MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015470	ACA	2	6	642113	642118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287504
12003	NC_015470	CAT	2	6	642177	642182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12004	NC_015470	TAA	2	6	642193	642198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287504
12005	NC_015470	AATC	2	8	642255	642262	50 %	25 %	0 %	25 %	332287504
12006	NC_015470	ATC	2	6	642364	642369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12007	NC_015470	CAT	2	6	642381	642386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12008	NC_015470	CCT	2	6	642465	642470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
12009	NC_015470	A	6	6	642529	642534	100 %	0 %	0 %	0 %	332287504
12010	NC_015470	TCA	2	6	642540	642545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12011	NC_015470	AATCA	2	10	642553	642562	60 %	20 %	0 %	20 %	332287504
12012	NC_015470	ACTG	2	8	642583	642590	25 %	25 %	25 %	25 %	332287504
12013	NC_015470	CCT	2	6	642662	642667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
12014	NC_015470	TCT	2	6	642698	642703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287504
12015	NC_015470	TC	4	8	642732	642739	0 %	50 %	0 %	50 %	332287504
12016	NC_015470	TTC	2	6	642751	642756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287504
12017	NC_015470	ATCA	2	8	642775	642782	50 %	25 %	0 %	25 %	332287504
12018	NC_015470	CTA	2	6	642789	642794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12019	NC_015470	CAT	2	6	642814	642819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12020	NC_015470	T	8	8	642847	642854	0 %	100 %	0 %	0 %	332287504
12021	NC_015470	TCTT	2	8	642926	642933	0 %	75 %	0 %	25 %	332287504
12022	NC_015470	TCT	2	6	642992	642997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287504
12023	NC_015470	CCT	2	6	643020	643025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
12024	NC_015470	CGT	2	6	643106	643111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287504
12025	NC_015470	TCC	2	6	643138	643143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
12026	NC_015470	CAT	2	6	643186	643191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12027	NC_015470	TCC	2	6	643210	643215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287504
12028	NC_015470	AGC	2	6	643223	643228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287504
12029	NC_015470	GCA	2	6	643253	643258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287504
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12031	NC_015470	TAA	3	9	643344	643352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287504
12032	NC_015470	T	6	6	643354	643359	0 %	100 %	0 %	0 %	332287504
12033	NC_015470	TTA	2	6	643373	643378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504
12034	NC_015470	TTG	2	6	643412	643417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287504
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12036	NC_015470	TCT	2	6	643436	643441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287504
12037	NC_015470	TTTC	2	8	643560	643567	0 %	75 %	0 %	25 %	332287504
12038	NC_015470	TC	3	6	643622	643627	0 %	50 %	0 %	50 %	332287504
12039	NC_015470	TCA	2	6	643700	643705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
12040	NC_015470	T	7	7	643779	643785	0 %	100 %	0 %	0 %	332287504
12041	NC_015470	CGG	2	6	643897	643902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287504
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12043	NC_015470	TTA	2	6	644090	644095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504
12044	NC_015470	T	7	7	644122	644128	0 %	100 %	0 %	0 %	332287504
12045	NC_015470	ATT	2	6	644131	644136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504
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12049	NC_015470	TTC	2	6	644258	644263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287504
12050	NC_015470	AC	3	6	644268	644273	50 %	0 %	0 %	50 %	332287504
12051	NC_015470	GAT	2	6	644274	644279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287504
12052	NC_015470	GACG	2	8	644332	644339	25 %	0 %	50 %	25 %	332287504
12053	NC_015470	TTG	2	6	644466	644471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287504
12054	NC_015470	TGTAT	2	10	644500	644509	20 %	60 %	20 %	0 %	332287504
12055	NC_015470	ATG	2	6	644536	644541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287504
12056	NC_015470	GA	3	6	644547	644552	50 %	0 %	50 %	0 %	332287504
12057	NC_015470	C	17	17	644558	644574	0 %	0 %	0 %	100 %	332287504
12058	NC_015470	T	9	9	644578	644586	0 %	100 %	0 %	0 %	332287504
12059	NC_015470	ATC	2	6	644612	644617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287504
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12061	NC_015470	TAT	2	6	644646	644651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287504
12062	NC_015470	AGA	2	6	644698	644703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287504
12063	NC_015470	TGA	2	6	644717	644722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287504
12064	NC_015470	GAA	2	6	644765	644770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287504
12065	NC_015470	CGA	2	6	644773	644778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287504
12066	NC_015470	GAT	2	6	645082	645087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287505
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12069	NC_015470	AC	3	6	645168	645173	50 %	0 %	0 %	50 %	332287505
12070	NC_015470	TCA	3	9	645200	645208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287505
12071	NC_015470	ACTTC	2	10	645265	645274	20 %	40 %	0 %	40 %	332287505
12072	NC_015470	GCTG	2	8	645285	645292	0 %	25 %	50 %	25 %	332287505
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12076	NC_015470	GCCATA	2	12	645596	645607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332287505
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12087	NC_015470	AAT	2	6	646631	646636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287506
12088	NC_015470	CT	3	6	646643	646648	0 %	50 %	0 %	50 %	332287506
12089	NC_015470	AGC	2	6	646656	646661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287506
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12092	NC_015470	CCCT	2	8	646923	646930	0 %	25 %	0 %	75 %	332287506
12093	NC_015470	GAA	2	6	646959	646964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287506
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12100	NC_015470	GTGG	2	8	647307	647314	0 %	25 %	75 %	0 %	332287506
12101	NC_015470	GCC	2	6	647325	647330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332287506
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12103	NC_015470	A	6	6	647413	647418	100 %	0 %	0 %	0 %	332287506
12104	NC_015470	TGA	2	6	647474	647479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287506
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12110	NC_015470	GCA	2	6	647627	647632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287506
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12235	NC_015470	CAACA	2	10	655303	655312	60 %	0 %	0 %	40 %	332287512
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