MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 32541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015380	TGA	2	6	209868	209873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813211
5502	NC_015380	TTC	2	6	209880	209885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813211
5503	NC_015380	AAAC	2	8	209917	209924	75 %	0 %	0 %	25 %	330813211
5504	NC_015380	GTC	2	6	209958	209963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813211
5505	NC_015380	TTA	2	6	209989	209994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813211
5506	NC_015380	CATC	2	8	210008	210015	25 %	25 %	0 %	50 %	330813211
5507	NC_015380	ATC	2	6	210021	210026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813211
5508	NC_015380	TAAT	2	8	210085	210092	50 %	50 %	0 %	0 %	330813211
5509	NC_015380	T	6	6	210092	210097	0 %	100 %	0 %	0 %	330813211
5510	NC_015380	TCT	2	6	210148	210153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813211
5511	NC_015380	T	6	6	210264	210269	0 %	100 %	0 %	0 %	330813211
5512	NC_015380	GCT	3	9	210292	210300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813211
5513	NC_015380	ATT	2	6	210391	210396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813211
5514	NC_015380	AGC	2	6	210532	210537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813212
5515	NC_015380	TTA	2	6	210564	210569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813212
5516	NC_015380	TAC	2	6	210580	210585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813212
5517	NC_015380	TTG	2	6	210625	210630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813212
5518	NC_015380	GGA	2	6	210635	210640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330813212
5519	NC_015380	AAT	2	6	210649	210654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813212
5520	NC_015380	GCA	2	6	210719	210724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813212
5521	NC_015380	TC	3	6	210752	210757	0 %	50 %	0 %	50 %	330813212
5522	NC_015380	TC	3	6	210759	210764	0 %	50 %	0 %	50 %	330813212
5523	NC_015380	TGTT	2	8	210826	210833	0 %	75 %	25 %	0 %	330813212
5524	NC_015380	TAA	2	6	210903	210908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813212
5525	NC_015380	TTGTT	2	10	210921	210930	0 %	80 %	20 %	0 %	330813212
5526	NC_015380	TAA	2	6	210939	210944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813212
5527	NC_015380	TGC	2	6	210946	210951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813212
5528	NC_015380	AAT	2	6	211015	211020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813212
5529	NC_015380	GCA	2	6	211091	211096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813212
5530	NC_015380	CAG	2	6	211152	211157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813212
5531	NC_015380	T	7	7	211183	211189	0 %	100 %	0 %	0 %	330813212
5532	NC_015380	ACT	2	6	211265	211270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813212
5533	NC_015380	T	7	7	211326	211332	0 %	100 %	0 %	0 %	330813212
5534	NC_015380	ATT	2	6	211333	211338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813212
5535	NC_015380	T	6	6	211337	211342	0 %	100 %	0 %	0 %	330813212
5536	NC_015380	TTC	2	6	211348	211353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813212
5537	NC_015380	A	10	10	211439	211448	100 %	0 %	0 %	0 %	330813213
5538	NC_015380	T	9	9	211516	211524	0 %	100 %	0 %	0 %	330813213
5539	NC_015380	ATT	2	6	211536	211541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813213
5540	NC_015380	TTTA	2	8	211581	211588	25 %	75 %	0 %	0 %	330813213
5541	NC_015380	T	7	7	211594	211600	0 %	100 %	0 %	0 %	330813213
5542	NC_015380	TGC	2	6	211614	211619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813213
5543	NC_015380	TC	3	6	211696	211701	0 %	50 %	0 %	50 %	330813213
5544	NC_015380	ACG	2	6	211714	211719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813213
5545	NC_015380	ATG	2	6	211727	211732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5546	NC_015380	TGA	2	6	211743	211748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5547	NC_015380	TGA	2	6	211869	211874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5548	NC_015380	T	6	6	211884	211889	0 %	100 %	0 %	0 %	330813213
5549	NC_015380	T	6	6	211963	211968	0 %	100 %	0 %	0 %	330813213
5550	NC_015380	TAGG	2	8	211991	211998	25 %	25 %	50 %	0 %	330813213
5551	NC_015380	AGT	2	6	212136	212141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5552	NC_015380	TTC	2	6	212175	212180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813213
5553	NC_015380	CAG	2	6	212231	212236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813213
5554	NC_015380	ATG	2	6	212306	212311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5555	NC_015380	TCA	2	6	212337	212342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813213
5556	NC_015380	ATG	2	6	212363	212368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5557	NC_015380	TTG	2	6	212384	212389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813213
5558	NC_015380	GCTGGG	2	12	212497	212508	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330813213
5559	NC_015380	AGTT	2	8	212583	212590	25 %	50 %	25 %	0 %	330813213
5560	NC_015380	AGAA	2	8	212671	212678	75 %	0 %	25 %	0 %	330813213
5561	NC_015380	ATA	2	6	212696	212701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5562	NC_015380	AAGT	2	8	212742	212749	50 %	25 %	25 %	0 %	330813213
5563	NC_015380	AAT	2	6	212767	212772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5564	NC_015380	TAAA	2	8	212798	212805	75 %	25 %	0 %	0 %	330813213
5565	NC_015380	AGA	2	6	212813	212818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813213
5566	NC_015380	GTC	2	6	212829	212834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813213
5567	NC_015380	ATA	2	6	212945	212950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5568	NC_015380	T	6	6	212953	212958	0 %	100 %	0 %	0 %	330813213
5569	NC_015380	TAC	2	6	213051	213056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813213
5570	NC_015380	CAA	2	6	213066	213071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813213
5571	NC_015380	TA	3	6	213076	213081	50 %	50 %	0 %	0 %	330813213
5572	NC_015380	ATA	2	6	213116	213121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5573	NC_015380	ACTT	2	8	213231	213238	25 %	50 %	0 %	25 %	330813213
5574	NC_015380	AAG	2	6	213302	213307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813213
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5576	NC_015380	GGT	2	6	213352	213357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330813213
5577	NC_015380	GGA	2	6	213418	213423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330813213
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5580	NC_015380	TTAC	2	8	213455	213462	25 %	50 %	0 %	25 %	330813213
5581	NC_015380	TAAA	2	8	213491	213498	75 %	25 %	0 %	0 %	330813213
5582	NC_015380	TAA	2	6	213519	213524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5583	NC_015380	GAT	2	6	213597	213602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
5584	NC_015380	ATG	2	6	213611	213616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813213
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5588	NC_015380	AAT	2	6	213775	213780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813213
5589	NC_015380	TTAAA	2	10	213788	213797	60 %	40 %	0 %	0 %	330813213
5590	NC_015380	ATTT	2	8	213809	213816	25 %	75 %	0 %	0 %	330813213
5591	NC_015380	TAAAA	2	10	213872	213881	80 %	20 %	0 %	0 %	330813214
5592	NC_015380	T	7	7	213885	213891	0 %	100 %	0 %	0 %	330813214
5593	NC_015380	T	6	6	213910	213915	0 %	100 %	0 %	0 %	330813214
5594	NC_015380	TTG	2	6	213925	213930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813214
5595	NC_015380	AGA	2	6	213977	213982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813214
5596	NC_015380	A	8	8	213997	214004	100 %	0 %	0 %	0 %	330813214
5597	NC_015380	ATG	2	6	214023	214028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813214
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5601	NC_015380	CAT	2	6	214181	214186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813214
5602	NC_015380	TAA	2	6	214187	214192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813214
5603	NC_015380	ATTAA	2	10	214214	214223	60 %	40 %	0 %	0 %	330813215
5604	NC_015380	TTGC	2	8	214246	214253	0 %	50 %	25 %	25 %	330813215
5605	NC_015380	A	7	7	214299	214305	100 %	0 %	0 %	0 %	330813215
5606	NC_015380	TAT	2	6	214306	214311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813215
5607	NC_015380	T	7	7	214361	214367	0 %	100 %	0 %	0 %	330813215
5608	NC_015380	A	6	6	214411	214416	100 %	0 %	0 %	0 %	330813215
5609	NC_015380	ATC	2	6	214427	214432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813215
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5611	NC_015380	T	6	6	214477	214482	0 %	100 %	0 %	0 %	330813215
5612	NC_015380	CAT	2	6	214483	214488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813215
5613	NC_015380	TTA	2	6	214489	214494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813215
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5617	NC_015380	GTT	3	9	214722	214730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813215
5618	NC_015380	TC	3	6	214748	214753	0 %	50 %	0 %	50 %	330813215
5619	NC_015380	TAT	2	6	214759	214764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813215
5620	NC_015380	CTC	2	6	214771	214776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330813215
5621	NC_015380	AAT	2	6	214785	214790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813215
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5623	NC_015380	A	6	6	214839	214844	100 %	0 %	0 %	0 %	330813215
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5999	NC_015380	TAA	2	6	231008	231013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813229
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