MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 32541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_015380	ATA	2	6	1283051	1283056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330814421
32502	NC_015380	GTA	2	6	1283068	1283073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330814421
32503	NC_015380	CCT	2	6	1283074	1283079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330814421
32504	NC_015380	GCT	2	6	1283140	1283145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814421
32505	NC_015380	TGC	2	6	1283190	1283195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814421
32506	NC_015380	CTT	2	6	1283209	1283214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814421
32507	NC_015380	ATA	2	6	1283245	1283250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330814421
32508	NC_015380	TGC	2	6	1283268	1283273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814421
32509	NC_015380	T	6	6	1283286	1283291	0 %	100 %	0 %	0 %	330814421
32510	NC_015380	TCT	2	6	1283311	1283316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814421
32511	NC_015380	TTC	2	6	1283381	1283386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814421
32512	NC_015380	TCT	2	6	1283404	1283409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814421
32513	NC_015380	T	6	6	1283428	1283433	0 %	100 %	0 %	0 %	330814421
32514	NC_015380	TACA	2	8	1283493	1283500	50 %	25 %	0 %	25 %	330814421
32515	NC_015380	ATT	2	6	1283554	1283559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330814421
32516	NC_015380	TTA	2	6	1283560	1283565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330814421
32517	NC_015380	TTA	2	6	1283584	1283589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330814422
32518	NC_015380	TTCTTT	2	12	1283622	1283633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330814422
32519	NC_015380	ATT	2	6	1283636	1283641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330814422
32520	NC_015380	CTG	2	6	1283697	1283702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814422
32521	NC_015380	TTC	2	6	1283728	1283733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814422
32522	NC_015380	CTGTT	2	10	1283869	1283878	0 %	60 %	20 %	20 %	330814422
32523	NC_015380	AACT	2	8	1283953	1283960	50 %	25 %	0 %	25 %	330814422
32524	NC_015380	GCT	2	6	1284002	1284007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814422
32525	NC_015380	ATC	3	9	1284010	1284018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330814422
32526	NC_015380	T	6	6	1284055	1284060	0 %	100 %	0 %	0 %	330814422
32527	NC_015380	TCA	2	6	1284083	1284088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330814422
32528	NC_015380	AATT	2	8	1284109	1284116	50 %	50 %	0 %	0 %	330814422
32529	NC_015380	AGA	2	6	1284160	1284165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330814422
32530	NC_015380	T	6	6	1284263	1284268	0 %	100 %	0 %	0 %	330814422
32531	NC_015380	ATA	2	6	1284315	1284320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330814422
32532	NC_015380	T	7	7	1284339	1284345	0 %	100 %	0 %	0 %	330814422
32533	NC_015380	CTT	2	6	1284405	1284410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330814422
32534	NC_015380	AGC	2	6	1284415	1284420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330814422
32535	NC_015380	CT	4	8	1284429	1284436	0 %	50 %	0 %	50 %	330814422
32536	NC_015380	CTTGC	2	10	1284462	1284471	0 %	40 %	20 %	40 %	330814422
32537	NC_015380	CTG	2	6	1284474	1284479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330814422
32538	NC_015380	ACT	2	6	1284542	1284547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330814422
32539	NC_015380	TA	3	6	1284570	1284575	50 %	50 %	0 %	0 %	330814422
32540	NC_015380	AACC	2	8	1284615	1284622	50 %	0 %	0 %	50 %	330814422
32541	NC_015380	TAG	2	6	1284639	1284644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330814422

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.