MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	AT	3	6	843	848	50 %	50 %	0 %	0 %	331270866
2	NC_015417	T	7	7	851	857	0 %	100 %	0 %	0 %	331270866
3	NC_015417	TATT	2	8	876	883	25 %	75 %	0 %	0 %	331270866
4	NC_015417	TAAAAA	2	12	889	900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331270866
5	NC_015417	CAAA	2	8	944	951	75 %	0 %	0 %	25 %	331270866
6	NC_015417	TAA	2	6	963	968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270866
7	NC_015417	AT	3	6	1036	1041	50 %	50 %	0 %	0 %	331270867
8	NC_015417	AAT	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270867
9	NC_015417	ATTAAT	2	12	1051	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	331270867
10	NC_015417	CTAT	2	8	1073	1080	25 %	50 %	0 %	25 %	331270867
11	NC_015417	CTAAAA	2	12	1083	1094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270867
12	NC_015417	A	6	6	1091	1096	100 %	0 %	0 %	0 %	331270867
13	NC_015417	A	6	6	1136	1141	100 %	0 %	0 %	0 %	331270867
14	NC_015417	AAAC	3	12	2268	2279	75 %	0 %	0 %	25 %	331270868
15	NC_015417	A	7	7	2307	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	331270868
16	NC_015417	AG	3	6	2315	2320	50 %	0 %	50 %	0 %	331270868
17	NC_015417	A	6	6	2365	2370	100 %	0 %	0 %	0 %	331270868
18	NC_015417	TTA	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270868
19	NC_015417	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	331270869
20	NC_015417	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270869
21	NC_015417	AAG	2	6	2974	2979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270869
22	NC_015417	GTA	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270869
23	NC_015417	AAT	2	6	3027	3032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270869
24	NC_015417	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270869
25	NC_015417	ATT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270870
26	NC_015417	A	8	8	3868	3875	100 %	0 %	0 %	0 %	331270870
27	NC_015417	CAT	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270870
28	NC_015417	TAT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270870
29	NC_015417	CTT	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270870
30	NC_015417	TAAA	2	8	3971	3978	75 %	25 %	0 %	0 %	331270870
31	NC_015417	A	7	7	3976	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	331270870
32	NC_015417	AGTT	2	8	3999	4006	25 %	50 %	25 %	0 %	331270870
33	NC_015417	GAC	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331270870
34	NC_015417	TA	3	6	4187	4192	50 %	50 %	0 %	0 %	331270870
35	NC_015417	AGAT	2	8	4194	4201	50 %	25 %	25 %	0 %	331270870
36	NC_015417	TAA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270870
37	NC_015417	AAC	2	6	4251	4256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270870
38	NC_015417	ATA	2	6	4271	4276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270870
39	NC_015417	AGA	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270870
40	NC_015417	AGTT	2	8	4298	4305	25 %	50 %	25 %	0 %	331270870
41	NC_015417	AG	3	6	4355	4360	50 %	0 %	50 %	0 %	331270870
42	NC_015417	GAT	2	6	4399	4404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270870
43	NC_015417	AAAG	2	8	4411	4418	75 %	0 %	25 %	0 %	331270870
44	NC_015417	TA	4	8	4483	4490	50 %	50 %	0 %	0 %	331270871
45	NC_015417	ACA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270871
46	NC_015417	TTA	2	6	4539	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270871
47	NC_015417	AAGAA	2	10	4558	4567	80 %	0 %	20 %	0 %	331270871
48	NC_015417	GAA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270871
49	NC_015417	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270871
50	NC_015417	AGAA	2	8	4709	4716	75 %	0 %	25 %	0 %	331270871
51	NC_015417	CAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270871
52	NC_015417	AGGT	2	8	4785	4792	25 %	25 %	50 %	0 %	331270871
53	NC_015417	TA	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	331270871
54	NC_015417	AGAACA	2	12	4888	4899	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270871
55	NC_015417	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270871
56	NC_015417	AAG	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270871
57	NC_015417	A	6	6	5021	5026	100 %	0 %	0 %	0 %	331270871
58	NC_015417	ATGAA	2	10	5064	5073	60 %	20 %	20 %	0 %	331270871
59	NC_015417	AAAG	2	8	5080	5087	75 %	0 %	25 %	0 %	331270871
60	NC_015417	GTG	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331270871
61	NC_015417	TAA	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270871
62	NC_015417	AAG	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270871
63	NC_015417	GTT	2	6	5237	5242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270871
64	NC_015417	TTG	2	6	5367	5372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270871
65	NC_015417	TGT	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270871
66	NC_015417	AAGA	2	8	5426	5433	75 %	0 %	25 %	0 %	331270871
67	NC_015417	ATTT	2	8	6596	6603	25 %	75 %	0 %	0 %	331270872
68	NC_015417	TAA	2	6	6686	6691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
69	NC_015417	A	7	7	6698	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	331270872
70	NC_015417	T	6	6	6789	6794	0 %	100 %	0 %	0 %	331270872
71	NC_015417	ATT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270872
72	NC_015417	AACT	2	8	6854	6861	50 %	25 %	0 %	25 %	331270872
73	NC_015417	ATA	3	9	6868	6876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
74	NC_015417	AAT	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
75	NC_015417	TAG	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270872
76	NC_015417	AAT	2	6	7050	7055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
77	NC_015417	ATAG	2	8	7095	7102	50 %	25 %	25 %	0 %	331270872
78	NC_015417	AAT	2	6	7107	7112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
79	NC_015417	TAAA	2	8	7273	7280	75 %	25 %	0 %	0 %	331270872
80	NC_015417	AAT	2	6	7310	7315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270872
81	NC_015417	AGA	2	6	7322	7327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270872
82	NC_015417	ATC	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270872
83	NC_015417	AAG	2	6	7507	7512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270872
84	NC_015417	TCA	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270872
85	NC_015417	AGAATT	2	12	7613	7624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270872
86	NC_015417	TAG	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270873
87	NC_015417	AGA	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270873
88	NC_015417	A	6	6	7860	7865	100 %	0 %	0 %	0 %	331270874
89	NC_015417	AGA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270874
90	NC_015417	TATGTA	2	12	7949	7960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270874
91	NC_015417	TA	3	6	7992	7997	50 %	50 %	0 %	0 %	331270874
92	NC_015417	AAG	2	6	8011	8016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270874
93	NC_015417	TAA	2	6	8155	8160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270874
94	NC_015417	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	331270874
95	NC_015417	GAA	2	6	8198	8203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270874
96	NC_015417	A	6	6	8208	8213	100 %	0 %	0 %	0 %	331270874
97	NC_015417	AGA	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270874
98	NC_015417	GAA	2	6	8267	8272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270874
99	NC_015417	TAC	2	6	9108	9113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270875
100	NC_015417	TGT	2	6	9114	9119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270875
101	NC_015417	ATA	3	9	9122	9130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
102	NC_015417	GAAG	2	8	9237	9244	50 %	0 %	50 %	0 %	331270875
103	NC_015417	TGT	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270875
104	NC_015417	TAG	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270875
105	NC_015417	TG	3	6	9375	9380	0 %	50 %	50 %	0 %	331270875
106	NC_015417	A	6	6	9407	9412	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
107	NC_015417	TAC	2	6	9432	9437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270875
108	NC_015417	TGG	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331270875
109	NC_015417	TAA	2	6	9561	9566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
110	NC_015417	TAA	2	6	9603	9608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
111	NC_015417	AAAG	2	8	9609	9616	75 %	0 %	25 %	0 %	331270875
112	NC_015417	TA	3	6	9622	9627	50 %	50 %	0 %	0 %	331270875
113	NC_015417	TGAAAG	2	12	9672	9683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270875
114	NC_015417	ATA	2	6	9745	9750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
115	NC_015417	ATA	2	6	9752	9757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
116	NC_015417	AT	3	6	9777	9782	50 %	50 %	0 %	0 %	331270875
117	NC_015417	AGA	2	6	9826	9831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270875
118	NC_015417	TACA	2	8	9882	9889	50 %	25 %	0 %	25 %	331270875
119	NC_015417	A	6	6	9978	9983	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
120	NC_015417	TAA	2	6	9986	9991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
121	NC_015417	A	6	6	9990	9995	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
122	NC_015417	TATT	2	8	10056	10063	25 %	75 %	0 %	0 %	331270875
123	NC_015417	A	6	6	10078	10083	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
124	NC_015417	TTA	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270875
125	NC_015417	AGA	2	6	10161	10166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270875
126	NC_015417	TGAAA	2	10	10176	10185	60 %	20 %	20 %	0 %	331270875
127	NC_015417	AAT	2	6	10228	10233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
128	NC_015417	ATA	2	6	10319	10324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270875
129	NC_015417	CAG	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331270875
130	NC_015417	GAAAA	2	10	10423	10432	80 %	0 %	20 %	0 %	331270875
131	NC_015417	A	6	6	10429	10434	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
132	NC_015417	A	6	6	10516	10521	100 %	0 %	0 %	0 %	331270875
133	NC_015417	ATT	2	6	10611	10616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270875
134	NC_015417	GAA	2	6	10660	10665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270875
135	NC_015417	AAGAAA	2	12	10669	10680	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331270875
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137	NC_015417	GAA	2	6	10750	10755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270875
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265	NC_015417	A	6	6	18991	18996	100 %	0 %	0 %	0 %	331270885
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