MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015470	TA	3	6	588520	588525	50 %	50 %	0 %	0 %	332287460
11002	NC_015470	GA	3	6	588646	588651	50 %	0 %	50 %	0 %	332287460
11003	NC_015470	T	7	7	588654	588660	0 %	100 %	0 %	0 %	332287460
11004	NC_015470	T	6	6	588688	588693	0 %	100 %	0 %	0 %	332287460
11005	NC_015470	TTA	2	6	588709	588714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287460
11006	NC_015470	ATA	2	6	588720	588725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287460
11007	NC_015470	ATG	2	6	588822	588827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287461
11008	NC_015470	TTCT	2	8	588837	588844	0 %	75 %	0 %	25 %	332287461
11009	NC_015470	CAG	2	6	588846	588851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287461
11010	NC_015470	TAT	2	6	588866	588871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287461
11011	NC_015470	CTT	2	6	588885	588890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287461
11012	NC_015470	GAA	2	6	588908	588913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287461
11013	NC_015470	ATA	2	6	588936	588941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287461
11014	NC_015470	GTA	2	6	589008	589013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287461
11015	NC_015470	AGC	2	6	589024	589029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287461
11016	NC_015470	GAAG	2	8	589092	589099	50 %	0 %	50 %	0 %	332287461
11017	NC_015470	AG	4	8	589115	589122	50 %	0 %	50 %	0 %	332287461
11018	NC_015470	TCCA	2	8	589133	589140	25 %	25 %	0 %	50 %	332287461
11019	NC_015470	TTA	2	6	589151	589156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287461
11020	NC_015470	TAA	2	6	589234	589239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287461
11021	NC_015470	TC	3	6	589258	589263	0 %	50 %	0 %	50 %	332287461
11022	NC_015470	AG	3	6	589276	589281	50 %	0 %	50 %	0 %	332287461
11023	NC_015470	TCT	2	6	589376	589381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287462
11024	NC_015470	ACA	2	6	589424	589429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287462
11025	NC_015470	GAG	2	6	589535	589540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287462
11026	NC_015470	AAG	2	6	589619	589624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287462
11027	NC_015470	A	6	6	589678	589683	100 %	0 %	0 %	0 %	332287462
11028	NC_015470	T	7	7	589722	589728	0 %	100 %	0 %	0 %	332287462
11029	NC_015470	ATG	2	6	589733	589738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287462
11030	NC_015470	TCC	2	6	589768	589773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287462
11031	NC_015470	GAT	2	6	589780	589785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287462
11032	NC_015470	ACT	2	6	589823	589828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287462
11033	NC_015470	AAACC	2	10	589865	589874	60 %	0 %	0 %	40 %	332287462
11034	NC_015470	GAT	2	6	589915	589920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287462
11035	NC_015470	CAG	2	6	589923	589928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287462
11036	NC_015470	TCA	2	6	589929	589934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287462
11037	NC_015470	CGA	2	6	590058	590063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287462
11038	NC_015470	ACC	2	6	590065	590070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287462
11039	NC_015470	TCC	2	6	590125	590130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287462
11040	NC_015470	TCT	2	6	590811	590816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287463
11041	NC_015470	AAAGA	2	10	590958	590967	80 %	0 %	20 %	0 %	332287463
11042	NC_015470	CAT	2	6	590980	590985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287463
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11044	NC_015470	GAAA	3	12	591169	591180	75 %	0 %	25 %	0 %	332287463
11045	NC_015470	TGT	2	6	591183	591188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287463
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11049	NC_015470	TGAT	2	8	591288	591295	25 %	50 %	25 %	0 %	332287463
11050	NC_015470	GTA	2	6	591474	591479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287463
11051	NC_015470	TA	3	6	591488	591493	50 %	50 %	0 %	0 %	332287463
11052	NC_015470	TAA	2	6	591515	591520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287463
11053	NC_015470	TCA	2	6	591561	591566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287463
11054	NC_015470	T	7	7	591678	591684	0 %	100 %	0 %	0 %	332287464
11055	NC_015470	TGT	2	6	591702	591707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287464
11056	NC_015470	CTTG	2	8	591732	591739	0 %	50 %	25 %	25 %	332287464
11057	NC_015470	TCT	2	6	591750	591755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287464
11058	NC_015470	CTT	2	6	591769	591774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287464
11059	NC_015470	TCA	2	6	591958	591963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287464
11060	NC_015470	TCA	2	6	591981	591986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287464
11061	NC_015470	GAT	2	6	591988	591993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287464
11062	NC_015470	TGC	2	6	592028	592033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287464
11063	NC_015470	TCT	2	6	592049	592054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287464
11064	NC_015470	TGCT	2	8	592155	592162	0 %	50 %	25 %	25 %	332287464
11065	NC_015470	AAAG	2	8	592260	592267	75 %	0 %	25 %	0 %	332287464
11066	NC_015470	A	7	7	592541	592547	100 %	0 %	0 %	0 %	332287465
11067	NC_015470	CCATGC	2	12	592563	592574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332287465
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11069	NC_015470	AAGA	2	8	592608	592615	75 %	0 %	25 %	0 %	332287465
11070	NC_015470	TGC	2	6	592682	592687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287465
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11073	NC_015470	GAAA	2	8	592798	592805	75 %	0 %	25 %	0 %	332287465
11074	NC_015470	A	6	6	592812	592817	100 %	0 %	0 %	0 %	332287465
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11085	NC_015470	ACTT	2	8	593572	593579	25 %	50 %	0 %	25 %	332287466
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11087	NC_015470	TA	4	8	593613	593620	50 %	50 %	0 %	0 %	332287466
11088	NC_015470	TA	3	6	593690	593695	50 %	50 %	0 %	0 %	332287466
11089	NC_015470	CTCA	2	8	593719	593726	25 %	25 %	0 %	50 %	332287466
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11091	NC_015470	ATT	2	6	593887	593892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287466
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11101	NC_015470	A	7	7	594589	594595	100 %	0 %	0 %	0 %	332287467
11102	NC_015470	ACT	2	6	594722	594727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287467
11103	NC_015470	ATG	2	6	594821	594826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287467
11104	NC_015470	ATTT	2	8	594833	594840	25 %	75 %	0 %	0 %	332287467
11105	NC_015470	CAG	2	6	594881	594886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287467
11106	NC_015470	GCA	2	6	595042	595047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287467
11107	NC_015470	GAG	2	6	595057	595062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287467
11108	NC_015470	ATCT	2	8	595136	595143	25 %	50 %	0 %	25 %	332287468
11109	NC_015470	A	9	9	595150	595158	100 %	0 %	0 %	0 %	332287468
11110	NC_015470	CAAA	2	8	595297	595304	75 %	0 %	0 %	25 %	332287468
11111	NC_015470	CTT	2	6	595305	595310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287468
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11491	NC_015470	TCG	2	6	614702	614707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287488
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