MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	A	6	6	51	56	100 %	0 %	0 %	0 %	331270708
2	NC_015427	AATAA	2	10	60	69	80 %	20 %	0 %	0 %	331270708
3	NC_015427	GAT	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270708
4	NC_015427	AATC	2	8	126	133	50 %	25 %	0 %	25 %	331270708
5	NC_015427	A	6	6	144	149	100 %	0 %	0 %	0 %	331270708
6	NC_015427	TAAA	2	8	244	251	75 %	25 %	0 %	0 %	331270708
7	NC_015427	AGGTGA	2	12	266	277	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	331270708
8	NC_015427	GAT	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270708
9	NC_015427	TGC	2	6	329	334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331270708
10	NC_015427	TGA	3	9	380	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270708
11	NC_015427	A	7	7	436	442	100 %	0 %	0 %	0 %	331270708
12	NC_015427	T	7	7	1324	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	331270709
13	NC_015427	CTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270709
14	NC_015427	ATT	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
15	NC_015427	TAT	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
16	NC_015427	TGT	2	6	1546	1551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270709
17	NC_015427	TTA	2	6	1594	1599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
18	NC_015427	AAT	3	9	1634	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270709
19	NC_015427	TGAT	2	8	1647	1654	25 %	50 %	25 %	0 %	331270709
20	NC_015427	TAT	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
21	NC_015427	T	7	7	1720	1726	0 %	100 %	0 %	0 %	331270709
22	NC_015427	TAT	2	6	1739	1744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
23	NC_015427	GTT	2	6	1772	1777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270709
24	NC_015427	CAC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331270709
25	NC_015427	TA	3	6	1887	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
26	NC_015427	TAT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
27	NC_015427	ATAA	2	8	1952	1959	75 %	25 %	0 %	0 %	331270709
28	NC_015427	TCA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270709
29	NC_015427	A	6	6	1977	1982	100 %	0 %	0 %	0 %	331270709
30	NC_015427	TAT	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
31	NC_015427	CATT	2	8	2041	2048	25 %	50 %	0 %	25 %	331270709
32	NC_015427	AT	3	6	2111	2116	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
33	NC_015427	ATTTT	2	10	2134	2143	20 %	80 %	0 %	0 %	331270709
34	NC_015427	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
35	NC_015427	TTA	2	6	2203	2208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
36	NC_015427	AT	3	6	2240	2245	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
37	NC_015427	TATCT	2	10	2250	2259	20 %	60 %	0 %	20 %	331270709
38	NC_015427	ATT	2	6	2295	2300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
39	NC_015427	ATT	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
40	NC_015427	ATT	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270709
41	NC_015427	TAA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270710
42	NC_015427	T	6	6	2588	2593	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
43	NC_015427	TTTA	2	8	2597	2604	25 %	75 %	0 %	0 %	331270710
44	NC_015427	ACCAA	2	10	2666	2675	60 %	0 %	0 %	40 %	331270710
45	NC_015427	T	6	6	2687	2692	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
46	NC_015427	ATA	2	6	2693	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270710
47	NC_015427	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
48	NC_015427	GCA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331270710
49	NC_015427	TAT	2	6	2761	2766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
50	NC_015427	TTTTA	2	10	2798	2807	20 %	80 %	0 %	0 %	331270710
51	NC_015427	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
52	NC_015427	T	6	6	2848	2853	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
53	NC_015427	TTCA	2	8	2858	2865	25 %	50 %	0 %	25 %	331270710
54	NC_015427	ATT	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
55	NC_015427	TTA	2	6	2943	2948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
56	NC_015427	ATATCT	2	12	2955	2966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270710
57	NC_015427	TTAT	2	8	2967	2974	25 %	75 %	0 %	0 %	331270710
58	NC_015427	CAT	2	6	3001	3006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270710
59	NC_015427	TAG	3	9	3022	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270710
60	NC_015427	T	6	6	3046	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
61	NC_015427	AGT	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270710
62	NC_015427	T	8	8	3074	3081	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
63	NC_015427	A	6	6	3088	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	331270710
64	NC_015427	AT	4	8	3124	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	331270710
65	NC_015427	TTA	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270710
66	NC_015427	TCTA	2	8	3149	3156	25 %	50 %	0 %	25 %	331270710
67	NC_015427	T	6	6	3218	3223	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
68	NC_015427	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
69	NC_015427	TAAT	2	8	3280	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	331270710
70	NC_015427	ATA	2	6	3303	3308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270710
71	NC_015427	AGAAT	2	10	3335	3344	60 %	20 %	20 %	0 %	331270710
72	NC_015427	ATTGA	2	10	3386	3395	40 %	40 %	20 %	0 %	331270710
73	NC_015427	T	6	6	3407	3412	0 %	100 %	0 %	0 %	331270710
74	NC_015427	TA	3	6	4005	4010	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
75	NC_015427	A	6	6	4086	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	331270711
76	NC_015427	TAAG	2	8	4123	4130	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
77	NC_015427	GAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270711
78	NC_015427	AAGAT	2	10	4192	4201	60 %	20 %	20 %	0 %	331270711
79	NC_015427	TTG	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270711
80	NC_015427	TTTTGA	2	12	4229	4240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331270711
81	NC_015427	GTT	2	6	4273	4278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270711
82	NC_015427	TA	5	10	4323	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
83	NC_015427	ATTC	2	8	4394	4401	25 %	50 %	0 %	25 %	331270711
84	NC_015427	AAAT	2	8	4414	4421	75 %	25 %	0 %	0 %	331270711
85	NC_015427	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
86	NC_015427	AAT	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270711
87	NC_015427	ATAG	2	8	4506	4513	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
88	NC_015427	TA	4	8	4571	4578	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
89	NC_015427	GGT	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331270711
90	NC_015427	TGA	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270711
91	NC_015427	AAAG	2	8	4782	4789	75 %	0 %	25 %	0 %	331270711
92	NC_015427	A	6	6	4798	4803	100 %	0 %	0 %	0 %	331270711
93	NC_015427	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270711
94	NC_015427	T	6	6	4855	4860	0 %	100 %	0 %	0 %	331270711
95	NC_015427	GTG	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331270711
96	NC_015427	TAA	2	6	4879	4884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270711
97	NC_015427	TAA	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270711
98	NC_015427	GATA	2	8	4899	4906	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
99	NC_015427	GTT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270711
100	NC_015427	AGT	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270712
101	NC_015427	TAA	2	6	5075	5080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
102	NC_015427	A	6	6	5092	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	331270712
103	NC_015427	AAT	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
104	NC_015427	TAA	2	6	5111	5116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
105	NC_015427	ACT	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270712
106	NC_015427	ATA	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
107	NC_015427	TTG	2	6	5229	5234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270712
108	NC_015427	ATT	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270712
109	NC_015427	TCAAT	2	10	5252	5261	40 %	40 %	0 %	20 %	331270712
110	NC_015427	ACA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270712
111	NC_015427	AAC	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270712
112	NC_015427	AAAG	2	8	5343	5350	75 %	0 %	25 %	0 %	331270712
113	NC_015427	AAT	2	6	5355	5360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
114	NC_015427	ATA	2	6	5365	5370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270712
115	NC_015427	TTA	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270712
116	NC_015427	T	6	6	5885	5890	0 %	100 %	0 %	0 %	331270713
117	NC_015427	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270713
118	NC_015427	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	331270713
119	NC_015427	ATAG	2	8	6019	6026	50 %	25 %	25 %	0 %	331270713
120	NC_015427	CTT	2	6	6033	6038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270713
121	NC_015427	TTC	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270713
122	NC_015427	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	331270713
123	NC_015427	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270713
124	NC_015427	T	7	7	6206	6212	0 %	100 %	0 %	0 %	331270714
125	NC_015427	TA	3	6	6228	6233	50 %	50 %	0 %	0 %	331270714
126	NC_015427	CTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270714
127	NC_015427	TCT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270714
128	NC_015427	GTT	2	6	6310	6315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270714
129	NC_015427	T	7	7	6314	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	331270714
130	NC_015427	ATT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270714
131	NC_015427	TATCT	2	10	7908	7917	20 %	60 %	0 %	20 %	331270715
132	NC_015427	AATTT	2	10	7953	7962	40 %	60 %	0 %	0 %	331270715
133	NC_015427	A	6	6	7967	7972	100 %	0 %	0 %	0 %	331270715
134	NC_015427	TAC	2	6	8005	8010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270715
135	NC_015427	ATG	3	9	8013	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270715
136	NC_015427	ATTT	2	8	8022	8029	25 %	75 %	0 %	0 %	331270715
137	NC_015427	AGT	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270715
138	NC_015427	TGA	2	6	8053	8058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270715
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