MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	TGAA	3	12	118	129	50 %	25 %	25 %	0 %	331268175
2	NC_015419	AT	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
3	NC_015419	ACA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
4	NC_015419	AT	3	6	260	265	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
5	NC_015419	AT	3	6	271	276	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
6	NC_015419	TAA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
7	NC_015419	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	331268175
8	NC_015419	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
9	NC_015419	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
10	NC_015419	CAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
11	NC_015419	A	6	6	427	432	100 %	0 %	0 %	0 %	331268175
12	NC_015419	ATAA	2	8	444	451	75 %	25 %	0 %	0 %	331268175
13	NC_015419	ATTC	2	8	1256	1263	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
14	NC_015419	TTG	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
15	NC_015419	TTG	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
16	NC_015419	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	331268176
17	NC_015419	ATAC	2	8	1376	1383	50 %	25 %	0 %	25 %	331268176
18	NC_015419	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
19	NC_015419	TCTAT	2	10	1420	1429	20 %	60 %	0 %	20 %	331268176
20	NC_015419	ATTGG	2	10	1450	1459	20 %	40 %	40 %	0 %	331268176
21	NC_015419	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
22	NC_015419	ATCT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
23	NC_015419	TTTA	2	8	1509	1516	25 %	75 %	0 %	0 %	331268176
24	NC_015419	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
25	NC_015419	TTTAG	2	10	1561	1570	20 %	60 %	20 %	0 %	331268176
26	NC_015419	AAT	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
27	NC_015419	ATCT	2	8	1628	1635	25 %	50 %	0 %	25 %	331268176
28	NC_015419	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
29	NC_015419	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
30	NC_015419	TTTTA	2	10	1716	1725	20 %	80 %	0 %	0 %	331268176
31	NC_015419	T	6	6	1749	1754	0 %	100 %	0 %	0 %	331268176
32	NC_015419	CT	3	6	1757	1762	0 %	50 %	0 %	50 %	331268176
33	NC_015419	TTCTT	2	10	1782	1791	0 %	80 %	0 %	20 %	331268176
34	NC_015419	AAT	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
35	NC_015419	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
36	NC_015419	AATTTA	2	12	2120	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	331268176
37	NC_015419	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
38	NC_015419	AATAA	2	10	2205	2214	80 %	20 %	0 %	0 %	331268176
39	NC_015419	TTA	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
40	NC_015419	CTA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
41	NC_015419	ATT	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
42	NC_015419	TAT	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
43	NC_015419	CTT	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
44	NC_015419	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268176
45	NC_015419	TTC	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
46	NC_015419	ATT	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
47	NC_015419	C	6	6	2506	2511	0 %	0 %	0 %	100 %	331268176
48	NC_015419	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268176
49	NC_015419	TTGC	2	8	2529	2536	0 %	50 %	25 %	25 %	331268176
50	NC_015419	ATG	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
51	NC_015419	CTT	2	6	2900	2905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
52	NC_015419	AT	3	6	2948	2953	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
53	NC_015419	AGT	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
54	NC_015419	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268177
55	NC_015419	TTTAAT	2	12	3034	3045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
56	NC_015419	CTTA	2	8	3081	3088	25 %	50 %	0 %	25 %	331268177
57	NC_015419	CCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331268177
58	NC_015419	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	331268177
59	NC_015419	TTC	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
60	NC_015419	AT	3	6	3225	3230	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
61	NC_015419	AAC	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268177
62	NC_015419	A	6	6	3250	3255	100 %	0 %	0 %	0 %	331268177
63	NC_015419	TTA	2	6	3257	3262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
64	NC_015419	TAAT	2	8	3272	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
65	NC_015419	T	6	6	3282	3287	0 %	100 %	0 %	0 %	331268177
66	NC_015419	AT	4	8	3298	3305	50 %	50 %	0 %	0 %	331268177
67	NC_015419	CTAG	2	8	3504	3511	25 %	25 %	25 %	25 %	331268178
68	NC_015419	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
69	NC_015419	TTTG	2	8	3546	3553	0 %	75 %	25 %	0 %	331268178
70	NC_015419	TAT	2	6	3589	3594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
71	NC_015419	TCA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
72	NC_015419	TGAT	2	8	3620	3627	25 %	50 %	25 %	0 %	331268178
73	NC_015419	ACTTCC	2	12	3635	3646	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	331268178
74	NC_015419	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
75	NC_015419	ATGA	2	8	3700	3707	50 %	25 %	25 %	0 %	331268178
76	NC_015419	TA	4	8	3712	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	331268178
77	NC_015419	CAA	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268178
78	NC_015419	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268178
79	NC_015419	CCAA	2	8	3779	3786	50 %	0 %	0 %	50 %	331268178
80	NC_015419	AGT	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268178
81	NC_015419	T	6	6	3907	3912	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
82	NC_015419	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268178
83	NC_015419	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
84	NC_015419	T	7	7	4102	4108	0 %	100 %	0 %	0 %	331268178
85	NC_015419	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
86	NC_015419	ATT	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
87	NC_015419	TA	3	6	4299	4304	50 %	50 %	0 %	0 %	331268179
88	NC_015419	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
89	NC_015419	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
90	NC_015419	T	6	6	4413	4418	0 %	100 %	0 %	0 %	331268179
91	NC_015419	TAA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
92	NC_015419	T	8	8	4446	4453	0 %	100 %	0 %	0 %	331268179
93	NC_015419	TTTCA	2	10	4462	4471	20 %	60 %	0 %	20 %	331268179
94	NC_015419	AAT	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
95	NC_015419	TCT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268179
96	NC_015419	TATAT	2	10	4552	4561	40 %	60 %	0 %	0 %	331268179
97	NC_015419	T	6	6	4561	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	331268179
98	NC_015419	T	6	6	4586	4591	0 %	100 %	0 %	0 %	331268179
99	NC_015419	T	6	6	4644	4649	0 %	100 %	0 %	0 %	331268179
100	NC_015419	ATT	2	6	4699	4704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
101	NC_015419	TA	4	8	6633	6640	50 %	50 %	0 %	0 %	331268180
102	NC_015419	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
103	NC_015419	TA	3	6	6746	6751	50 %	50 %	0 %	0 %	331268180
104	NC_015419	TTGCT	2	10	6785	6794	0 %	60 %	20 %	20 %	331268180
105	NC_015419	CTT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
106	NC_015419	ATC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
107	NC_015419	A	6	6	6945	6950	100 %	0 %	0 %	0 %	331268180
108	NC_015419	ATA	2	6	6979	6984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268180
109	NC_015419	ATC	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
110	NC_015419	TAT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
111	NC_015419	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
112	NC_015419	T	6	6	7334	7339	0 %	100 %	0 %	0 %	331268181
113	NC_015419	CTT	2	6	7365	7370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
114	NC_015419	CAA	2	6	7440	7445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268181
115	NC_015419	TATCTA	2	12	7488	7499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331268181
116	NC_015419	TAT	3	9	7500	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
117	NC_015419	ATC	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268181
118	NC_015419	ATT	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
119	NC_015419	T	6	6	7586	7591	0 %	100 %	0 %	0 %	331268181
120	NC_015419	TTC	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
121	NC_015419	T	8	8	7640	7647	0 %	100 %	0 %	0 %	331268181
122	NC_015419	ATCTT	2	10	7682	7691	20 %	60 %	0 %	20 %	331268181
123	NC_015419	T	6	6	7690	7695	0 %	100 %	0 %	0 %	331268181
124	NC_015419	CTTC	2	8	7740	7747	0 %	50 %	0 %	50 %	331268181
125	NC_015419	TTA	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268182
126	NC_015419	T	6	6	8036	8041	0 %	100 %	0 %	0 %	331268182
127	NC_015419	TAA	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
128	NC_015419	TAA	2	6	8065	8070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
129	NC_015419	TCT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
130	NC_015419	GTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268182
131	NC_015419	TTTC	2	8	8172	8179	0 %	75 %	0 %	25 %	331268182
132	NC_015419	CAT	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268182
133	NC_015419	TTAAT	2	10	8269	8278	40 %	60 %	0 %	0 %	331268182
134	NC_015419	CTT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
135	NC_015419	TACT	2	8	8338	8345	25 %	50 %	0 %	25 %	331268182
136	NC_015419	CAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268182
137	NC_015419	CT	3	6	8402	8407	0 %	50 %	0 %	50 %	331268182
138	NC_015419	AT	4	8	8438	8445	50 %	50 %	0 %	0 %	331268182
139	NC_015419	TGTC	2	8	8480	8487	0 %	50 %	25 %	25 %	331268182
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.