %	50 %	0 %	0 %	332287630
15044	NC_015470	ACTGC	2	10	808527	808536	20 %	20 %	20 %	40 %	332287630
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15049	NC_015470	TAT	2	6	808687	808692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287630
15050	NC_015470	CGA	2	6	808748	808753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287630
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15052	NC_015470	AGC	2	6	808774	808779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287630
15053	NC_015470	CTG	2	6	808803	808808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287630
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15056	NC_015470	GGGTAG	2	12	808975	808986	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332287630
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15062	NC_015470	TTA	2	6	809459	809464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287631
15063	NC_015470	AGCA	2	8	809511	809518	50 %	0 %	25 %	25 %	332287631
15064	NC_015470	CTC	2	6	809544	809549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287631
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15100	NC_015470	TCCTC	2	10	810961	810970	0 %	40 %	0 %	60 %	332287631
15101	NC_015470	ATG	3	9	810974	810982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287631
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15106	NC_015470	TAC	2	6	811570	811575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287632
15107	NC_015470	CT	3	6	811621	811626	0 %	50 %	0 %	50 %	332287632
15108	NC_015470	T	6	6	811778	811783	0 %	100 %	0 %	0 %	332287633
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15111	NC_015470	ATAA	2	8	811852	811859	75 %	25 %	0 %	0 %	332287633
15112	NC_015470	AAG	2	6	811907	811912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287633
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15115	NC_015470	ACTAT	2	10	811996	812005	40 %	40 %	0 %	20 %	332287633
15116	NC_015470	CAA	2	6	812015	812020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287633
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15121	NC_015470	CTT	2	6	812272	812277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287633
15122	NC_015470	ACG	2	6	812373	812378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287633
15123	NC_015470	CAA	2	6	812385	812390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287633
15124	NC_015470	AGA	2	6	812392	812397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287633
15125	NC_015470	TACG	2	8	812436	812443	25 %	25 %	25 %	25 %	332287633
15126	NC_015470	AAACAT	2	12	812444	812455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332287633
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15132	NC_015470	AGT	2	6	812844	812849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287633
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15489	NC_015470	AAGA	2	8	831253	831260	75 %	0 %	25 %	0 %	332287651
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